畢業(yè)后，任紅五軍團十三師三十七團醫(yī)生，紅一軍團二師六團醫(yī)生，第一后方醫(yī)院五所醫(yī)生，第二后方醫(yī)院醫(yī)務(wù)主任。參加了中央蘇區(qū)第四、五次反“圍剿”戰(zhàn)爭和二萬五千里長征，他一邊行軍，一邊救護傷病員。紅軍長征到遵義后，減員太多，歐陽竟就調(diào)到2師6團醫(yī)務(wù)所當(dāng)所長。過草地時，他又調(diào)到45團當(dāng)醫(yī)生。1936年延長縣實行醫(yī)院大整編，歐陽竟又調(diào)到瓦窯堡剛剛復(fù)建的紅軍衛(wèi)生學(xué)校當(dāng)教員。不久，軍委衛(wèi)生部部長姜齊賢又將歐陽竟調(diào)到抗日軍政大學(xué)衛(wèi)生科當(dāng)科長。1938年冬，軍委成立邊區(qū)醫(yī)院，衛(wèi)生部又把歐陽竟從抗大調(diào)出來，安排到陜甘寧邊區(qū)醫(yī)院當(dāng)首任院長。身為一院之長，他積極響應(yīng)自力更生克服困難的號召，帶領(lǐng)大家墾荒種地，紡紗織布，大栽玉米、高粱谷子小米和青菜，做到行醫(yī)、生產(chǎn)兩不誤，糧食當(dāng)年自給一半，蔬菜自給綽綽有余，得到陜甘寧邊區(qū)政府的通令嘉獎。1940年，歐陽竟又出任陜甘寧邊區(qū)政府衛(wèi)生處第一任處長。他積極倡導(dǎo)采取中、西醫(yī)療結(jié)合的辦法，領(lǐng)導(dǎo)建設(shè)起醫(yī)校、醫(yī)專、門診部和住院部幾十個事業(yè)單位和醫(yī)療機構(gòu)，搏得大家的交口稱贊。1944年，中組部為了培養(yǎng)我軍懂業(yè)務(wù)的尖子，培養(yǎng)第一批高級醫(yī)療骨干及高級衛(wèi)生管理人才，就專門從老紅軍醫(yī)務(wù)工作中者挑選出一批同志進入延安中國醫(yī)科大學(xué)高級研究班深造。歐陽竟這位在醫(yī)療戰(zhàn)線摸爬滾打十多年的老兵給挑選上了，從此進入正規(guī)化系統(tǒng)的專業(yè)知識學(xué)習(xí)。畢業(yè)后，他調(diào)任陜甘寧邊區(qū)衛(wèi)生部長兼醫(yī)院院長。日本投降后，東北急需大批干部，組織上通知歐陽竟輕裝上陣，速去東北。但行至張家口遇到國民黨軍隊的封鎖，便折回晉察冀，他被任命為晉察冀軍區(qū)白求恩國際和平醫(yī)院院長。不久，在司令員聶榮臻、政委彭真領(lǐng)導(dǎo)下，他很快建立了晉察冀第一、二、三和平醫(yī)院。為著革命工作的需要，歐陽竟又一回聽從組織的召喚，被調(diào)到第一后方醫(yī)院當(dāng)院長。解放戰(zhàn)爭進入全面決戰(zhàn)勝利階段，歐陽竟被任命為冀晉軍區(qū)衛(wèi)生部部長、 察哈爾軍區(qū)衛(wèi)生部部長、黨委書記兼衛(wèi)生廳廳長。1952年，任華北行政區(qū)文教局副局長、衛(wèi)生局局長兼黨組書記；1954年，任衛(wèi)生部鄉(xiāng)村醫(yī)療預(yù)防司司長、衛(wèi)生防疫司司長、藥政局局長、中醫(yī)研究院黨委副書記，衛(wèi)生部辦公廳主任、黨組成員兼機關(guān)黨委副書記、衛(wèi)生部咨詢委員會主任委員（副部級）。他是中華醫(yī)學(xué)會副會長、名譽顧問，中國紅十字會常務(wù)理事，《新中國預(yù)防學(xué)歷史經(jīng)驗》、《中國醫(yī)學(xué)通史》編審委員會副主任。1992年11月8日在北京逝世，享年78歲。