微生物分子生態(tài)學(xué)與生態(tài)基因組學(xué)；人體系統(tǒng)生物學(xué)

　　在國(guó)內(nèi)最早系統(tǒng)開(kāi)展微生物分子生態(tài)學(xué)研究，在復(fù)雜微生物群落結(jié)構(gòu)分析技術(shù)和統(tǒng)計(jì)計(jì)算方法等方面做了很多創(chuàng)新性工作。對(duì)廣泛使用的PCR-DGGE技術(shù)做了重要改進(jìn)，成為國(guó)際上使用該技術(shù)研究微生物生態(tài)學(xué)的先進(jìn)實(shí)驗(yàn)室之一；創(chuàng)新建立了基于隨機(jī)擴(kuò)增指紋圖技術(shù)和分子雜交技術(shù)，分析對(duì)比群落結(jié)構(gòu)，發(fā)現(xiàn)重要功能細(xì)菌基因組片段作為分子標(biāo)記的技術(shù)方法。對(duì)人和動(dòng)物的腸道、處理工業(yè)廢水的生化池、土壤、油藏等環(huán)境中的微生物群落結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系做了大 量的研究工作，取得了有意義的結(jié)果。在PNAS (Proceedings of National Academy of Sciences), NRDD(Nature Review Drug Discovery), AEM (Applied and Environmental Microbiology)、ISME Journal, BMC Bioinformatics, Journal of Proteome Research, Journal of Clinical Microbiology, Microbial Ecology、FEMS Microbiology Ecology、Journal of Microbiological Methods、FEMS Microbiology Letters、《微生物學(xué)報(bào)》、《生態(tài)學(xué)報(bào)》等刊物發(fā)表相關(guān)論文二十余篇，研究工作得到國(guó)際同行的關(guān)注。應(yīng)邀在第八屆細(xì)菌遺傳學(xué)與生態(tài)學(xué)國(guó)際研討會(huì)（法國(guó)里昂）上做keynote報(bào)告，在第十屆國(guó)際微生物生態(tài)大會(huì)環(huán)境生物技術(shù)分會(huì)（墨西哥坎昆）做報(bào)告。在第十一屆國(guó)際微生物生態(tài)大會(huì)人體微生態(tài)分會(huì)（奧地利維也納）做報(bào)告，并聯(lián)合主持“污泥元基因組學(xué)”圓桌討論會(huì)。在2006年8月被選為國(guó)際微生物生態(tài)學(xué)會(huì)12名常務(wù)理事之一。近年來(lái)，積極推動(dòng)系統(tǒng)生物學(xué)理念在微生物生態(tài)學(xué)領(lǐng)域特別是人體腸道菌群研究中的應(yīng)用，注重發(fā)展用代謝組學(xué)和元基因組學(xué)相結(jié)合的方法研究腸道菌群在肥胖、糖尿病等復(fù)雜疾病中的作用，并積極探討用腸道菌群的整體結(jié)構(gòu)變化來(lái)監(jiān)測(cè)人體健康變化、評(píng)價(jià)中醫(yī)藥療效的問(wèn)題，開(kāi)始形成一個(gè)新的以元基因組學(xué)研究為核心的人體系統(tǒng)生物學(xué)新方向。

　　Li M, Wang B, Zhang M, Rantalainen M, Wang S, Zhou H, Zhang Y, Shen J, Pang X, Zhang M, Wei H, Chen Y, Lu H, Zuo J, Su M, Qiu Y, Jia W, Xiao C, Smith LM, Yang S, Holmes E, Tang H, Zhao G, Nicholson JK, Li L, Zhao L.Symbiotic gut microbes modulate human metabolic phenotypes. Proc Natl Acad Sci U S A., 105(6):2117-22., 2008

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　　上海系統(tǒng)生物醫(yī)學(xué)研究中心副主任

　　上海交通大學(xué)生命科學(xué)技術(shù)學(xué)院副院長(zhǎng)

　　國(guó)際微生物生態(tài)學(xué)會(huì)（ISME）常務(wù)理事

　　Systematic and Applied Microbiology 編委

　　上世紀(jì)90年代微生物分子生態(tài)學(xué)逐漸確立了它作為微生物學(xué)一個(gè)分支的地位。它是從基因組的水平上來(lái)解析微生物群落結(jié)構(gòu)與功能的學(xué)科。因?yàn)樗�突破了很多微生物尚不能被分離培養(yǎng)的技術(shù)限制，使我們能夠?qū)Νh(huán)境微生物群落中微生物的種類(lèi)、豐度和分布以及功能進(jìn)行分析，所以顯著加深了我們對(duì)于各種不同環(huán)境中微生態(tài)學(xué)規(guī)律的研究和了解。

　　1997年以來(lái)，趙立平教授課題組率先在國(guó)內(nèi)將分子生態(tài)學(xué)理念和方法系統(tǒng)地引入到環(huán)境微生物的研究中，并逐步開(kāi)拓到人體健康等領(lǐng)域，開(kāi)創(chuàng)了新的研究方向，帶動(dòng)了微生物分子生態(tài)學(xué)的發(fā)展，研究論文漸次發(fā)表在國(guó)際主流刊物上，得到國(guó)際學(xué)術(shù)界的關(guān)注和認(rèn)同，趙立平教授于2006年被選舉為國(guó)際微生物生態(tài)學(xué)學(xué)會(huì)（ISME）12名常務(wù)理事之一。

　　不僅建立了DNA指紋圖、克隆文庫(kù)組成分析、FISH、實(shí)時(shí)定量PCR和生物信息學(xué)等國(guó)際上常用的微生物分子生態(tài)學(xué)技術(shù)體系，而且還進(jìn)行了多項(xiàng)創(chuàng)新。最先將ERIC－PCR技術(shù)引入環(huán)境微生物群落結(jié)構(gòu)的分析，創(chuàng)建了通過(guò)ERIC-PCR與DNA雜交相結(jié)合來(lái)比較群落結(jié)構(gòu)相似性，并分離克隆某類(lèi)群落特有的微生物的基因組片段的方法；創(chuàng)立了一套有效的去除單鏈DNA污染的方法，使PCR－DGGE條帶序列測(cè)定的可靠性大大提高；2004年與華東師范大學(xué)合作共同舉辦了首屆微生物分子生態(tài)學(xué)學(xué)習(xí)班，在上海交通大學(xué)進(jìn)行了分子生態(tài)學(xué)實(shí)驗(yàn)技術(shù)的培訓(xùn)，來(lái)自全國(guó)各地的約30位學(xué)員參加了培訓(xùn)，對(duì)推動(dòng)分子生態(tài)學(xué)技術(shù)的應(yīng)用產(chǎn)生了積極的作用。

　　基于代謝物和腸道菌全譜分子分析的人體系統(tǒng)生物學(xué)研究：

　　對(duì)一個(gè)四世同堂的中國(guó)家庭7位成員的腸道微生物組成和人體代謝特征進(jìn)行了詳細(xì)分析，鑒定出腸道內(nèi)參與了人體代謝過(guò)程的一些重要的細(xì)菌。利用基于核磁共振的代謝組技術(shù)分析志愿者尿液中代謝物的組成，用以反映人體的整體代謝狀況。通過(guò)比 較志愿者腸道菌群組成變化與他們的代謝特性變化的關(guān)系，初步發(fā)現(xiàn)了腸道內(nèi)某些特定細(xì)菌與人體尿液中的某些代謝物呈顯著的相關(guān)關(guān)系，提示這些腸道細(xì)菌對(duì)人體 健康特別重要。例如，我們發(fā)現(xiàn)人體腸道內(nèi)共有的一種“友好”細(xì)菌——屬于厚壁菌門(mén)（Firmicutes）梭菌科（Clostridiaceae）的 Faecalibacterium prausnitzii與8種人體的代謝物質(zhì)有統(tǒng)計(jì)相關(guān)性；提示這種細(xì)菌在參與宿主多種代謝過(guò)程中有著很重要的作用。這種將微生物基因組技術(shù)與代謝組技術(shù)相結(jié)合，通過(guò)分析人體的代謝譜來(lái)解析腸道菌群組成和功能的新的研究體系，能夠更準(zhǔn)確地刻畫(huà)出細(xì)菌與宿主代謝之間互作關(guān)系的藍(lán)圖，使人們有可能利用這些代謝信息確定一個(gè)人腸道微生物的組成和功能；這項(xiàng)新的研究成果，為將來(lái)充分認(rèn)識(shí)不同的腸道細(xì)菌如何影響機(jī)體代謝過(guò)程，譬如如何將食物轉(zhuǎn)化成能量、如何維持細(xì)胞存活等等問(wèn)題邁進(jìn)了一大步。反之，也可以利用腸道菌群結(jié)構(gòu)的分子標(biāo)記，診斷人類(lèi)代謝是否正�；蚱�差的程度，進(jìn)而以這些特定的腸道細(xì)菌為靶點(diǎn)，通過(guò)改變它們與宿主之間的相互作用來(lái)開(kāi)發(fā)治療疾病的新方法。該研究成果發(fā)表在國(guó)際權(quán)威學(xué)術(shù)雜志《美國(guó)國(guó)家科學(xué)院院刊》（PNAS）上。 2008年3月5日《Nature CHINA》在研究亮點(diǎn)中對(duì)該文給予了報(bào)道。

　　輪狀病毒感染是嬰幼兒秋冬季腹瀉的主要原因。我們比較了輪狀病毒感染兒童與健康兒童兩組個(gè)體腸道菌群組成，發(fā)現(xiàn)患病組和健康組兒童腸道菌群在多樣性和菌種組成上有顯著差異。輪狀病毒感染個(gè)體腸道內(nèi)擬桿菌與健康個(gè)體相比平均下降了2個(gè)數(shù)量級(jí)。在輪狀病毒感染個(gè)體腸道內(nèi)，Bacteroides vulgatus 、Bacteroides stercoris兩類(lèi)菌的數(shù)量有減少的趨勢(shì)，而B(niǎo)acteroides fragilis則有上升的趨勢(shì)，這3種OTU代表的序列有望發(fā)展成為一種區(qū)分個(gè)體腸道菌群健康狀態(tài)的分子標(biāo)記物。

　　潰瘍性結(jié)腸炎 (Ulcerative Colitis,UC)是一種病因未知的急性或者慢性的炎癥性大腸炎，近年來(lái)該病的發(fā)病率在我國(guó)呈現(xiàn)上升趨勢(shì)。腸道微生物被認(rèn)為與該病的發(fā)生和惡化有密切的關(guān)系，我們分析了潰瘍性結(jié)腸炎患者腸道內(nèi)粘膜黏附菌的結(jié)構(gòu)組成。結(jié)果表明潰瘍部位和健康部位的優(yōu)勢(shì)菌雖然總體組成差別不大，但柔嫩梭菌和乳酸菌的組成存在著很大的差異，顯示柔嫩梭菌和乳酸菌的組成變化情況與潰瘍性結(jié)腸炎有很密切的關(guān)系。不同的患病部位腸道菌的分析結(jié)果顯示，無(wú)論是結(jié)腸型潰瘍還是直腸型潰瘍，乳酸菌在潰瘍部位和健康部位的組成都有很大差異，而柔嫩梭菌僅在直腸型潰瘍中有差異。

　　我們對(duì)大熊貓的腸道菌群分析顯示3例大熊貓個(gè)體腸道微生物共有一種優(yōu)勢(shì)菌，即大腸桿菌（E.coli）。在1例大熊貓的腸道菌群16S rDNA文庫(kù)中有一類(lèi)占有絕對(duì)優(yōu)勢(shì)的細(xì)菌（76%）為梭狀芽孢桿菌（Clostridium）。與其它動(dòng)物的腸道結(jié)構(gòu)相比較，大熊貓腸道菌群既不同于食肉動(dòng)物也不同于食草動(dòng)物的菌群結(jié)構(gòu)，這一點(diǎn)可能解釋了大熊貓對(duì)高纖維含量的竹子利用率低的原因。

　　以人為對(duì)象直接研究腸道菌群與宿主的相互作用存在很多不便，如難以標(biāo)準(zhǔn)化待測(cè)試人群的遺傳和環(huán)境背景、采樣困難以及若進(jìn)行毒性及致癌性等方面的研究，還存在潛在的倫理問(wèn)題等。目前常用人源菌群（Human Flora-associated，HFA）小鼠/大鼠模型來(lái)研究人的腸道生態(tài)、營(yíng)養(yǎng)和代謝。但由于嚙齒類(lèi)動(dòng)物與人在腸道生理方面的顯著差異，由HFA小鼠/大鼠模型得到的研究結(jié)果與人的相關(guān)性越來(lái)越多地受到置疑。我們建立了構(gòu)建HFA仔豬的方法，并對(duì)其腸道菌群的組成進(jìn)行了分子分析。對(duì)HFA仔豬腸道菌群的分析，我們采用了ERIC-PCR指紋圖譜結(jié)合群落DNA雜交技術(shù)以及對(duì)腸道中最重要的兩大類(lèi)細(xì)菌-雙岐桿菌和擬桿菌進(jìn)行TGGE組成分析等一套分子微生物生態(tài)學(xué)方法，證實(shí)該仔豬胃腸道中成功定植了供體人的雙岐桿菌和擬桿菌，DNA指紋圖譜的比較也顯示HFA仔豬腸道菌群的指紋圖譜與供體人同源性高，而與普通仔豬差異顯著�？梢灶A(yù)見(jiàn)，該模型在研究人的腸道生態(tài)、營(yíng)養(yǎng)以及代謝等方面有顯著意義，在功能性食品和新藥的評(píng)價(jià)以及腸道微生態(tài)相關(guān)機(jī)理的研究方面也是一個(gè)合理而有效的模型體系。

　　以焦化工業(yè)廢水的微生物處理系統(tǒng)為對(duì)象，研究了不同工藝條件下，微生物的群落結(jié)構(gòu)與污染物降解、COD去除等處理功能的關(guān)系。通過(guò)微生物元基因組學(xué)技術(shù)分析解析微生物的群落結(jié)構(gòu)，可以使我們了解不同的操作條件下，微生物的群落結(jié)構(gòu)的變化與群落功能的變化及其關(guān)系，為我們認(rèn)識(shí)廢水處理系統(tǒng)功能的機(jī)制奠定了基礎(chǔ)。如Thauera屬細(xì)菌是一種重要的反硝化降解菌，但屬內(nèi)各種群的降解能力的差異使我們很難在屬水平上分析降解功能的變化，我們首次建立了Thauera屬專(zhuān)一性的PCR-DGGE方法，可將Thauera屬內(nèi)大多數(shù)種進(jìn)行區(qū)分，可用于快速分析復(fù)雜群落內(nèi)Thauera屬的種群組成與數(shù)量變化。通過(guò)對(duì)比種子污泥和厭氧、反硝化兩個(gè)反應(yīng)器中的微生物區(qū)系的組成變化與功能狀態(tài)的變化，找出群落中與降解喹啉等特定的功能密切相關(guān)的種群。還研究了從處理焦化工業(yè)廢水的活性污泥分離的苯酚降解細(xì)菌的苯酚羥化酶大亞基基因（LmPH），首先發(fā)現(xiàn)并報(bào)道了苯酚降解基因高度的微多樣性。與系統(tǒng)功能相關(guān)的微生物種群可以作為“指示微生物”用于系統(tǒng)的功能和狀態(tài)的監(jiān)控。通過(guò)在一套實(shí)驗(yàn)?zāi)�擬廢水處理裝置的回流和不回流兩種操作條件下，對(duì)指紋圖譜與廢水處理功能的變化進(jìn)行分析，發(fā)現(xiàn)一些與群落功能相關(guān)的基因組片段，這些基因組片段可作為功能相關(guān)種群的物理標(biāo)記具有對(duì)系統(tǒng)運(yùn)行狀態(tài)進(jìn)行監(jiān)測(cè)的潛力。

　　我們將群落空間演替的系統(tǒng)軌跡分析應(yīng)用于一個(gè)故障工業(yè)廢水處理系統(tǒng)的分子診斷與修復(fù)之中，建立了對(duì)系統(tǒng)群落空間演替進(jìn)行軌跡分析的分子方法。通過(guò)把回流條件下的實(shí)驗(yàn)室裝置以及該工業(yè)裝置分別作為參比系統(tǒng)和未知故障系統(tǒng)，對(duì)它們?nèi)郝淇臻g演替系統(tǒng)軌跡的分析比較，發(fā)現(xiàn)工業(yè)裝置的故障原因在于生物膜沒(méi)有得到充分的供氧。這一推斷為后來(lái)的其它分析和隨后的裝置的成功改造所證實(shí)。表明群落時(shí)空演替的系統(tǒng)軌跡分析是研究操作條件對(duì)系統(tǒng)群落結(jié)構(gòu)影響的良好工具，對(duì)群落結(jié)構(gòu)的優(yōu)化有著重要的指導(dǎo)意義，為今后進(jìn)一步的監(jiān)控廢水處理的過(guò)程提出了理論指導(dǎo)。該研究及其方法在工業(yè)領(lǐng)域的成功應(yīng)用為分子生態(tài)學(xué)與環(huán)境技術(shù)的銜接提供了一個(gè)成功的實(shí)例，受到國(guó)際同行的高度評(píng)價(jià)。 2004年以來(lái)，還積極將分子微生物生態(tài)學(xué)方法推廣到油藏環(huán)境中微生物群落組成、驅(qū)油過(guò)程中微生物群落結(jié)構(gòu)的變化的研究中。分別對(duì)大港油田、勝利油田和新疆克拉瑪依油田的微生物增油作業(yè)的油井的微生物群落進(jìn)行了分析研究。

　　趙立平教授課題組建立了廣泛的國(guó)際合作，與美國(guó)、新加坡、德國(guó)、法國(guó)、挪威等國(guó)的知名學(xué)者建立了穩(wěn)定的合作關(guān)系和經(jīng)常的互訪和交流，聯(lián)合培養(yǎng)多名博士生。先后派出優(yōu)秀博士生前往瑞士、挪威、加拿大等國(guó)進(jìn)行為期約1年的合作科研。還和德國(guó)實(shí)驗(yàn)室開(kāi)展"Systems biology and biosystems engineering"研究網(wǎng)絡(luò)的研究生交流，派遣博士生前往德國(guó)進(jìn)行為期3個(gè)月的短期交流。2006和2007年我們也先后接收來(lái)自德國(guó)斯圖加特大學(xué)和荷蘭Groningen大學(xué)的研究生來(lái)實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行6～8個(gè)月的合作科研。

　　2005年實(shí)驗(yàn)室還成功地承辦了“第二屆國(guó)際環(huán)境微生物基因組學(xué)會(huì)議SCOPE MicroEnGen II”, 共有30多位來(lái)自歐美等國(guó)的環(huán)境微生物基因組學(xué)領(lǐng)域的專(zhuān)家參加會(huì)議，會(huì)議促進(jìn)了環(huán)境微生物基因組和分子生態(tài)學(xué)領(lǐng)域的中外交流，產(chǎn)生了良好的反響。

　　2005年還承辦了“首屆國(guó)際生物經(jīng)濟(jì)高層論壇－環(huán)境生物技術(shù)分會(huì)”，該會(huì)議也是環(huán)境微生物領(lǐng)域的一次盛會(huì)，來(lái)自國(guó)內(nèi)外的共約60名專(zhuān)家參加了大會(huì)。

　　2007年12月舉辦了國(guó)際微生物生態(tài)學(xué)會(huì)(ISME)與中國(guó)微生物學(xué)會(huì)（CSM）微生物分子生態(tài)學(xué)技術(shù)亞洲地區(qū)講習(xí)班。參加此次講習(xí)班的學(xué)員共41人，他們分別來(lái)自北京、上海、南京、天津、新疆、海南、湖北、浙江、山西、河北、江蘇、四川、山東、福建、廣西等省市自治區(qū)，包括南開(kāi)大學(xué)、四川大學(xué)、山東大學(xué)等14個(gè)高等學(xué)校與中科院湖泊所、中科院海洋所等10個(gè)科研院所的單位。

　　本團(tuán)隊(duì)還承擔(dān)著多門(mén)課程教學(xué)任務(wù)，如本科生課程《微生物學(xué)》、《分子生物學(xué)》、《基因工程進(jìn)展》；研究生課程：《微生物分子生態(tài)學(xué)》、《生態(tài)基因組學(xué)》、《應(yīng)用微生物學(xué)進(jìn)展》。我們每年還接收一批本科生完成畢業(yè)論文工作和大學(xué)生科學(xué)實(shí)踐PRP項(xiàng)目。

　　由趙立平教授主講的《微生物學(xué)（C類(lèi)）》雙語(yǔ)教學(xué)課程面向生物學(xué)相關(guān)專(zhuān)業(yè)學(xué)生傳授微生物學(xué)的基本概念、知識(shí)及有關(guān)實(shí)驗(yàn)技能，該課程采用國(guó)際最新教材，英文授課，積極研究教學(xué)規(guī)律，課堂教學(xué)效果顯著，2008年被評(píng)為上海交通大學(xué)精品課程。 趙立平教授曾參加在美國(guó)鹽湖城召開(kāi)的"第九屆本科微生物學(xué)教學(xué)國(guó)際研討會(huì)"，并在會(huì)上交流論文。他在國(guó)內(nèi)首家為研究生開(kāi)設(shè)"微生物分子生態(tài)學(xué)"，"微生物生態(tài)基因組學(xué)"等課程。

　　慢性病的腸源性學(xué)說(shuō)

　　諾貝爾獎(jiǎng)得主里德伯格（Lederberg）提出“人是與共生微生物構(gòu)成的超級(jí)生物(superorganism)”，人基因組和微生物組共同作用影響人體的免疫、營(yíng)養(yǎng)和代謝過(guò)程。

　　從細(xì)胞的角度看，人體不僅僅是一個(gè)人的細(xì)胞構(gòu)成的軀體，它是一個(gè)由人的細(xì)胞和共生微生物細(xì)胞共同構(gòu)成的復(fù)雜系統(tǒng)。從基因的角度看，人體內(nèi)有兩個(gè)“基因組”：一個(gè)是從父母那里遺傳來(lái)的人基因組，編碼大約25,000個(gè)基因，叫做“第一基因組”；另一個(gè)則是人體內(nèi)多達(dá)1000多種共生微生物的遺傳信息的總和，叫“微生物組”，也可稱(chēng)為“元基因組”，它們所編碼的基因有100萬(wàn)以上。第二基因組的基因容量是第一基因組的至少100倍，可見(jiàn)其對(duì)人體健康的作用和影響是不可忽視的。

　　在人體中，人的細(xì)胞數(shù)量?jī)H占細(xì)胞總量的10%，而共生微生物的細(xì)胞所占比例高達(dá)90%。共生細(xì)菌大部分生活在腸道里，有大約1.5千克。這些細(xì)菌在生長(zhǎng)活動(dòng)中產(chǎn)生的代謝物可以進(jìn)入人的血液，影響人的健康。有益菌可以產(chǎn)生消炎、鎮(zhèn)痛、抗氧化的物質(zhì)，還可以合成維生素、氨基酸、丁酸鹽等營(yíng)養(yǎng)成份，對(duì)人體有滋養(yǎng)和保護(hù)作用。有害菌則可以產(chǎn)生神經(jīng)毒素、致癌物質(zhì)和游離抗原，進(jìn)入血液后能夠引起兒童自閉癥、老年癡呆、肥胖癥、糖尿病、冠心病、甚至癌癥等各種慢性病。腸道菌群具有至少1000多種細(xì)菌，攜帶著大量的基因。這就意味著，人體內(nèi)其實(shí)有兩個(gè)基因組在影響人的健康，一個(gè)是先天遺傳來(lái)的人的基因組，帶有約2萬(wàn)多個(gè)基因，另一個(gè)是后天進(jìn)入人體但終身與人相伴的所有共生微生物構(gòu)成的“微生物組”，帶有至少上百萬(wàn)個(gè)基因，相當(dāng)于人的第二個(gè)基因組。引

　　結(jié)構(gòu)失調(diào)的腸道菌群可能是誘發(fā)慢性病的重要因素，這個(gè)觀點(diǎn)叫“慢性病的腸源性學(xué)說(shuō)”，該學(xué)說(shuō)由趙立平教授在2010年正式提出。趙教授研究組的工作表明，飲食是影響腸道菌群組成的最重要因素，不同的飲食結(jié)構(gòu)，可以形成不同的菌群結(jié)構(gòu)。長(zhǎng)期食用高脂肪、低纖維的食物，可以造成腸道菌群結(jié)構(gòu)失調(diào)，增加進(jìn)入血液的毒素的量，誘發(fā)慢性炎癥，從而導(dǎo)致肥胖、糖尿病、冠心病等慢性病的發(fā)生。慢性病的腸源性學(xué)說(shuō)以《Whole-body systems approaches for gut microbiota-targeted,preventive healthcare》為名發(fā)表在Journal of Biotechnology和《國(guó)際微生物生態(tài)學(xué)會(huì)會(huì)刊》(The ISME Journal)上。