2000年7月進(jìn)根寶足球基地。

2004年1月亞足聯(lián)U-14少年足球錦標(biāo)賽（東亞賽區(qū)）獲冠軍的主力隊員，在奪冠關(guān)鍵戰(zhàn)與日本隊的比賽中攻入寶貴一球。

曾入選國家少年隊。

2007年中國足球乙級聯(lián)賽奪冠并成功打入中國足球甲級聯(lián)賽的主力隊員。

2009年8月1日代表上海參加全國第十一屆全運會足球男子甲組奪得冠軍的主力隊員。

2014年2月19日加盟中超豪門北京國安，他將身披2號球衣出現(xiàn)在中超聯(lián)賽的賽場上。

國安與李運秋簽訂為期5年的合同。合同確定的轉(zhuǎn)會費為700萬人民幣，考慮到李運秋是一個90后的球員，且已經(jīng)在上海東亞這樣的中超球隊打上了主力，以及中超內(nèi)援市場的價錢水平，國安可以說是做了一筆好買賣。

國安以最快速度為他完成注冊，并在18日的亞冠最終報名時間將他放入亞冠名單。

然而李運秋運氣不太好，在完成轉(zhuǎn)會時因為簽證原因剛好錯過第一場亞冠，他只能和其他沒進(jìn)入亞冠名單的球員一起留在上海世紀(jì)公園球場訓(xùn)練，等國安打完亞冠從日本廣島回來，主教練曼薩諾開始考察這批新隊員時，剛練了兩天，李運秋就嚴(yán)重受傷。

自從加盟國安后，李運秋一直有點背。先是在上海集訓(xùn)的時候意外受傷，然后就歇了近兩個月。不想在剛剛傷愈復(fù)出訓(xùn)練之后，又意外受傷，結(jié)果就一直傷到了間歇期前。這次終于身體沒有了問題，但一次防守失誤不僅被裁判員判罰了點球，更被紅牌罰下，讓國安的人數(shù)與比分都處于劣勢。

離場之后，李運秋一直在緊張地觀看著比賽，直到比賽結(jié)束時，小伙子終于松了一口氣。回到休息室，李運秋向每一名隊友連聲說“感謝”，謝謝大家用拼搏與努力彌補(bǔ)了自己的失誤，或許是為了保護(hù)李運秋，國安教練組沒有讓李運秋接受媒體采訪。

“來國安的首秀因為自己的手球紅牌導(dǎo)致球隊沒拿下比賽。對不起。謝謝大家不惜體力拼搏，不放棄的精神沒有輸?shù)舯荣悺Ｖx謝大家的鼓勵，自己會調(diào)整好心態(tài)，更加努力來回報大家�！辟惡罄钸\秋在自己的微博中寫道。

2016年2月25日，北京國安官方宣布李運秋轉(zhuǎn)會至上海申花足球俱樂部，隨后，上海申花也宣布李運秋加盟，以下為北京國安官方公告：

北京國安足球俱樂部與上海綠地申花足球俱樂部就球員李運秋轉(zhuǎn)會一事達(dá)成協(xié)議，雙方已簽署轉(zhuǎn)會協(xié)議，球員李運秋正式加盟上海綠地申

花。我們感謝李運秋在效力北京國安隊期間展現(xiàn)的職業(yè)精神和為球隊做出的貢獻(xiàn)，祝他在職業(yè)生涯的新階段好運。

2017年11月19日，上海申花俱樂部官方宣布與曹赟定完成續(xù)約，合同期為5年至2022年底。