蔡毓通出生在一個貧苦農民家庭，少年時期聰明、機智、勇敢、善于思考，受當地抗日武裝的影響，積極投身革命隊伍，曾擔任榮成地區(qū)共產黨地下交通聯(lián)絡員。

1946年7月，年僅15歲的蔡毓通懷著一顆翻身求解放的報國之心，只身一人到榮成縣城參加了地方武裝成山區(qū)中隊，同年12月被分配到榮成警衛(wèi)營三連任副班長、班長。1947年9月，蔡毓通被選送膠東軍區(qū)東海軍分區(qū)整訓團學習，畢業(yè)后任膠東軍區(qū)新六師騎兵排副排長。1949年1月，膠東軍區(qū)新六師組建機炮連，蔡毓通任該連一排長。在此期間,他參加了青集戰(zhàn)役中的宋花泉、單山嶺、蝎子山等戰(zhàn)斗。戰(zhàn)斗中，為了掩護步兵沖鋒，他帶領全排同志，不怕犧牲，最大限度的靠近敵軍陣地，穩(wěn)、準、狠地壓制了敵軍火力，減少了步兵的傷亡，出色地完成了火力掩護任務，受到了表彰。此后，蔡毓通參加了渡江戰(zhàn)役和進軍福建等戰(zhàn)斗。

1949年8月，蔡毓通調第32軍94師218團1營2連任排長。1950年11月該軍被改編為志愿軍第27軍94師218團2營5連，并入朝參戰(zhàn)。1952年8月，蔡毓通調志愿軍第27軍特務團1營2連任排長。1953年7月，蔡毓通調該軍80師師部任參謀。1954年，他被選送高級通信學校學習，畢業(yè)后任該師通信處訓練參謀。1959年1月，蔡毓通調酒泉衛(wèi)星發(fā)射中心通信站司令部任參謀。1962年1月，蔡毓通任該中心通信站副主任、主任，1965年8月任該站副參謀長、參謀長。1968年2月，他任酒泉衛(wèi)星發(fā)射中心湘西測控站司令部參謀長、副站長。1970年至1979年，他任該中心喀什測控站副站長，站長，并被國防科工委授予學雷鋒先進個人標兵，被中心黨委授予學雷鋒先進干部。他參與組建了西安衛(wèi)星測控中心。1979年，蔡毓通任西安衛(wèi)星測控中心后勤部部長，期間他經常深入基層第一線，與官兵同吃同住，通過調查研究，解決基層的實際問題和困難，為中心的后勤建設作出了重要貢獻。1983年，蔡毓通任西安衛(wèi)星測控中心副主任，他負責后勤保障和行政管理工作，期間他襟懷坦蕩、為人忠厚、作風樸實；工作中他始終堅持原則、嚴于律己、寬以待人、關心群眾疾苦，為中心的后勤保障和行政管理的正規(guī)化建設做出了突出貢獻。1991年，蔡毓通被授予勝利功勛榮譽勛章。同年7月，蔡毓通離職休養(yǎng)。

1996年10月31日，蔡毓通因病醫(yī)治無效在西安逝世，享年65歲。

蔡毓通1988年被授予少將軍銜，曾榮獲 淮海戰(zhàn)役、 渡江戰(zhàn)役紀念章，1991年7月被授予解放勛章。