甘士階自幼好學(xué)上進(jìn)，孜孜不倦，為人所稱道。舊志上說(shuō)他“家貧力學(xué)，具文武資”，“弱冠通籍政事”。明萬(wàn)歷元年（1573年）癸 科中鄉(xiāng)試舉人；次年赴京應(yīng)甲戊科會(huì)試，他因不循務(wù)名實(shí)的“句讀和”“時(shí)文”（即八股文），力主經(jīng)世致用，悉心時(shí)務(wù)，幫在會(huì)試中以中庸序語(yǔ)應(yīng)考見(jiàn)黜，榜上無(wú)名。至萬(wàn)歷五年丁丑科，以特奏名，經(jīng)復(fù)試，始中沈懋學(xué)榜進(jìn)士。初知 黟縣（今安徽），以廉能調(diào) 丹陽(yáng)縣（今江蘇），后又擢山東道御史（官居五品）。為御史時(shí)，朝廷間有些官司員不以國(guó)計(jì)民生為務(wù)，日事?tīng)?zhēng)訐，勾心斗角。士?jī)r(jià)乃以“和表”上疏，強(qiáng)調(diào)團(tuán)結(jié)，大得朝野稱許。其檢閱山海、居庸、紫金三關(guān)及薊密、永昌、保定等處。勵(lì)將飭 ，招兵買(mǎi)馬，貯糧備草，整頓財(cái)政，對(duì)加強(qiáng)邊防、防止外敵入侵起了一定作用。已丑年（1589年）升為湖北按察史（正三品，為一省司法長(zhǎng)官）。其時(shí)，當(dāng)?shù)匕l(fā)生大饑荒，士?jī)r(jià)設(shè)法賑濟(jì)災(zāi)民。辛卯年（1591）調(diào)江蘇按察史，他不畏強(qiáng)暴，為民除害，名振一時(shí)，不久，又掌河南道印，他認(rèn)真清理積案，整頓司法，政績(jī)顯著，進(jìn)大理寺左少卿（全國(guó)最高司法審判機(jī)關(guān)之副長(zhǎng)官）。已 年（1599年）為右都御史 巡撫鳳陽(yáng)。甲辰年（1604年）調(diào)兩浙（浙東、浙西）巡撫。

在兩浙巡撫任內(nèi)， 是甘士階一生最光輝的時(shí)期�！墩憬�省通志》載：他一到任就選用賢能，淘汰冗員，禁止宴會(huì)、娛樂(lè)、嫖賭、溺女等惡習(xí)。自己以身作則，生活儉樸，禁止濫加稅收，并開(kāi)行商以通有無(wú)。尤其重視農(nóng)業(yè)生產(chǎn)，興修水利，僅疏浚南湖就能灌田萬(wàn)畝。他還在杭州創(chuàng)立武林書(shū)院，經(jīng)常講學(xué)其中。他教育學(xué)生要反復(fù)實(shí)踐，各盡人道，近則福家鄉(xiāng)，遠(yuǎn)則福邦國(guó)，在 序則為良土，登科目則為賢臣，退而不仕則與人共勉于善，以維世風(fēng)，戊申年（1608年），浙江省發(fā)生200年來(lái)所未有的特大水災(zāi)，士階疏留糟糧十萬(wàn)擔(dān)，請(qǐng)發(fā)帑金賑濟(jì)， 緩織造，經(jīng)蘇民困，救萬(wàn)民水火。同年10月，召人為大理寺卿（全國(guó)最高司法審判機(jī)關(guān)長(zhǎng)官，從二品）。但終因積勞成疾，一病不起，未能赴任。為緬懷他和功績(jī)，經(jīng)朝廷核準(zhǔn)，要杭州府芝松里武林書(shū)院之陽(yáng)建立了《甘公祠》，供人瞻仰。甘士階墓御水東九子嶺。萬(wàn)歷四十三年遺江西而政司贛南嶺北道葉其藩論祭，有祭文一篇，建國(guó)后，九子嶺的甘士階墓尚保存完好，惜于“文公大革命”中被毀。

甘士階從政30多年，大部分是在外地度過(guò)的。在本縣的業(yè)績(jī)，主要有明萬(wàn)歷年間重修嘉定橋，并置田租500石為護(hù)橋之用。舊縣成載有他的《重修儒學(xué)記》、《請(qǐng)發(fā)帑金賑濟(jì)和寬織造疏》和《撫浙勉在會(huì)諸生文》等專著。