寧山寺古稱蓮花寺，東漢明帝劉莊(公元57年―公元75年）為紀(jì)念父親光武帝劉秀于此地脫險，敕遣王梁宰相修建。

漢明帝崇尚佛教，派遣蔡愔、秦景、王遵等十八人出使天竺求佛取經(jīng)。蔡愔歷經(jīng)千辛萬苦，與竺法蘭、攝摩騰一行，用白馬馱著四十二章佛經(jīng)和釋迦牟尼的佛像，于永平十年（公元67）回到了洛陽。漢明帝因此在洛陽城雍關(guān)之西，建造了中國第一座佛教寺院——白馬寺，用以儲藏佛經(jīng)，弘傳佛教。

北宋熙寧五年（公元1072年），少華山阜頭峰（即半截山）因地震崩塌，伏壓數(shù)百戶，人們認(rèn)為是妖魔作怪，修靜山堂一座，以期鎮(zhèn)降。之后元祐元年（公元1086年），小敷峪再次發(fā)生地震山崩，當(dāng)?shù)孛癖娖谕�依賴佛祖的威德降妖�?zhèn)魔，就請愿改“蓮花寺”為“寧山寺”以鎮(zhèn)之遂平定。 嘉靖三十四年（1556年1月23日）華州發(fā)生8級大地震，死亡十分之六，建筑傾塌殆盡，活生生將寧山寺下移七、八里遠(yuǎn)，但寺院殿宇片瓦未碎，被當(dāng)?shù)厝藗鳛槠嬲劇?/p>

民國二十三年(1934年)，慈云法師住持寧山寺，再次對原有建筑募捐整修，并擴建了知客寮、司閽寮、退居堂、講經(jīng)堂、筆室、外廊、山門等；文化大革命期間，寧山寺遭慘重破壞，僅殘存講經(jīng)堂、東廂房、齋堂等十幾間，院內(nèi)收為耕地，六大柜古佛經(jīng)及所有書法字畫、佛像、法器均搗毀一空，住持佛心法師被迫還俗；1982年國家落實政策，比丘尼悟德入住，節(jié)衣縮食，募化四方，先后修復(fù)了寧山寺內(nèi)舊有建筑，2015年，悟德尼師圓寂。為恢復(fù)寧山寺道場弘法利生功能，讓佛教文化更好的利益恩澤華州一方百姓，2015年12月，華州區(qū)政府、區(qū)民族宗教事務(wù)局、區(qū)佛教協(xié)會及當(dāng)?shù)鼐邮啃疟姸Y請釋續(xù)文法師出任寧山寺住持。

釋續(xù)文法師，山東人氏，自幼隨祖父習(xí)醫(yī)練武，2006年禮河南百歲醫(yī)僧上印下法老和尚剃度出家，后依止于苦行頭陀上廣下源法師，2009年于河南大相國寺受具足戒，得戒于上傳下印長老座下。

續(xù)文法師乃祖?zhèn)髦嗅t(yī)，修學(xué)傳承的是藥師佛醫(yī)法門，當(dāng)今社會，因作息、飲食、生活、工作、心理等原因?qū)е麓蟛糠秩司�處于亞健康狀態(tài)，為利益當(dāng)今社會大眾的需要，續(xù)文法師慈悲為懷，發(fā)愿聚合眾緣，將寧山寺恢復(fù)建設(shè)為佛教養(yǎng)生、增智開慧、消災(zāi)祈福、及休閑禪修圣地，培養(yǎng)出家、在家四眾弟子，傳承佛醫(yī)方明，弘揚藥師佛醫(yī)法門，以佛教的養(yǎng)生文化惠澤十方有緣眾生，重現(xiàn)寧山寺盛世利生之古韻！為弘揚佛教傳統(tǒng)文化力造一極。

寧山寺位于少華山國家森林公園風(fēng)景區(qū)，該景區(qū)依托文化旅游、養(yǎng)生體驗、避暑度假、登山健身的特色，集山美、林秀、水清、寺靜為一體，是陜西東府容量最大的山谷型國家自然生態(tài)旅游景區(qū)。