1991年入選徐根寶的國奧隊，作為主力門將參加了1992年奧運預選賽。

1999年，隨松日隊落戶貴陽，慕軍時值鼎盛時期，松日隊在貴陽主場先后擊敗重慶隆鑫、北京國安、四川全興等甲A勁旅，而慕軍是頭號功臣。2001年，重回貴陽進行客場比賽，貴州當?shù)孛襟w和球迷們仍對慕軍青睞有加。數(shù)百球迷自發(fā)地齊聲高喊：“慕軍，好樣的！”

2002年退役后慕軍回到火車頭隊，當時隊內的門將張鷺是半路出家，慕軍對張鷺給予了很多業(yè)務上的指導。