曾任安徽省滁州市全椒縣南屏鄉(xiāng)、武崗區(qū)農(nóng)技站技術(shù)員、襄河鎮(zhèn)農(nóng)技站站長、城東農(nóng)技中心站副站長，縣農(nóng)委開發(fā)辦副主任、主任，縣政府辦公室副科級秘書、縣農(nóng)委副主任，縣招商局局長、黨組書記，滁州經(jīng)濟技術(shù)開發(fā)區(qū)工委委員、經(jīng)貿(mào)發(fā)展局副局長、招商局局長；

2010年6月，任滁州經(jīng)濟技術(shù)開發(fā)區(qū)管委會副主任（副縣級）、工委委員、經(jīng)貿(mào)發(fā)展局（經(jīng)濟運行局（統(tǒng)計局））局長，市招商辦（投資合作促進局）副主任（副局長）（兼）。

2019年1月至2019年3月，任滁州市投資促進局局長。

2019年3月至2019年8月，任滁州市投資促進局黨組書記、局長。

2019年6月，任滁州市發(fā)展和改革委員會（市糧食和物資儲備局）主任（局長）。

2019年1月31日，滁州市人民政府決定，吳孝水任滁州市投資促進局局長。

2019年3月，吳孝水任滁州市投資促進局黨組書記。

2019年6月26日，滁州市第六屆人民代表大會常務委員會第十二次會議，決定任命吳孝水為滁州市發(fā)展和改革委員會（市糧食和物資儲備局）主任（局長）。

2019年8月28日，滁州市人民政府研究決定，免去吳孝水的市投資促進局局長職務。