1965年3月參加工作，1979年12月加入中國共產黨。

1985年5月起任民航上海航空修理廠廠長。有較強獨立排除飛機疑難故障能力和企業(yè)管理經驗。在飛機維護修理的同時，大膽革新、改造三叉戟型飛機自動飛行系統(tǒng)電源自動轉換盒，降低飛機故障率，被民航總局工程司采納，并在民航系統(tǒng)推廣實施。

1986年赴美國舊金山州立大學高級經理班學習，吸取國外經營管理經驗，并取得舊金山市長簽發(fā)的畢業(yè)證書。

1987年12月葉任民航華東管理局副局長，分管辦公室、適航、公安等工作。主持制定《民航華東管理局職責范圍》

1992年4月任中國航空器材公司總經理、黨委副書記。

1996年4月任民航華東管理局局長、黨委書記。

1997年12月，當選為中共上海市第七次黨員代表大會代表。

2001年4月調任東方航空集團公司總裁、黨委書記，兼任中國東方航空股份有限公司董事長。

2002年9月任中國東方航空集團公司總經理、黨組副書記，兼任中國東方航空股份有限公司董事長。

2021年1月29日，葉毅干同志因病醫(yī)治無效在上海逝世，享年78歲。葉毅干同志逝世后，中央有關領導同志以不同方式表示哀悼并向其親屬表示慰問。