工作經(jīng)歷
1992年本科畢業(yè)于華中科技大學(xué)工程力學(xué)專業(yè)。
1997年碩士畢業(yè)于北大流體力學(xué)專業(yè)。
2000年博士畢業(yè)于北大流體力學(xué)專業(yè)。
2001－02年北大湍流與復(fù)雜系統(tǒng)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室博士后，開始轉(zhuǎn)入生物信息學(xué)的交叉學(xué)科研究。
2003年1月留校任教，2006年加入北大工學(xué)院生物醫(yī)學(xué)工程系�，F(xiàn)為湍流與復(fù)雜系統(tǒng)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室固定成員、北京大學(xué)理論生物學(xué)中心核心成員、北京大學(xué)蛋白質(zhì)科學(xué)中心成員。
2007－2008年赫爾辛基大學(xué)芬蘭基因組中心訪問學(xué)者。
工作成就
目前主要研究領(lǐng)域?yàn)樯镄畔W(xué)和計(jì)算系統(tǒng)生物學(xué)，研究興趣包括基因組復(fù)雜結(jié)構(gòu)信息分析（原核和真核生物基因預(yù)測相關(guān)問題）、比較基因組學(xué)、生物進(jìn)化以及生物分子動(dòng)力學(xué)等。近年來主持發(fā)展的原核基因翻譯起始位點(diǎn)預(yù)測方法MED-Start/MED-StartPlus、原核生物基因組分析和基因預(yù)測方法MED 2.0等目前已經(jīng)達(dá)到國際同類方法的領(lǐng)先水平，并應(yīng)用于法國原子能委員會(huì)（CEA Cadarche）、美國華盛頓大學(xué)（Washington Univ. St. Louis）醫(yī)學(xué)院等多個(gè)實(shí)驗(yàn)室的微生物基因組測序計(jì)劃，得到國際生物信息學(xué)領(lǐng)域的關(guān)注。與美國Georgia Institute of Technology生物醫(yī)學(xué)工程系相關(guān)實(shí)驗(yàn)室保持良好的合作關(guān)系。研究結(jié)果已在《Nucleic Acids Res.》、《Bioinformatics》、《BMC Bioinformatics》、《BMC Genomics》等生物信息學(xué)領(lǐng)域國際權(quán)威刊物發(fā)表，累計(jì)SCI影響因子總和超過50。
先后主持和合作承擔(dān)國家自然科學(xué)基金、國家科技部973計(jì)劃等國家基金項(xiàng)目共計(jì)10項(xiàng)。開設(shè)研究生專業(yè)必修課《生物醫(yī)學(xué)應(yīng)用數(shù)學(xué)》、全校本科生通選課《生物信息學(xué)導(dǎo)論》和研究生專業(yè)課《計(jì)算生物學(xué)算法導(dǎo)論》、《生物醫(yī)學(xué)中的系統(tǒng)生物學(xué)》等課程。擔(dān)任《Int. J. Comput. Intelligence in Bioinformatics and Systems Biology(IJCIBSB)》副編輯。擔(dān)任《Nucleic Acids Res.》、《Bioinformatics》、《BMC Bioinformatics》、《BMC Genomics》、《Journal of Theoretical Biology》、《Journal of Bioinformatics and Computational Biology》、《IEEE Transactions on Signal Processing》以及《中國科學(xué)》、《生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展》和《生物物理學(xué)報(bào)》等學(xué)術(shù)期刊論文審稿人。
所領(lǐng)導(dǎo)的研究小組現(xiàn)指導(dǎo)在讀博士生7人、碩士生3人，已指導(dǎo)畢業(yè)博士生4人、碩士生3人，并作為指導(dǎo)教師獲得2010年北京市優(yōu)秀博士論文1篇。先后獲得北大“寶潔”獎(jiǎng)教金、北大方正優(yōu)秀獎(jiǎng)教金。
