（1）東北三省大型科學(xué)儀器協(xié)作共享網(wǎng) 吉林省科技廳 2007-8-1--2008-12-28 30.000萬元

（2）吉林省科技項目網(wǎng)上評審專家系統(tǒng)研究 吉林省科技廳 2007-1-1--2008-6-28 15.000萬元

（3）復(fù)雜自然場景圖像的拼接技術(shù)研究 校內(nèi)自然科學(xué)青年基金 2007-1-1--2008-12-28 2.500萬元

（4）基于本體的主題爬行建模與方法研究 校內(nèi)自然科學(xué)青年基金 2006-1-1--2007-12-28 2.000萬元

（5）基于計算智能的微生物基因組功能注釋算法研究 校內(nèi)自然科學(xué)青年基金 2006-1-1--2007-12-28 2.000萬元

（6）一種新型數(shù)字水印架構(gòu)的研究 校內(nèi)自然科學(xué)青年基金 2006-1-1--2007-12-28 2.500萬元

（7）應(yīng)對規(guī)劃研究 國家自然科學(xué)基金委員會 國家自然科學(xué)基金委員會 2005-1-1——2007-12-18 22.000萬元

（8）吉林麥達斯鋁業(yè)軟件開發(fā) 吉林麥達斯鋁業(yè)有限公司 吉林麥達斯鋁業(yè)有限公司 2004-4-25——2006-10-25 10.000萬元

（9）關(guān)于進化算法運行機理分析與應(yīng)用的研究 教育部 2002-1-1——2004-12-28 7.000萬元

（1）馬志強 崔穎 馬雅楠 陸林英 基因非編碼區(qū)與轉(zhuǎn)錄調(diào)控元件的識別研究 生物信息學(xué) 2008-12-1

（2）張靖波 李萌 呂英華 馬志強* 一種在圖像和視頻幀中檢測文本的新方法 東北師大學(xué)報.自然科學(xué)版 2008-9-20

（3）馬志強 孫平平 馬雅楠 魏雅卓 改進的K-mean聚類算法在基因系統(tǒng)發(fā)育譜分析中的應(yīng)用 生物信息學(xué) 2008-6-1

（4）歐陽玉梅 方若森 馬志強* 評估蛋白質(zhì)相互作用可信度的生物信息學(xué)方法 生命科學(xué) 2008-6-1

（5）馬雅楠 孫平平 孫遠平 馬志強* Research of Improved Phylogenetic Profiling Method Bioinformatics and Biomedical Engineering(ICBBE2008) ( EI ) 2008-5-1

（6）孫平平 馬雅楠 魏亞卓 馬志強* Application of Improved K-mean Clustering in predicting protein-protein interactions BioMedical Engineering and Informatic（BMEI2008) ( EI ) 2008-5-1

（7）韓毅 陳建 馬志強 周治國 OBEX研究及.net Compact框架實現(xiàn)紅外通信的應(yīng)用 信息技術(shù) 2008-3-25

（8）李軍令 馬志強 馮嘉 關(guān)偉洲 基于遺傳算法的最大似然法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)生樹 東北師大學(xué)報.自然科學(xué)版 2008-3-20

（9）蒲東兵 馬志強* 龐長明 基于DSP的掌紋識別門禁系統(tǒng)設(shè)計與實現(xiàn) 東北師大學(xué)報（自然科學(xué)版） 2007-12-20

（10）馬志強 周春光 陸林英 馬雅楠 Predicting protein-protein interactions based on BP neural network 2007 BIBM IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine ( EI ) 2007-11-1

（11）蒲東兵 龐長明 孫英娟 馬志強 基于S3C2410的掌紋識別系統(tǒng)的設(shè)計與實現(xiàn) 信息管理前沿理論與技術(shù)研究——第13屆海峽兩岸信息管理發(fā)展與策略學(xué)術(shù)研討會論文集（中文卷） 2007-8-18

（12）馬志強 齊妙 康海峰 王淑華 孔俊 Iris Verification Using Wavelet Moments and Neural Network LECT NOTES COMPUT SC ( SCI ) 2007-8-1

（13）馬志強 曾小云 張蕾 李萌 周春光 A Novel Off-Line Signature Verification Based On Adaptive Multi-resolution Wavelet Zero-Crossing and One-Class-One-Network LECT NOTES COMPUT SC ( SCI ) 2007-7-16

（14）李艷文 馬志強* 李永麗 孫平平 馬雅楠 識別轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點的新方法 吉林大學(xué)學(xué)報（理學(xué)版） 2006.8

（15）王芳芳 馬志強* 王素華 一種基于遺傳算法的序列比對方法 吉林大學(xué)學(xué)報（信息科學(xué)版） 2006.07

（16）王素華 馬志強* 劉曉樂基于B/S結(jié)構(gòu)的網(wǎng)上考試的設(shè)計與實現(xiàn) 信息技術(shù) 2006年4期 2006.04

（17）周曉鋒 劉馨月 張靖波 馬志強* 基于可重用組件技術(shù)的軟件開發(fā)方法 信息技術(shù) 2005-11-1

（18）周曉鋒 馬志強* 劉馨月 一種基于組件的軟件開發(fā)方法 信息技術(shù)與標準化2005年9期 2005.09

（19）馬志強 Wanwu Guo Spectral Analysis of MCDF Operations in Image Processing Wseas trans on circuits and systems 2004-11-14

（20）馬志強 Wanwu Guo Remote Sensing Image Processing Using MCDF LECT NOTES COMPUT SC ( SCI ) 2004-9-14

張利彪 周春光 劉小華 馬銘 呂英華 馬志強 求解約束優(yōu)化問題的一種新的進化算法 吉林大學(xué)學(xué)報(理學(xué)版) 2004-10-1

（21）馬志強 楊貴福 李多顯 群決策在連鎖經(jīng)營中的應(yīng)用 吉林大學(xué)學(xué)報（信息科學(xué)版） 2004-6-14

（22）馬志強 Watson A Wanwu Guo Application of McDF operations in digital terrain model processing LECT NOTES COMPUT SC ( SCI )2004-4-1

（23）L. B. Zhang, C. G. Zhou, X. H. Liu, Z. Q. Ma, M. Ma and Y. C. Liang Solving multi objective optimization problems using particle swarm optimization Evolutionary Computation,2003.CECu201903.The 2003 Congress on Publication Data:8-12 Dec.2003 Volume:4 2003.12

（24）馬志強 楊貴福 一種基于UML的虛擬專用網(wǎng)模型的建立與應(yīng)用 東北師大學(xué)報（自然科學(xué)版） 2003-9-14