高橋元種（1571-1614.11.10），日本安土桃山時代至江戶時代前期武將、大名。日向國縣藩藩主。戰(zhàn)國大名秋月種實次子。1578年成為高橋鑒種養(yǎng)子。1587年降伏于豐臣秀吉的九州征伐軍，移封日向國縣藩5萬3千石。

1600年關(guān)原之戰(zhàn)中隨兄參戰(zhàn)，守備大垣城。之后降伏東軍，得以保全領(lǐng)地。

1613年因故被幕府改易。之后與長子左京于陸奧國棚倉藩主立花宗茂處被看管，等待處理。

1614年于棚倉去世，享年44歲。

此后長子左京先后仕官于棚倉藩立花氏、二本松藩丹羽氏，子孫皆仕官于丹羽氏。次子長吉后成為薩摩國島津氏家臣，鹿兒島高橋氏之祖。