吳記藿是南安縣十六都詩口鄉(xiāng)（今南安市碼頭鎮(zhèn)詩南村）人，公元1866年（清同治五年）出身于一個普通的農民家庭。迫于生計，1886年，吳記藿漂洋過海僑居于菲律賓馬尼拉。

1892年，吳記藿被僑商林云梯聘為布店經理，后改為合作。歷12年發(fā)展，吳記藿分得紅利100余萬比索，乃自立門戶。數(shù)年內在馬尼拉創(chuàng)辦吳記藿進出口公司等10家工商企業(yè)。

1911年，吳記藿在馬尼拉參加中國同盟會，被委任為中國同盟會駐菲專員；鼎力資助同盟會菲律賓分會創(chuàng)辦《公理報》，任常務理事；積極捐輸支持武昌起義。1912年，中華民國臨時政府聘請他為海外顧問，并授予一級嘉禾勛章。

1920年，吳記藿與李清泉、薛敏佬等華僑集資創(chuàng)辦菲律賓中興銀行，任董事兼實業(yè)部主任。還獨資在上海、漢口開設上海嘉福行、鐵釘廠和漢冶萍鐵釘鋅線廠，成為最早投資祖國實業(yè)的菲律賓僑商之一。是年，華北大旱，擔任菲律賓中華總商會華北賑災委員會募捐員，自損5000元為倡，積極勸募救災捐款。

1921年，任菲律賓華僑抗爭《西文簿記法案》委員會副主席。1925年，與陳三多、李清泉等人在馬尼拉創(chuàng)辦《新閩日報》，任董事。20年代，福建民軍擾民，他在菲參與組織南洋閩僑救鄉(xiāng)會，1926年改組為菲律賓中華國民協(xié)會，任委員，帶頭損資并發(fā)動捐款支援北伐。

1932年6月19日，在馬尼拉病逝。

吳記藿對家鄉(xiāng)的文化教育事業(yè)很重視。1909年起，他就在家鄉(xiāng)創(chuàng)辦詩坂、詩鰲學堂，繼而又與鄉(xiāng)僑陳宏基等人創(chuàng)辦詩山進化小學。

1919年，他在泉州創(chuàng)辦嘉福學校，還資助泉州、晉江、南安20多所中小學，并捐助泉州各醫(yī)院、慈兒院及養(yǎng)老院。成功中學的前身南安職業(yè)學校是南安最早的中學之一，是吳記藿慷慨捐資，1922年在碼頭街附近的大壩墟創(chuàng)辦的。

1924年，在泉州創(chuàng)辦泉秀民辦碼頭汽車路公司。1928年，與陳云恩、李清泉等人共同發(fā)起創(chuàng)辦福建造紙廠。同年，吳記霍響應孫中山先生“航空救國”的號召，在海外組織了“航空救國委員會”，籌辦廈門五通民用航空學校（一年半后并入廣州民航學校）。據(jù)史料記載，當時航校擁有七架教練機，吳記霍捐了5架。