工作經(jīng)歷
1992年本科畢業(yè)于華中科技大學工程力學專業(yè)。
1997年碩士畢業(yè)于北大流體力學專業(yè)。
2000年博士畢業(yè)于北大流體力學專業(yè)。
2001-02年北大湍流與復雜系統(tǒng)國家重點實驗室博士后,開始轉(zhuǎn)入生物信息學的交叉學科研究。
2003年1月留校任教,2006年加入北大工學院生物醫(yī)學工程系,F(xiàn)為湍流與復雜系統(tǒng)國家重點實驗室固定成員、北京大學理論生物學中心核心成員、北京大學蛋白質(zhì)科學中心成員。
2007-2008年赫爾辛基大學芬蘭基因組中心訪問學者。
工作成就
目前主要研究領域為生物信息學和計算系統(tǒng)生物學,研究興趣包括基因組復雜結(jié)構(gòu)信息分析(原核和真核生物基因預測相關問題)、比較基因組學、生物進化以及生物分子動力學等。近年來主持發(fā)展的原核基因翻譯起始位點預測方法MED-Start/MED-StartPlus、原核生物基因組分析和基因預測方法MED 2.0等目前已經(jīng)達到國際同類方法的領先水平,并應用于法國原子能委員會(CEA Cadarche)、美國華盛頓大學(Washington Univ. St. Louis)醫(yī)學院等多個實驗室的微生物基因組測序計劃,得到國際生物信息學領域的關注。與美國Georgia Institute of Technology生物醫(yī)學工程系相關實驗室保持良好的合作關系。研究結(jié)果已在《Nucleic Acids Res.》、《Bioinformatics》、《BMC Bioinformatics》、《BMC Genomics》等生物信息學領域國際權威刊物發(fā)表,累計SCI影響因子總和超過50。
先后主持和合作承擔國家自然科學基金、國家科技部973計劃等國家基金項目共計10項。開設研究生專業(yè)必修課《生物醫(yī)學應用數(shù)學》、全校本科生通選課《生物信息學導論》和研究生專業(yè)課《計算生物學算法導論》、《生物醫(yī)學中的系統(tǒng)生物學》等課程。擔任《Int. J. Comput. Intelligence in Bioinformatics and Systems Biology(IJCIBSB)》副編輯。擔任《Nucleic Acids Res.》、《Bioinformatics》、《BMC Bioinformatics》、《BMC Genomics》、《Journal of Theoretical Biology》、《Journal of Bioinformatics and Computational Biology》、《IEEE Transactions on Signal Processing》以及《中國科學》、《生物化學與生物物理進展》和《生物物理學報》等學術期刊論文審稿人。
所領導的研究小組現(xiàn)指導在讀博士生7人、碩士生3人,已指導畢業(yè)博士生4人、碩士生3人,并作為指導教師獲得2010年北京市優(yōu)秀博士論文1篇。先后獲得北大“寶潔”獎教金、北大方正優(yōu)秀獎教金。