劉裕征討孫恩時，縣里征召蒯恩到軍中，充當(dāng)擔(dān)任雜役的士兵，讓他運載馬芻（喂馬的草）。蒯恩常常背負一大捆馬芻，是一般人的兩倍之多，他每每將馬芻丟在地上，感嘆道：“大丈夫應(yīng)該開挽三石弓箭殺敵，怎么能僅當(dāng)一個馬兵呢？”劉裕聽說蒯恩的這些事，馬上便給他武器鎧甲，蒯恩高興萬分，跟隨劉裕征討孫恩，常常率先攻擊敵人，殺敵無數(shù)。蒯恩既熟悉戰(zhàn)陣，又膽量才能過人，忠誠恭謹(jǐn)，未曾有過過失，很得劉裕的喜愛，在婁縣戰(zhàn)斗中，他的左眼（《南史》作右眼）被箭射傷。

蒯恩隨同劉裕平定京城，以寧遠將軍的身份帶一隊人馬。又隨同振武將軍劉道規(guī)向西討伐。俘虜桓仙客，攻克偃月壘，于是平定江陵。

義熙二年（406年），張堅占據(jù)應(yīng)城造反，蒯恩擊敗張堅，因功被封為都鄉(xiāng)侯。隨同劉裕進攻廣固，又有戰(zhàn)功。盧循進逼京城，蒯恩在查浦抵抗敵人，敵人退走。他又和王仲德等追擊，擊敗在南陵的盧循部將范崇民。盧循逃回廣州，蒯恩又帶一千人隨同劉藩追擊在始興的徐道覆，并將他斬首。蒯恩升任龍驤將軍、蘭陵太守。

義熙八年（412年），劉裕西征劉毅，蒯恩和王鎮(zhèn)惡率領(lǐng)輕裝士兵襲擊江陵。義熙九年（413年），蒯恩在本官的基礎(chǔ)上又兼任太尉長、行參軍，帶兵二千，隨同益州刺史朱齡石征討割據(jù)蜀地、建立西蜀政權(quán)的譙縱。義熙十年（414年），到達彭模時，蒯恩所帶的部隊沖在前面，和蜀軍展開激烈的戰(zhàn)斗，從早晨到傍晚，蒯恩更加勇猛。蜀軍敗逃，于是進軍攻克西蜀都城成都，消滅西蜀政權(quán)。蒯恩因功被提拔為行參軍，改封為北至縣五等男。

劉裕征討司馬休之和魯宗之時，蒯恩和建威將軍徐逵之先行。徐逵之?dāng)⊥�，蒯恩的部隊在堤下布陣，魯宗之的兒子魯軌利用勝利形勢進攻蒯恩，飛箭亂射，仿佛雨點一般，呼聲震動天地。蒯恩勉勵將士，戰(zhàn)陣更加堅固。魯軌多次沖擊，蒯恩都巍然不動。魯軌覺得攻不下于是退兵。劉�？隙�了蒯恩帶兵穩(wěn)重的能力。江陵平定后，蒯恩再追擊魯軌到石頭城。魯軌棄城而逃，蒯恩追到襄陽，魯宗之逃奔后秦，蒯恩和將領(lǐng)們追到魯陽關(guān)才回來。

蒯恩自隨從劉裕征戰(zhàn)以來，每次有危急時，都首先沖擊，常常攻陷敵陣，打敗敵人，不避險阻，大小一百多次戰(zhàn)斗，他身上也多次受重傷。劉裕記下他的前后功勞，封他為新寧縣男，食邑五百戶。

劉裕的世子劉義符當(dāng)征虜將軍，蒯恩以大府將佐兼任劉義符的中兵參軍。隨同本府轉(zhuǎn)任中兵參軍，劉裕北伐，留下蒯恩保護世子劉義符，讓朝臣和他結(jié)交。蒯恩更加謙虛，與人談話時總是以官職稱呼別人，而卻自稱鄙人。他對待士兵們，很有紀(jì)律，部下都親近擁護他。后升任諮議參軍，改任輔國將軍、淮陵太守。世子劉義符建立軍府，他又任從事中郎，再改任司馬，將軍、太守照舊。

義熙十四年（418年），蒯恩到關(guān)中迎接桂陽公劉義真。劉義真回到青泥，被胡夏軍追擊，蒯恩在后護衛(wèi)，連日激戰(zhàn)。劉義真的前軍逃散，蒯恩的部隊也大部分犧牲，他本人被胡夏軍俘虜，在胡夏境內(nèi)去世。

蒯恩因斬殺徐道覆而成名，又在平滅譙蜀，征討司馬休之、魯宗之時立下功勞。

沈約《宋書》：“既習(xí)戰(zhàn)陣，膽力過人，誠心忠謹(jǐn)，未嘗有過失，甚見愛信�！�

李延壽《南史》：①“劉懷肅、劉懷慎、劉粹、孫處、蒯恩、向靖、劉鐘、虞丘進、孟懷玉、孟龍符、胡藩等，或階緣恩舊，一其心力；或攀附風(fēng)云，奮其鱗羽，咸能振拔塵滓，自致封侯�！�；②“膽力過人，甚見愛信�！�

《宋書·卷四十九·列傳第九》