他在日本上學(xué)時(shí)，為了學(xué)到真正的軍事知識(shí)，往往比別人多付出一倍的努力。日軍輜重兵有一項(xiàng)軍事機(jī)密即捆綁軍用物資用的特種套環(huán)。有此套環(huán)，車馬跑在顛簸的路上，越是顛簸繩子勒得越緊，決不松動(dòng)。日本教官不教中國學(xué)生這個(gè)絕招。在畢業(yè)后返國時(shí)，楊祖德將一個(gè)套環(huán)帶回國內(nèi)(因該環(huán)系高強(qiáng)度聚乙稀材料所制，我國當(dāng)時(shí)尚無此材料故沒有推廣)。據(jù)說，日本士官學(xué)校曾追查此事。

1916 年 6 月 ，王汝賢下臺(tái) ， 楊祖德由教育長(zhǎng)升任保定軍校第五任校長(zhǎng)。

楊祖德上任，首遇麻煩事就是陸軍模范團(tuán)。該團(tuán)系袁世凱為控制全國軍隊(duì)而設(shè)立的北洋軍官訓(xùn)練組織，成立于1914年10月，團(tuán)部設(shè)北京西城旃壇寺，袁世凱自兼第一任團(tuán)長(zhǎng)；第二任由其長(zhǎng)子袁克定任，團(tuán)員來源于各部隊(duì)現(xiàn)役軍官，也有些是保定軍校畢業(yè)的學(xué)生。該團(tuán)團(tuán)員要求絕對(duì)忠于袁世凱，不入其它會(huì)黨，以半年為一期，每期集訓(xùn)一個(gè)師的軍官。該團(tuán)屬袁世凱的私人武裝，是袁稱帝時(shí)鷹犬和骨干。袁在世，段祺瑞不能插手，袁死后，段首先將該團(tuán)解散。為不使這些人鬧事，段決定將他們分至保定軍校第二期插班就讀。陸軍模范團(tuán)雖為軍官身份，但畢竟未經(jīng)過陸軍小學(xué)及陸軍中學(xué)的養(yǎng)成教育，不夠資格進(jìn)入保定軍校。再加上他們是袁稱帝時(shí)的爪牙，平日作威作福，早已聲名狼藉，故引起在校生的強(qiáng)烈不滿，因而雙方在校園內(nèi)引發(fā)了一場(chǎng)大規(guī)模的沖突，最后竟操起了上課用的槍械。模范團(tuán)人員雖為現(xiàn)役軍官，但進(jìn)校時(shí)赤手空拳，被在校生以武力強(qiáng)行轟出了校門，隨即，雙方在校門附近各自站崗放哨，嚴(yán)加戒備，并預(yù)謀再次發(fā)生械斗。楊祖德親自出面調(diào)停無效，經(jīng)請(qǐng)示陸軍部后，將在校生及模范團(tuán)中帶頭鬧事者一律開除，這才平息風(fēng)潮。

楊在執(zhí)教期間 ， 繼承了蔣方震（蔣百里）、曲同豐等人的教學(xué)體制與教學(xué)大綱 ， 他嚴(yán)抓學(xué)校秩序、教學(xué)質(zhì)量、教職員生生活 ， 常深入課堂、操場(chǎng)、宿舍及教職員家庭 ， 了解情況解 決問題。

楊祖德長(zhǎng)期從事軍事教育工作，他長(zhǎng)于軍事，善于管理，知人善任，既有豐富的教學(xué)經(jīng)驗(yàn)，又有為人師表的長(zhǎng)者風(fēng)度，深受師生們的尊敬和愛戴。與他一起協(xié)調(diào)工作的教育長(zhǎng)劉汝賢、校副官長(zhǎng)梁清泉、騎兵教務(wù)長(zhǎng)安俊才、炮兵科長(zhǎng)張基、騎兵隊(duì)長(zhǎng)何柱國、工兵科教官蔡玉標(biāo)等人都能與他和睦相處。他任校長(zhǎng)三年，學(xué)校各方面的工作卓有成效，是保定軍校八任校長(zhǎng)中任期最長(zhǎng)的一位，也是有作為的校長(zhǎng)之一。

楊祖德執(zhí)教階段，是保定軍校學(xué)校秩序、教學(xué)質(zhì)量難得的黃金時(shí)期，在他的學(xué)生中有不少成為中國近代革命史上的知名人物，為中國人民的革命事業(yè)立下了不朽功勛。如葉挺同志是我黨著名軍事將領(lǐng)，在北伐戰(zhàn)爭(zhēng)中他率領(lǐng)的“鐵軍”使敵人聞風(fēng)喪膽，抗日戰(zhàn)爭(zhēng)時(shí)期任新四軍軍長(zhǎng)。趙博生烈士，是寧都起義的著名領(lǐng)導(dǎo)人，曾任紅五軍團(tuán)副總指揮、參謀長(zhǎng)。還有不少學(xué)生經(jīng)過曲折的道路后，又投身革命陣營。如張治中、傅作義等。

1919年8月，楊祖德患病離校，返回山東老家濰城休養(yǎng)。此時(shí)，自民國初年就一直流竄于沂蒙山區(qū)的一股頑匪盤據(jù)于城內(nèi)，時(shí)任山東省督軍的張樹元接報(bào)后決心攻取，他親自從馬良的駐山東參戰(zhàn)軍第二師借來一支炮兵助戰(zhàn)，力圖轟破城墻沖進(jìn)縣城緝拿頑匪。這時(shí)炮兵營長(zhǎng)劉增禧率炮兵從曹州奉命開到濰城，城外一名很有名望的土紳找到他，非�？蜌獾貏駥�(dǎo)他說:“劉營長(zhǎng)，你們奉命開炮打土匪我們百姓十分贊成，可你要考慮，炮彈一飛進(jìn)城內(nèi)就會(huì)傷及百姓。再說，你的校長(zhǎng)楊祖德現(xiàn)就在城內(nèi)養(yǎng)病，學(xué)生打校長(zhǎng)你如何向保定軍校交待啊!”劉增禧聽后，嚇得出一身冷汗。他立即召集手下連長(zhǎng)研討對(duì)策，最后大家一致意見利用夜間悄悄撤回原防地，城內(nèi)百姓免受一災(zāi)。

1919年冬，楊祖德因病重救治無效，逝于濰城。北洋政府陸軍、保定軍校均派人至濰城理喪務(wù)，濰縣駐軍各部全都派員參加，殯儀隆重。楊墓在望留莊頭村南高埠，墓室頗為講究，可惜毀于“文革”。其故居的文物，如楊祖德的瓷像，慈禧太后的刺繡(牡丹)等，也在“文革”前后散失或被毀。