明治維新后加入政府海軍，1871年(明治4年)任海軍大尉，1877年任日進(jìn)號艦長輔.1882年任海軍大佐，先后任龍驤、扶桑、比睿等艦只艦長.1885年任橫須賀造船所長兼橫須賀鎮(zhèn)守府次長、同年任建造中浪速號回航委員長。該艦服役后任艦長.1886年封海軍少將.就任海軍省第一局長兼海軍大學(xué)校校長.接待了來訪的清國艦隊，在參觀了定遠(yuǎn)艦后承認(rèn)是：“如果現(xiàn)在和清國開戰(zhàn)，沒有勝利的可能，只要u2018定遠(yuǎn)u2019和u2018鎮(zhèn)遠(yuǎn)u2019兩艦就能把全部常備艦隊送到海底�！�1892年升海軍中將，橫須賀鎮(zhèn)守府長官。1893年（明治26年）任常備艦隊長官。

主要軍事作戰(zhàn)計劃

1894年(明治27年)7月16日日本御前會議決定對中國開戰(zhàn)，7月18日根據(jù)軍令部官房主事山本權(quán)兵衛(wèi)大佐提出的方案，將已經(jīng)改名為“西海艦隊”了的警備艦隊和常備艦隊組成“聯(lián)合艦隊”。這是日本海軍第一次組建聯(lián)合艦隊，伊東祐亨海軍中將為首任司令長官，準(zhǔn)備參加甲午戰(zhàn)爭，7月23日伊東祐亨奉大本營作戰(zhàn)命令，親率軍艦15艘、魚雷艇6艘、偵查艇一艘，由佐世保軍港出發(fā)，向朝鮮西海岸進(jìn)發(fā)。25日派第一游擊艦隊以突然襲擊手段，發(fā)動不宣而戰(zhàn)的豐島海戰(zhàn)，挑起中日戰(zhàn)爭。8月1日，中日兩國互相正式宣戰(zhàn)后，伊東佑亨遵照大本營的“作戰(zhàn)大方針”，積極尋求與中國海軍進(jìn)行主力決戰(zhàn)，以奪取制海權(quán)。

主要參與軍事行動

1894年9月16日，伊東佑亨率聯(lián)合艦隊軍艦12艘，由朝鮮漁隱洞錨泊地出發(fā)，向黃海北部一帶游弋。17日凌晨到達(dá)海洋島，經(jīng)過偵察，未發(fā)現(xiàn)北洋艦隊，乃改變航向，向東北方向的大洋河口前進(jìn)。10時30分發(fā)現(xiàn)北洋艦隊12時50分左右，日本聯(lián)合艦隊與中國清朝北洋水師于黃海發(fā)生黃海海戰(zhàn)，伊東祐亨率三景艦在本隊，后面還有軍令部長樺山資紀(jì)壓陣督戰(zhàn)，前面坪井航三少將率第一游擊隊4艘巡洋艦快速穿插，連續(xù)打擊中國軍艦橫隊兩翼的弱艦，當(dāng)日15：26分旗艦松島號被鎮(zhèn)遠(yuǎn)的30.5公分主炮擊中，頓時把松島號變成了海上活動地獄。喪失了作戰(zhàn)能力。16：07伊東祐亨司令官升起了“失控”信號旗，企圖退出戰(zhàn)斗行列。然而他的軍艦旗手的旗語太差，打的信號旗沒人能看懂，被日軍各艦長理解為“各自為戰(zhàn)”。到后來伊東只好撤銷這個信號，再度擔(dān)負(fù)起旗艦的職責(zé)，并于18：00點(diǎn)率隊撤出戰(zhàn)場整理，到20：00才將旗艦轉(zhuǎn)移到橋立�？紤]到天色已晚，原旗艦松島號已經(jīng)失去戰(zhàn)斗力，比叡，西京丸失蹤，加上北洋水師也擁有魚雷艇，追上去打夜戰(zhàn)聯(lián)合艦隊占上風(fēng)的把握不是很大，伊東祐亨決定收兵。大東溝海戰(zhàn)就這么結(jié)束了。黃海大戰(zhàn)的結(jié)果是日本艦隊擊敗了清國艦隊，擊沉對方5艘巡洋艦而自己沒有一艘沉沒。日本取得黃海制海權(quán)，這是甲午戰(zhàn)爭中，對日本有利的重大轉(zhuǎn)折點(diǎn)。

電影《甲午大海戰(zhàn)》伊東佑亨1894年10月，日軍分兩路侵入中國。第一軍由朝鮮新義州越鴨綠江入侵遼東地區(qū)，第二軍經(jīng)海路在聯(lián)合艦隊掩護(hù)下，于遼東半島花園口登陸，入侵遼南地區(qū)。伊東佑亨在完成護(hù)航任務(wù)后，又配合第二軍的陸上作戰(zhàn)，于11月7日和22日分別攻占了大連和旅順。 日軍在侵占大連灣和旅順口之后，就如何擴(kuò)大侵略問題展開討論。第一軍司令山縣有朋提出《征清三策》，要求北上遼陽，南下直隸，總理伊藤博文提出《進(jìn)擊威海衛(wèi)，攻略臺灣方略》，伊東佑亨和第二軍司令大山巖聯(lián)名上奏，認(rèn)為“如繼續(xù)作戰(zhàn)，莫如進(jìn)兵山東半島，海陸夾擊，殲滅北洋水師”。大本營遂采納了這個提議，決定進(jìn)攻山東半島，占領(lǐng)威海衛(wèi)、消滅北洋艦隊。同時組成了“山東作戰(zhàn)軍”。 12月24日伊東佑亨選定榮成灣為登陸地點(diǎn)，為了迷惑清軍，還派第一游記艦隊于1895年1月18日炮擊登州，轉(zhuǎn)移清軍視線。1月20日率領(lǐng)聯(lián)合艦隊護(hù)送第二軍到山東半島榮成灣附近登陸，1月25日日軍由榮成兵分兩路向威海進(jìn)攻，30日攻占了威海南幫陸路炮臺，此后水陸合圍，北洋艦隊陷入絕境。合圍劉公島后，伊東佑亨數(shù)次致書北洋艦隊司令丁汝昌，相其勸降，均被丁汝昌嚴(yán)詞拒絕。 在勸降無效的情況下，自2月2日至4日，日軍開始輪番炮轟劉公島和北洋艦隊，并在4日、5日夜間派魚雷艇潛入港內(nèi)偷襲，相繼擊沉北洋艦隊定遠(yuǎn)、來遠(yuǎn)、威遠(yuǎn)等艦。2月13日北洋艦隊在威海衛(wèi)投降，北洋艦隊提督丁汝昌在前一天服毒自殺，伊東祐亨將繳獲的艦船商船康濟(jì)號遣送丁汝昌遺體回國，日本認(rèn)為這種禮儀使世界驚嘆。1895年8月接替樺山資紀(jì)任軍令部長 ，封子爵。1898年封海軍大將，日俄戰(zhàn)爭中在大本營任軍令部長，1905年日俄戰(zhàn)爭結(jié)束后封元帥，但其對政治不感興趣，1907年(明治40年)封伯爵，授従一位功一級金鵄勲章、大勲位菊花大綬章。