1921年10月出生于貧窮的船工家庭，1935年從船民小學(xué)畢業(yè)后因家庭經(jīng)濟貧困而輟學(xué)，此后跟隨父親從事水上運輸為生。1949年9月漳州解放后，人民解放軍募集船工準備渡海解放廈門，黃甘樹積極報名要求參加支前作戰(zhàn)，隨后入選人民解放軍第31軍支前船工，積極組織船工配合部隊開展軍事訓(xùn)練。1949年10月13日廈門戰(zhàn)役打響后，黃甘樹多次運載部隊渡海解放廈門鼓浪嶼。10月15日在完成第五次運載任務(wù)返回時，因遭受敵機轟炸壯烈犧牲。