1999年入選貴州省體育局水上運(yùn)動管理中心皮劃艇靜水隊(duì)，后轉(zhuǎn)為皮劃艇激流回旋項(xiàng)目，2003年進(jìn)入國家青年隊(duì)，2005年進(jìn)入國家隊(duì)。

2009年6月29日，2009年皮劃艇激流回旋世界杯（法國站）落幕，貴州選手岑南琴在女子單人劃艇比賽中為中國隊(duì)奪得一枚金牌，創(chuàng)造了中國激流回旋項(xiàng)目歷史最好成績。

2010年7月4日，皮劃艇激流回旋世界杯賽(第三站)在德國落幕，貴州省運(yùn)動員岑南琴憑借奪得第一站、第三站冠軍、第二站第九名的優(yōu)異成績，最終榮獲2010年皮劃艇激流回旋世界杯系列賽女子單人劃艇總冠軍，成為貴州省競技體育史上的第九位世界冠軍。

2014年10月2日，仁川亞運(yùn)會皮劃艇激流回旋項(xiàng)目的決賽中。經(jīng)過連番惡戰(zhàn)，冒著大雨，中國選手岑南琴以1分23秒79的成績獲勝摘得金牌。

岑南琴先后榮獲“CCTV體壇風(fēng)云人物提名獎”和全國“三八”紅旗手等榮譽(yù)稱號。