甘士階自幼好學(xué)上進(jìn)，孜孜不倦，為人所稱道。舊志上說他“家貧力學(xué)，具文武資”，“弱冠通籍政事”。明萬歷元年（1573年）癸 科中鄉(xiāng)試舉人；次年赴京應(yīng)甲戊科會試，他因不循務(wù)名實的“句讀和”“時文”（即八股文），力主經(jīng)世致用，悉心時務(wù)，幫在會試中以中庸序語應(yīng)考見黜，榜上無名。至萬歷五年丁丑科，以特奏名，經(jīng)復(fù)試，始中沈懋學(xué)榜進(jìn)士。初知 黟縣（今安徽），以廉能調(diào) 丹陽縣（今江蘇），后又擢山東道御史（官居五品）。為御史時，朝廷間有些官司員不以國計民生為務(wù)，日事爭訐，勾心斗角。士價乃以“和表”上疏，強調(diào)團(tuán)結(jié)，大得朝野稱許。其檢閱山海、居庸、紫金三關(guān)及薊密、永昌、保定等處。勵將飭 ，招兵買馬，貯糧備草，整頓財政，對加強邊防、防止外敵入侵起了一定作用。已丑年（1589年）升為湖北按察史（正三品，為一省司法長官）。其時，當(dāng)?shù)匕l(fā)生大饑荒，士價設(shè)法賑濟(jì)災(zāi)民。辛卯年（1591）調(diào)江蘇按察史，他不畏強暴，為民除害，名振一時，不久，又掌河南道印，他認(rèn)真清理積案，整頓司法，政績顯著，進(jìn)大理寺左少卿（全國最高司法審判機關(guān)之副長官）。已 年（1599年）為右都御史 巡撫鳳陽。甲辰年（1604年）調(diào)兩浙（浙東、浙西）巡撫。

在兩浙巡撫任內(nèi)， 是甘士階一生最光輝的時期�！墩憬�省通志》載：他一到任就選用賢能，淘汰冗員，禁止宴會、娛樂、嫖賭、溺女等惡習(xí)。自己以身作則，生活儉樸，禁止濫加稅收，并開行商以通有無。尤其重視農(nóng)業(yè)生產(chǎn)，興修水利，僅疏浚南湖就能灌田萬畝。他還在杭州創(chuàng)立武林書院，經(jīng)常講學(xué)其中。他教育學(xué)生要反復(fù)實踐，各盡人道，近則福家鄉(xiāng)，遠(yuǎn)則福邦國，在 序則為良土，登科目則為賢臣，退而不仕則與人共勉于善，以維世風(fēng)，戊申年（1608年），浙江省發(fā)生200年來所未有的特大水災(zāi)，士階疏留糟糧十萬擔(dān)，請發(fā)帑金賑濟(jì)， 緩織造，經(jīng)蘇民困，救萬民水火。同年10月，召人為大理寺卿（全國最高司法審判機關(guān)長官，從二品）。但終因積勞成疾，一病不起，未能赴任。為緬懷他和功績，經(jīng)朝廷核準(zhǔn)，要杭州府芝松里武林書院之陽建立了《甘公祠》，供人瞻仰。甘士階墓御水東九子嶺。萬歷四十三年遺江西而政司贛南嶺北道葉其藩論祭，有祭文一篇，建國后，九子嶺的甘士階墓尚保存完好，惜于“文公大革命”中被毀。

甘士階從政30多年，大部分是在外地度過的。在本縣的業(yè)績，主要有明萬歷年間重修嘉定橋，并置田租500石為護(hù)橋之用。舊縣成載有他的《重修儒學(xué)記》、《請發(fā)帑金賑濟(jì)和寬織造疏》和《撫浙勉在會諸生文》等專著。