1979年9月~1983年7月，在西安礦業(yè)學(xué)院（今西安科技大學(xué)）測量系測繪工程專業(yè)學(xué)習(xí)，畢業(yè)獲學(xué)士學(xué)位。畢業(yè)后先后在北京工業(yè)職業(yè)技術(shù)學(xué)院測量系、北京科技大學(xué)首鋼工學(xué)院土建系任教。

1997年9月，調(diào)北京林業(yè)大學(xué)任教，期間在職攻讀博士學(xué)位，成為我國第一位森林GPS應(yīng)用研究的博士學(xué)位獲得者。曾在中國礦業(yè)大學(xué)北京研究生部進(jìn)修測量專業(yè)碩士學(xué)位課程，參加國家教委3S集成技術(shù)高級研究班，并應(yīng)邀到德國弗賴堡大學(xué)林學(xué)院進(jìn)行林業(yè)GPS技術(shù)與學(xué)術(shù)交流。

1992年，加盟南方測繪集團(tuán)，歷任北京分公司技術(shù)部經(jīng)理，分公司副經(jīng)理，集團(tuán)副總工程師，總經(jīng)理助理，副總經(jīng)理，為電子測繪儀器國產(chǎn)化作出重大貢獻(xiàn)。

2004年4月，受聘哈爾濱師范大學(xué)特聘教授，10月任校長助理。

俄羅斯自然科學(xué)院外籍院士，中國地理信息系統(tǒng)協(xié)會副秘書長，中國GPS應(yīng)用研究會常務(wù)理事、資源與環(huán)境監(jiān)測專業(yè)委員會常務(wù)副主任委員、秘書長，中國測繪學(xué)會理事，礦山測量專業(yè)委員會副主任委員，中國博士聯(lián)誼會常務(wù)理事，國際礦山測量協(xié)會（ISM）第六專業(yè)委員會副秘書長，北京測繪學(xué)會理事測繪教學(xué)研究委員會副主任委員，教育部全國測繪學(xué)科指導(dǎo)委員會委員，中國林學(xué)會青年工作委員會常委，中國農(nóng)學(xué)會信息學(xué)會理事，國際測繪雜志《GIM》中國唯一編委，《Frontiers of Forestry in China》《北京林業(yè)大學(xué)學(xué)報》《測繪科學(xué)》《礦山測量》《北京測繪》編委，《山東測繪信息》顧問，國家自然科學(xué)基金、國家科技進(jìn)步獎、北京市自然科學(xué)基金、教育部留學(xué)基金、北京市科學(xué)技術(shù)獎評審專家。

北京市高等學(xué)校優(yōu)秀青年骨干教師，北京市有突出貢獻(xiàn)的專家，新世紀(jì)國家百千萬人才計劃國家級人選，北京市農(nóng)業(yè)科技先進(jìn)個人，北京地區(qū)產(chǎn)學(xué)研先進(jìn)個人，首都綠化美化積極分子，中國林業(yè)青年科技獎獲得者，享受國務(wù)院政府特殊津貼。

1．國家863計劃：森林精準(zhǔn)監(jiān)測與信息集成研究（2001AA245031，90萬）；

2．國家自然科學(xué)基金：林冠山地對RTD GPS的影響機(jī)理及剝減對策研究（30070619，2001，14萬）；

3．北京市：北京市精準(zhǔn)林業(yè)與生態(tài)環(huán)境示范基地建設(shè)研究（京農(nóng)0036號，2001，120萬）。

4．北京市：北京市精準(zhǔn)林業(yè)理論與基礎(chǔ)技術(shù)研究（4032015，2003，11．8萬）

5．北京市自然科學(xué)基金（重點項目）：北京市森林植被景觀信息四維表達(dá)應(yīng)用基礎(chǔ)研究（4041002，50萬）

6．國家自然科學(xué)基金（西部生態(tài)環(huán)境重大項目）：森林生物量定位精準(zhǔn)監(jiān)測模型與技術(shù)基礎(chǔ)研究（90302014，80萬）

7．國家863計劃：森林精準(zhǔn)監(jiān)測與重大病蟲害遙感監(jiān)測與預(yù)警技術(shù)研究（2003AA245030，60萬）

8．國家863計劃重大專項子課題：GPS森林調(diào)查規(guī)劃設(shè)計技術(shù)產(chǎn)品開發(fā)與應(yīng)用（2003AA209060-5，10萬）

馮仲科．基于秩虧自由網(wǎng)平差理論的手持GPS面積量測[J]．北京測繪，2003（2）

馮仲科．林地面積的手持GPS量測[J]．測繪科學(xué)，2003（2）

馮仲科．林用電子外業(yè)手簿的開發(fā)與應(yīng)用[J]．北方工業(yè)大學(xué)學(xué)報，2003（3）

馮仲科．論年輕博士生導(dǎo)師素質(zhì)的全面培養(yǎng)[J]．學(xué)位與研究生教育，2003（11）

馮仲科．構(gòu)建林業(yè)信息工程新學(xué)科[J]．中國林業(yè)教育，2004（1）

馮仲科．林冠與山地對GPS定位精度的影響及消減對策[J]．北京林業(yè)大學(xué)學(xué)報，2004（2）

馮仲科．排隊論在滅火兵力出動與3S技術(shù)在滅火指揮系統(tǒng)中的應(yīng)用初探[J]．森林防火，2004（1）

馮仲科．RTD-GPS量測林地面積的模擬實驗[J]．浙江林學(xué)院學(xué)報，2004（2）

馮仲科．基于全站儀和GIS技術(shù)的林業(yè)定位信息研究與應(yīng)用[J]．北京林業(yè)大學(xué)學(xué)報，2004（4）

馮仲科．一種遙感混合分類算法及其在森林分類中的應(yīng)用[J]．四川林勘設(shè)計，2004 （2）

馮仲科．應(yīng)用三次樣條法進(jìn)行林地面積量算的研究[J]．測繪科學(xué)，2004（4）

1．馮仲科．《國外測繪儀器精品集（1）》．測繪出版社．1995年版

2．馮仲科．《測量學(xué)通用教程》．測繪出版社．1996年版

3．馮仲科．《“3S”技術(shù)及應(yīng)用》．中國林業(yè)出版社．1999年版

4．馮仲科．《水源涵養(yǎng)林保護(hù)技術(shù)手冊》．中國林業(yè)出版社．2000年版

5．馮仲科．《精準(zhǔn)林業(yè)》．中國林業(yè)出版社．2002年版

6．馮仲科．《景觀生態(tài)學(xué)》．中國林業(yè)出版社．2003年版

主編《測量學(xué)通用教程》獲中國優(yōu)秀測繪科技圖書二等獎，主持北京市精品課程《測量學(xué)》，主編《測量學(xué)原理》獲北京市精品教材獎（不設(shè)等級）和中國高校測量學(xué)優(yōu)秀教材三等獎，《精準(zhǔn)林業(yè)》和《3S技術(shù)及應(yīng)用》為國際和國內(nèi)該領(lǐng)域的第一部專著或編著，李文華院士、魏子卿院士、關(guān)君蔚院士為二書做序，并給予很高的評價。

主持國家自然科學(xué)基金中國生態(tài)環(huán)境西部行動計劃重大項目、863計劃、863重大專題子項、北京市農(nóng)業(yè)科技攻關(guān)、北京市自然科學(xué)基金重點項目、山東省、國土資源部、國家林業(yè)局、水利部有關(guān)資源監(jiān)測、GPS研制、礦山防爆全站儀、林業(yè)3S集成技術(shù)的科研項目20余項，申報并受理25項國家專利，其中5項發(fā)明專利和4項實用新型專利被授權(quán)，其余進(jìn)入實審；開發(fā)了第一個林業(yè)廣義3S技術(shù)平臺，完成4項軟件著作權(quán)登記。在《測繪學(xué)報》《林業(yè)科學(xué)》《北京林業(yè)大學(xué)學(xué)報》《中國礦業(yè)大學(xué)學(xué)報》等刊物發(fā)表論文160余篇，88篇論文為SCI、EI、ISTP等世界三大檢索系統(tǒng)收錄（其中SCI 3篇，EI 78篇，ISTP 7篇），35篇被中國科學(xué)引文數(shù)據(jù)庫（CSCD）收錄，29篇被CSCD引用85次；多次獲優(yōu)秀論文獎，一篇論文獲國際礦測學(xué)會ISM優(yōu)秀青年學(xué)術(shù)論文獎（2004）。出版教材和專著9部（其中第一作者出版專著2部、教材1部，合著6部）。主編《3S技術(shù)及應(yīng)用》為中國有關(guān)高校碩士博士課程參考教材。

國家科技進(jìn)步二等獎一項（2004年排名第一）

北京市科技進(jìn)步二等獎三項（2002年排名第一，2004年排名第一，2005年排名第三）、三等獎一項（2007年排名第一）

北京市農(nóng)業(yè)科技推廣獎二等獎兩項（2003年排名第一，2004排名第七），三等獎一項（2005年排名第一）

國家測繪科技進(jìn)步二等獎（2005年排名第四）

梁希林業(yè)科學(xué)技術(shù)獎三等獎（2005年排名第三）

教育部科技進(jìn)步二等獎一項（2005年排名第一）

黑龍江省科學(xué)技術(shù)二等獎一項（2007年排名第二）

教育部高等學(xué)�？茖W(xué)技術(shù)發(fā)明二等獎一項（2007年排名第一）

甘肅省科技進(jìn)步獎（2008排名第一）。

2003年，入選濟(jì)南市客座專業(yè)技術(shù)拔尖人才、市政府顧問，天津大學(xué)、天津城建學(xué)院、甘肅林業(yè)職業(yè)技術(shù)學(xué)院等十所大學(xué)兼職教授或特聘教授。

2004年，入選龍江學(xué)者獎勵計劃特聘教授。

2006年，黑龍江省杰出青年基金獲得者，中國高校十大GIS創(chuàng)新人物獎。

2007年，入選為泰山學(xué)者獎勵計劃特聘專家。

2017年，馮仲科獲“何梁何利基金科技創(chuàng)新獎”。