912年12月加陸軍少將銜。自幼習(xí)武，膂力過人，清光緒乙酉（1885）中武科舉人，初授循化奇臺(tái)堡守備，后歷任鎮(zhèn)標(biāo)前營(yíng)都司、督標(biāo)后營(yíng)游擊、城守營(yíng)參將、馬營(yíng)監(jiān)游擊。因功賞戴花翎，二品頂戴，賜號(hào)“勝勇巴圖魯”。光緒二十年（1894）中日 甲午戰(zhàn)爭(zhēng)時(shí)奉調(diào)進(jìn)京守衛(wèi)，八國(guó)聯(lián)軍進(jìn)犯北京時(shí)，隨軍扈從慈禧、光緒帝西逃，沿途忠心護(hù)駕，兩宮返京，晉總兵加提督銜。宣統(tǒng)三年（1911年）在馬安良部任精銳營(yíng)統(tǒng)領(lǐng)。辛亥革命爆發(fā)，隨馬安良率部赴陜西 州、乾縣攻打革命軍，清帝退位，馬占奎撤回蘭州。民國(guó)元年（1912年）三月響應(yīng)共和，在蘭州首倡裁軍。后授陸軍中將銜、二等文虎章、二等嘉禾章，任甘肅督標(biāo)中軍副將，鎮(zhèn)守蘭州。民國(guó)八年（1919年）時(shí)局混亂，各派紛爭(zhēng)，馬占奎辭去軍職，往麥加朝覲，返回后潛心經(jīng)學(xué)。民國(guó)二十九年（1940年）去世，終年82歲。民國(guó)三十年（1941年）立碑于臨夏西郊，現(xiàn)墓碑存于臨夏縣政協(xié)院內(nèi)