比利亞爾瓦最初在1858年于政府中擔(dān)任總會(huì)計(jì)師，然后在1860年3月29日至1861年6月22日期間于總統(tǒng) 貝納多·貝羅（西班牙語(yǔ)：BernardoBerro）的第二次內(nèi)閣中擔(dān)任財(cái)政部長(zhǎng)，其后更于1863年4月24日至1865年2月15日間擔(dān)任烏拉圭參議院議長(zhǎng)。 　　1863年，科羅拉多黨（西班牙語(yǔ)：Partido Colorado，也稱為紅黨）領(lǐng)袖 維南西奧·弗洛雷斯（西班牙語(yǔ)：VenancioFlores）開(kāi)始進(jìn)行叛亂，以推翻當(dāng)時(shí)領(lǐng)導(dǎo)著一個(gè)由該黨和國(guó)家黨（西班牙語(yǔ)：PartidoNacional，亦稱作白黨）共同組成的聯(lián)合政府之白黨總統(tǒng)貝納多·貝羅。經(jīng)過(guò)一系列的戰(zhàn)斗， 紅黨聯(lián)同 巴西軍隊(duì)控制了該國(guó)大部分地區(qū)，而白黨就只能控制著首都 蒙得維的亞。1864年3月1日，貝羅總統(tǒng)辭職并由主張采取強(qiáng)硬路線的烏拉圭參議院議員 阿塔納西奧·阿吉雷（西班牙語(yǔ)：AtanasioAguirre）繼任。最終 烏拉圭內(nèi)戰(zhàn)在1864年8月10日正式開(kāi)始，作戰(zhàn)雙方為當(dāng)時(shí)正在執(zhí)政的國(guó)家黨以及有 巴西帝國(guó)公開(kāi)地支持和時(shí)任 阿根廷總統(tǒng) 巴托洛梅·米特雷秘密地支援的科羅拉多黨。這場(chǎng)內(nèi)戰(zhàn)為這兩個(gè)派系自1828年烏拉圭獨(dú)立起幾乎持續(xù)地斗爭(zhēng)的一部分；亦與包含阿根廷、巴西、 巴拉圭和烏拉圭在內(nèi)，并在 巴拉圭戰(zhàn)爭(zhēng)（又稱為 三國(guó)同盟戰(zhàn)爭(zhēng)）時(shí)期達(dá)到高峰的廣泛地區(qū)沖突中有密切的關(guān)系 。

1865年2月2日，巴西海軍開(kāi)始封鎖蒙得維的亞，但期間曾暫時(shí)放寬封鎖，使外國(guó)人得以撤離至 布宜諾斯艾利斯。隨后該放寬政策被延長(zhǎng)至2月中旬，使烏拉圭參議院可以選舉一名新總統(tǒng)。結(jié)果阿吉雷的總統(tǒng)任期在2月15日結(jié)束，同時(shí)參議院亦選出屬于溫和派的比利亞爾瓦繼任總統(tǒng)一職。比利亞爾瓦就職后便立即請(qǐng)求來(lái)自 英國(guó)、 法國(guó)、 意大利和 西班牙的外國(guó)軍隊(duì)之分遣隊(duì)前往蒙得維的亞登陸，以防止 白黨當(dāng)中更激進(jìn)的成員企圖推翻他。此外，比利亞爾瓦亦與弗洛雷斯達(dá)成協(xié)議，并與他在2月20日簽訂包含對(duì)紅黨及白黨進(jìn)行赦免的和平協(xié)議。最后他也在同日辭去總統(tǒng)一職，并容許弗洛雷斯在新大選前擔(dān)任過(guò)渡性的總統(tǒng)。

卸任總統(tǒng)后，比利亞爾瓦在1865年3月18日出版了一份關(guān)于烏拉圭銀行業(yè)的報(bào)告。其后議會(huì)根據(jù)該報(bào)告的內(nèi)容于1865年3月23日通過(guò)了一項(xiàng)有關(guān)烏拉圭銀行業(yè)的法令，該法令為烏拉圭歷史上第一次建立的一套銀行業(yè)監(jiān)管法令系統(tǒng)。