主要研究領(lǐng)域，真核生物基因組的大部分基因家族組成龐大，眾多家族成員拷貝為何能在進(jìn)化歷程中被保留，功能上有何意義，功能分化的機(jī)制又是什么，不同生物類群和不同類基因家族在這些層面上有何進(jìn)化特點(diǎn)，我們利用基因組學(xué)、生物化學(xué)和分子生物學(xué)等多學(xué)科研究手段，在蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能層次上揭示基因家族的形成、維持和功能分化的分子機(jī)制，探討植物基因組進(jìn)化的模式，并揭示植物適應(yīng)性進(jìn)化的分子機(jī)制。

1、“林木比較功能基因組學(xué)”，國(guó)家杰出青年科學(xué)基金（2015.1-2019.12)，資助金額400萬(wàn)元，主持。

2、“楊樹GST基因家族極端環(huán)境適應(yīng)性進(jìn)化機(jī)制研究”，國(guó)家自然科學(xué)基金重大研究計(jì)劃/培育項(xiàng)目(2013.1-2015.12)，資助金額100萬(wàn)元，主持。

3、“優(yōu)質(zhì)林木抗逆生長(zhǎng)的功能基因組學(xué)”，科技部973項(xiàng)目二級(jí)課題(2009.1-2014.12)，資助金額388萬(wàn)元，第二主持。

4、“植物GST基因家族的功能性進(jìn)化”，國(guó)家自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目(2007.1-2010.12)，資助金額30萬(wàn)元，主持。

5、“同倍性雜交物種形成和適應(yīng)性進(jìn)化的遺傳基礎(chǔ)”，國(guó)家自然科學(xué)基金重點(diǎn)項(xiàng)目(2009.1-2012.12)，資助金額180萬(wàn)元，參加。

6、“植物谷胱甘肽轉(zhuǎn)移酶基因家族序列與功能分化的進(jìn)化生物學(xué)意義”，國(guó)家自然科學(xué)基金主任基金(2007.1-2007.12)，資助金額10萬(wàn)元，主持。

7、“亞熱帶森林生態(tài)系統(tǒng)中菌根真菌多樣性研究”，國(guó)家自然科學(xué)基金主任基金(2008.1-2008.12)，資助金額15萬(wàn)元，主持。

8. “植物小種群的生態(tài)遺傳學(xué)效應(yīng)與物種瀕危機(jī)制研究” 中國(guó)科學(xué)院知識(shí)創(chuàng)新工程重要方向項(xiàng)目(2007.1-2009.12)，主持子課題“植物與菌根真菌的互作與物種的適應(yīng)與生存”，資助金額25萬(wàn)元。

9、在瑞典攻讀博士學(xué)位期間，獨(dú)立申請(qǐng)到Stiftelsen J C Kempes Minnes Stipendiefond (Sweden) 基金會(huì)項(xiàng)目:Detection and quantification of Wallemia sebi by real-time PCR in agriculture environments. 執(zhí)行時(shí)間2005 - 2006。資助金額：12,000.00 SEK。