其父穆斯塔法將軍是當時在伊朗宣布成立的庫爾德共和國的軍事領導人。后來該共和國被伊朗當局鎮(zhèn)壓后，他父親帶著500多名追隨者逃往蘇聯(lián)，巴爾扎尼則和家人以及數(shù)千名族人回到伊拉克。1958年，伊拉克費薩爾王朝被推翻后，12歲的巴爾扎尼才和父親團聚。很快，伊拉克政府恢復了鎮(zhèn)壓庫爾德人。1961年開始，他父親穆斯塔法和庫爾德民主黨被迫發(fā)動武裝斗爭，以捍衛(wèi)庫爾德人的權利。當時年僅16歲的巴爾扎尼放棄了自己的學業(yè)，投身于武裝斗爭。年輕的的巴爾扎尼以自己的英勇和領導才能在軍隊中嶄露頭角。他在游擊戰(zhàn)中積累了豐富的經(jīng)驗，20世紀70年代，他已是庫爾德運動的核心人物之一，并成為父親的得力干將和左膀右臂。1978年，他成為庫爾德民主黨的重要領導成員。1979年，他父親穆斯塔法去世，巴爾扎尼在庫爾德民主黨第九次全國代表大會上當選為主席。

2009年7月25日，庫爾德自治區(qū)舉行了領導人和議會選舉投票。7月29日，伊拉克最高選舉委員會說，根據(jù)庫爾德自治區(qū)（簡稱庫區(qū)）選舉投票的初步統(tǒng)計結果，庫區(qū)現(xiàn)任領導人馬蘇德·巴爾扎尼當選連任，由庫區(qū)兩大執(zhí)政黨組成的競選聯(lián)盟也保住了庫區(qū)議會選舉投票的領先地位。根據(jù)伊最高選舉委員會公布的結果，在有5名候選人參加的庫區(qū)領導人競選中，巴爾扎尼贏得了69.57%的選票。