基本情況
個人簡歷
1995.9-1999.7: 華南農(nóng)業(yè)大學 畜牧 學士
1999.9-2002.7:華南農(nóng)業(yè)大學 動物遺傳育種 碩士
2002.9-2005.7:華南農(nóng)業(yè)大學 動物遺傳育種 博士
2003.8-2003.10: 華中農(nóng)業(yè)大學動物遺傳國家重點實驗室學習基因組相關技術
2006.1-2009.8 華南理工大學 講師
2006.5-2006.8 中國醫(yī)學科學院生物技術研究所進修
2009.9-至今 華南理工大學 副教授
主授課程
主講《 生物化學》、《 分子生物學》、《 系統(tǒng)生物學》等課程。
主要科研方向與興趣
科研方向
博士期間利用比較基因組學將21個功能基因定位在豬繁殖性狀的 QTL區(qū)間。2006年1月至2009年8月,主要從事 工業(yè)酶理性設計和改造研究,通過蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)生物信息全理性設計將 木糖還原酶依賴的輔酶從 NADP改成 NAD。2009年9月定職為華南理工大學副教授,主要從事 食蟹猴 功能基因組學和生物信息學的研究。參與了華南新藥創(chuàng)制中心、華大、華南理工大學等單位合作的食蟹猴和中國 恒河猴基因組項目,并以重要作者身份在《Nature Biotechnology》發(fā)表論文。繼食蟹猴基因組項目完成之后,與國際幾乎同步開展利用人外顯子芯片測食蟹猴外顯子組的研究。
研究興趣
(1)食蟹猴功能基因組和疾病模型相關的研究;(2)利用交叉學科的思維和生物信息學的方法研究熱點、難點生物學(或生物醫(yī)學)問題的分子機理。
主要科研項目與論文
主持項目:
1. 廣東省自然科學基金:木糖還原酶和 木糖醇脫氫酶定向分子進化研究(2006.10-2009.10)
2. 國家“ 863”項目:藥物代謝酶 SNPs與藥物的類藥性一體化預測軟件的研究與開發(fā)(2008.1-2011.12)
3. 華南理工大學中央高;究蒲袠I(yè)務面上項目:雞輸卵管組織特異性啟動子分離鑒定(2010.1-2011.12)
4. 廣東省科技計劃項目:食蟹猴免疫和疾病相關 基因庫及MHC等位基因信息庫的建立(2010.10-2012.10)
5. 華南理工大學中央高;究蒲袠I(yè)務費重點項目:食蟹猴2型糖尿病模型構(gòu)建的遺傳標記研究(2011.01-2012.12)
6. 十二五重大專項:人類重大疾病靈長類動物模型資源平臺的建設(2011-2013)
發(fā)表論文:
1. Li Y, Zheng H, Luo R, Wu H, Zhu H, Li R, Cao H, Wu B, Huang S, Shao H, Ma H,Zhang F, Feng S, Zhang W, Du H, Tian G, Li J, Zhang X, Li S, Bolund L,Kristiansen K, de Smith AJ, Blakemore AI, Coin LJ, Yang H, Wang J, Wang J. Structural variation in two human genomes mapped at single-nucleotide resolution by whole genome de novo assembly. Nature Biotechnology. 2011,29(8):723-730(SCI IF=31.1)
2. Yan G, Zhang G, Fang X, Zhang Y, Li C, Ling F, Cooper DN, Li Q, Li Y, van Gool AJ, Du H, Chen J, Chen R, Zhang P, Huang Z, Thompson JR, Meng Y, Bai Y, Wang J, Zhuo M, Wang T, Huang Y, Wei L, Li J, Wang Z, Hu H, Yang P, Le L, Stenson PD, Li B, Liu X, Ball EV, An N, Huang Q, Zhang Y, Fan W, Zhang X, Li Y, Wang W, Katze MG, Su B, Nielsen R, Yang H, Wang J, Wang X, Wang J. Genome sequencing and comparison of two nonhuman primate animal models, the cynomolgus and Chinese rhesus macaques. Nature Biotechnology. 2011, 29(11):1019-23. (SCI IF=31.1)
3. Du H, Hu H, Meng Y, Zheng W, Ling F, Wang J, Zhang X, Nie Q, Wang X. The correlation coefficient of GC content of the genome-wide genes is positively correlated with animal evolutionary relationships. FEBS Letter. 2010, 584(18):3990-4(SCI IF=3.5)
4. Du HL, Chen J, Cui JX, Wang XN and Zhang XQ. Polymorphisms on SSC15q21-q26 containing QTL for reproduction in swine and its association with litter size. Genetics and Molecular Biology, 2009, 32(1):69-74(SCI)
5. Du HL, Chen J, Zhang YS, Zhang XQ. Molecular cloning, mapping, and polymorphism of the porcine SCG2 gene. Biochem Genet, 2008, 46 (3): 369-379.(SCI)
6. Du HL, Chen J, Cui JX, Zhang YS, Yerle M, Milan D, Zhang XQ. Radiation hybrid mapping and sequence analysis of 21 genes on porcine chromosome 15. Anim Genet, 2006, 37(2):181-183.(SCI IF=2.6)
7. Zeng QK, Du HL(并列第一), Wang JF, Wei DQ, Wang XN, Li YX, Lin Y. Reversal of Coenzyme Specificity and Improvement of Catalytic Efficiency of Pichia Stipitis Xylose Reductase by the Rational Site-directed Mutagenesis. Biotechnol Lett. 2009, 31(7):1025-9(SCI)
8. Fang M, Du H, Hu Y, Zhou X, Ouyang H, Zhang W, Jia X, Li J, Wang Y, Nie Q, Zhang X. Identification and Characterization of the Pig ABIN-1 Gene and Investigation of its Association with Reproduction Traits. J Genetic. 2011, 90(1):e10-20
9. Zhang YS, Du HL, Chen J, Yang GF, Zhang XQ. Porcine growth differentiation factor 9 gene polymorphisms and their associations with litter size. J Genet Genomics, 2008, 35 (3): 163-169.(SCI)
10. Cui JX, Du HL, Liang Y, Deng XM, Li N, Zhang XQ. Association of Polymorphisms in the Promoter Region of Chicken Prolactin with Egg Production.Poultry science. 2006, 85(1):26-31.(SCI Impact Factor=2.1)
11. Zhen FS, Du HL, Xu HP, Luo QB, Zhang XQ. Tissue and allelic-specific expression of hsp70 gene in chickens: basal and heat-stress-induced mRNA level quantified with real-time reverse transcriptase polymerase chain reaction. British Poultry science. 2006, 47(4):449-455.(SCI Impact Factor=1.3)
12. Wang JF, Wei DQ, Lin Y, Wang YH, Du HL, Li YX, Chou KC. Insights from modeling the 3D structure of NAD(P)H-dependent d-xylose reductase of Pichia stipitis and its binding interactions with NAD and NADP. Biochem Bioph Res Co. 2007, 359(2):323-329.(SCI Impact Factor=3.0)
13. Ling F, Li J, Chen Y, Du H, Mei Y, Mo D, Wang C. Cloning and characterization of the 5’-flanking region of the pig adiponectin gene. Biochem Biophys Res Commun, 2009, 381(2):236-240(SCI IF=2.8)
14. Jin X, He M, Meng Y, Sun F, Du H, Wang J, Wang X. Sequencing of Cynomolgus/crab-eating monkey and Chimpanzee reveals successfully use of human based exome chip in non-human primates. PLoS ONE. Submitted, 通訊作者
15. 杜紅麗,王靖方,曾琦鍇, 凌飛,魏冬青,林影,王小寧.木糖還原酶定點突變設計的生物信息學分析.華南理工大學學報(自然科學版), 2008, 36(12):122-127.
16. 杜紅麗,陳靜,張玉山,崔建勛,張細權(quán). 二花臉與 杜洛克繁殖相關基因表達差異分析.華南農(nóng)業(yè)大學學報, 2008, 29(2):99-103
17. 杜紅麗,崔建勛,張細權(quán).利用DNA池和測序技術快速篩查候選效應單倍型.農(nóng)業(yè)生物技術學報, 2008, 16(2):281-285
18. 曾琦鍇,林影,翟志臣,林小瓊, 杜紅麗.木糖還原酶Lysine270突變的理性設計.華南理工大學學報(自然科學版), 2009,37(6):79-83(通訊作者)
19. 鄭維豪, 杜紅麗,林志強,閃瑩,王小寧. 豬 肺泡巨噬細胞感染PRRSV進程中差異表達基因及基因功能富集分析.基因組學與應用生物學, 2010, 1039-1046 (通訊作者)
20. 鄭維豪,林志強,卓敏,杜紅麗,王小寧.抗流感病毒小RNAs研究進展. 遺傳, 接收(通訊作者)