1965年3月參加工作，1979年12月加入中國(guó)共產(chǎn)黨。

1985年5月起任民航上海航空修理廠廠長(zhǎng)。有較強(qiáng)獨(dú)立排除飛機(jī)疑難故障能力和企業(yè)管理經(jīng)驗(yàn)。在飛機(jī)維護(hù)修理的同時(shí)，大膽革新、改造三叉戟型飛機(jī)自動(dòng)飛行系統(tǒng)電源自動(dòng)轉(zhuǎn)換盒，降低飛機(jī)故障率，被民航總局工程司采納，并在民航系統(tǒng)推廣實(shí)施。

1986年赴美國(guó)舊金山州立大學(xué)高級(jí)經(jīng)理班學(xué)習(xí)，吸取國(guó)外經(jīng)營(yíng)管理經(jīng)驗(yàn)，并取得舊金山市長(zhǎng)簽發(fā)的畢業(yè)證書。

1987年12月葉任民航華東管理局副局長(zhǎng)，分管辦公室、適航、公安等工作。主持制定《民航華東管理局職責(zé)范圍》

1992年4月任中國(guó)航空器材公司總經(jīng)理、黨委副書記。

1996年4月任民航華東管理局局長(zhǎng)、黨委書記。

1997年12月，當(dāng)選為中共上海市第七次黨員代表大會(huì)代表。

2001年4月調(diào)任東方航空集團(tuán)公司總裁、黨委書記，兼任中國(guó)東方航空股份有限公司董事長(zhǎng)。

2002年9月任中國(guó)東方航空集團(tuán)公司總經(jīng)理、黨組副書記，兼任中國(guó)東方航空股份有限公司董事長(zhǎng)。

2021年1月29日，葉毅干同志因病醫(yī)治無(wú)效在上海逝世，享年78歲。葉毅干同志逝世后，中央有關(guān)領(lǐng)導(dǎo)同志以不同方式表示哀悼并向其親屬表示慰問。