出身貧農。1938年夏入山東抗日軍政干部學校學習，畢業(yè)后回鄉(xiāng)做民運工作。11月加入中國共產黨。翌年任本村黨支部書記。10月參加八路軍山東縱隊，歷任二支隊八大隊青年隊隊長、特務二團政治處民運干事。1944年12月，調任山東魯南軍區(qū)三團十一連政治指導員。1945年8月，朱兆運在山東軍區(qū)第八師任連指導員。1947年，調任華東野戰(zhàn)軍第三縱隊八師二十三團政治處保衛(wèi)股長。次年9月，改任八師政治部保衛(wèi)科副科長。在淮海戰(zhàn)役中，先后立二等功2次。自1954年3月，歷任二十二軍政治部保衛(wèi)處副處長，二十六軍軍事檢察院檢察長，炮兵第一二九團和步兵第二二六團政委1964年4月，調入守備第二十五師，先后任政治部主任、副政委、政委。1967年兼任威海市革命委員會主任1970年1月，改任第二十六軍政治部主任。1976年8月，開始從事軍事教育，相繼在濟南軍區(qū)任軍政干部學校訓練部政委、濟南步兵學校訓練部政委、濟南陸軍學校訓練部政委等職。