人物介紹
男,1965年7月生,浙江 湖州市人。1987年畢業(yè)于國(guó)防科學(xué)技術(shù)大學(xué)材料系,1987年9月至1992年7月在航天工業(yè)部一六五廠工作任工程師;1995年碩士畢業(yè)于西安交通大學(xué)大學(xué)電子工程系,1995年9月進(jìn)入復(fù)旦大學(xué)物理學(xué)系學(xué)習(xí),獲得理學(xué)博士學(xué)位 ,同年進(jìn)入中國(guó)科學(xué)院上海藥物研究所 博士后流動(dòng)站從事藥物設(shè)計(jì)研究。2000年出站留所工作 ,任副研究員、研究員、博士生導(dǎo)師、課題組長(zhǎng)。2005年1月被聘為華東理工大學(xué)藥學(xué)院 特聘教授。
沈建華研究員的研究領(lǐng)域涉及藥物設(shè)計(jì)、計(jì)算分子生物物理化學(xué)和網(wǎng)格高性能計(jì)算技術(shù)。已在 JACS、JMB、Biophys. J等SCI雜志上發(fā)表論文20余篇,申請(qǐng)專利5項(xiàng)。先后承擔(dān)5項(xiàng)國(guó)家、上海市基金項(xiàng)目,包括國(guó)家“863”高科技基金項(xiàng)目、國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目、上海市青年科技啟明星基金項(xiàng)目和上海市抗非典專項(xiàng)科研基金項(xiàng)目等。獲得2000年中法Servier青年藥物化學(xué)獎(jiǎng)、2003年度上?萍歼M(jìn)步一等獎(jiǎng)和2003年上海市“優(yōu)秀專業(yè)技術(shù)人才”稱號(hào)。
研究方向
針對(duì)脂質(zhì)代謝疾病的藥物設(shè)計(jì):
以 RXR異源二聚的核受體PPAR、LXR、FXR為靶標(biāo)蛋白,利用計(jì)算機(jī)藥物設(shè)計(jì)技術(shù)結(jié)合實(shí)驗(yàn)研究,設(shè)計(jì)出多靶標(biāo)作用的活性化合物結(jié)構(gòu)。然后,通過研究藥物的作用途徑,以期發(fā)現(xiàn)組織特異的具有調(diào)節(jié)血脂、膽固醇和增加胰島素敏感的藥物先導(dǎo)化合物。
針對(duì) SARS CoV病毒半胱氨酸蛋白酶的抑制劑設(shè)計(jì):
通過模建 SARS CoV病毒 半胱氨酸蛋白酶的3維結(jié)構(gòu),利用高性能并行計(jì)算,虛擬篩選多個(gè)化合物或藥物分子數(shù)據(jù)庫(kù),發(fā)現(xiàn)具有不可逆結(jié)合的半胱氨酸蛋白酶抑制活性的化合物,然后通過蛋白-化合物結(jié)合測(cè)試、化合物抑制酶水解活性測(cè)試以及化合物治療和保護(hù)SARS病毒感染細(xì)胞實(shí)驗(yàn),發(fā)現(xiàn)和確證抗SARS病毒藥物 先導(dǎo)化合物。
生物醫(yī)藥復(fù)雜分子體系的分子動(dòng)力學(xué)研究:
應(yīng)用分子動(dòng)力學(xué)方法模擬包括 HIV逆轉(zhuǎn)錄酶、3CL 蛋白酶、核受體等蛋白質(zhì)構(gòu)像運(yùn)動(dòng),從結(jié)構(gòu)和運(yùn)動(dòng)出發(fā)闡明其功能的實(shí)現(xiàn)過程;改進(jìn)靶向分子動(dòng)力學(xué)方法,模擬藥物與靶標(biāo)蛋白(如Hupzine A與乙酰膽堿酯酶)的結(jié)合和解離過程、以及蛋白與蛋白的相互作用(如脂結(jié)合蛋白與核受體)過程,從動(dòng)態(tài)水平上揭示相互作用的分子機(jī)理;采用Car-Parrnello分子動(dòng)力學(xué)模擬,從量子力學(xué)水平研究質(zhì)子在生物環(huán)境中運(yùn)動(dòng)特征。
網(wǎng)格計(jì)算技術(shù)研究:
整合異地、異構(gòu)的高性能計(jì)算資源,集成和優(yōu)化多種藥物設(shè)計(jì)軟件,設(shè)計(jì)新藥研究應(yīng)用網(wǎng)格方案,開發(fā)應(yīng)用網(wǎng)格界面和相關(guān)中間軟件,建立新藥研究應(yīng)用網(wǎng)格并納入國(guó)家網(wǎng)格工程,提供新藥虛擬篩選的網(wǎng)格計(jì)算服務(wù)。
代表論文
Yechun Xu, Jianhua Shen* , et al., How Does Huperzine A Enter and Leave the Binding Gorge of Acetylcholinesterase? Steered Molecular Dynamics Simulations J. AM. CHEM. SOC . ( 2003) 125, 11340-11349.
Jianhua Shen, et al., Virtual Screening on Natural Products for Discovering Active Compounds and Target Information, Current Medicinal Chemistry , ( 2003) 10, 2327-2342.
Lingling Shen, Jianhua Shen* , et al. Biophys. Journal, (2003) 84 , 1-17. Steered Molecular Dynamics Simulation on the Binding of NNRTI to HIV-1 RT.
Xiaoqin Huang, Jianhua Shen* , et al., Biophysical Journal , (2003) 84, 171-184. Molecular Dynamics Simulations on SDF -1a : Binding with CXCR4 Receptor
Jianhua Shen , Hualiang Jiang and Kaixian Chen, “Molecular Simulation and Design in Drug Discovery”, Jun. 2002, Edinburg , The BBSRC/CNCBD Workshop on E-science.
Feng Cheng, Jianhua Shen* et al., Biophysical Journal, (2002) 83, 753-762. Steered Molecular Dynamics Simulations on the “Tail Helix Latch” Hypothesis in the Gelsolin Activation Process
s of the recognition of the Scorpion toxin P05 with the small-conductance Calcium-activated potassium channels.