人物簡介
韓斌(1963.4-),安徽廬江人,研究員,F(xiàn)為中國科學(xué)院國家基因研究中心主任;中科院上海生命科學(xué)研究院植物生理生態(tài)所副所長;科技部863生物領(lǐng)域?qū)<医M成員,主持多項(xiàng)國家重大科研項(xiàng)目。
1988年7月從廣西大學(xué)農(nóng)學(xué)院畢業(yè),獲分子遺傳學(xué)碩士學(xué)位;獲得英國Gatsby Charitable Foundation獎(jiǎng)學(xué)金,于1989年2月赴英國著名的John Innes中心Sainsbury 實(shí)驗(yàn)室攻讀博士學(xué)位,從事植物病原菌分子遺傳學(xué)研究。1992年11月獲英國塞理斯伯里實(shí)驗(yàn)室約翰英納斯中心博士學(xué)位。1998年8月,正值中國水稻基因組測序計(jì)劃起步階段,毅然回國工作。從2002年起,擔(dān)任了中國科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院植物生理與生態(tài)研究所副所長。2008年,被任命為中科院北京基因組研究所副所長。 2011年12月2日任中科院上海生命科學(xué)研究院副院長。
回國后,韓斌帶領(lǐng)中心全體研究人員,出色完成國際水稻基因組計(jì)劃 粳稻第四號(hào)染色體的精確測序任務(wù),并取得多項(xiàng)重要的創(chuàng)新性研究成果。作為國內(nèi)首次完成大基因組單條染色體的精確測序,這是我國在生物領(lǐng)域基礎(chǔ)研究上的重大突破,具有深遠(yuǎn)的學(xué)術(shù)意義和經(jīng)濟(jì)前景。該成果也被兩院院士評為2002年全國"十大"科技新聞榜首之一。
韓斌研究員長期從事基因組學(xué)的基礎(chǔ)研究,并致力于利用不斷發(fā)展的基因組學(xué)的理論和方法探索水稻基因組結(jié)構(gòu)、功能和遺傳改良潛力。完成了對水稻第四號(hào)染色體的精確測序和綜合分析,發(fā)展了秈、粳稻全基因組及基因水平上的比較與功能研究系統(tǒng),建立了以第二代測序儀為基礎(chǔ)的高通量基因型分析平臺(tái)和轉(zhuǎn)錄組分析平臺(tái)。有關(guān)研究結(jié)果先后發(fā)表在Nature, Genome Research, Plant Cell等國際知名學(xué)術(shù)刊物上。
個(gè)人簡歷
1981-1985 安徽師范大學(xué)生物系 學(xué)士
1985-1988 廣西農(nóng)學(xué)院分子遺傳學(xué)研究室 碩士
1985-1986 華東師范大學(xué)生物系(聯(lián)合培養(yǎng)) 碩士
1989-1992英國John Innes Centre 博士
1992-1998英國劍橋大學(xué)植物科學(xué)系 博士后
1998-至今中國科學(xué)院國家基因研究中心 主任,水稻基因組測序工作專家組組長
2002-至今中國科學(xué)院上海生科院植物生理生態(tài)所 副所長
2008-2011中國科學(xué)院 北京基因組研究所 副所長
2011-至今中國科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院副院長
所獲獎(jiǎng)項(xiàng)
1、2003年3月,韓斌博士獲得由中國科學(xué)院精神文明建設(shè)領(lǐng)導(dǎo)小組頒發(fā)的:首屆“中國科學(xué)院創(chuàng)新文化建設(shè)先進(jìn)個(gè)人”光榮稱號(hào)。
2、2003年3月19日,上海生命科學(xué)研究院國家基因中心和遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所,由中國科學(xué)院授予“中國科學(xué)院2001-2002年度重大創(chuàng)新貢獻(xiàn)團(tuán)隊(duì)”稱號(hào)。
3、2003年4月,中科院國家基因研究中心由共青團(tuán)上海市委員會(huì)命為2001-2002年度上海市新長征突擊隊(duì)。
4、2003年9月,中央組織部、人事部、中央宣傳部、教育部、中央統(tǒng)戰(zhàn)部和科學(xué)技術(shù)部授予韓斌博士 “留學(xué)回國人員成就獎(jiǎng)”。
5、2003年12月28日,我中心的“水稻基因組第四號(hào)染色體測序及分析”項(xiàng)目獲得上海市科學(xué)技術(shù)進(jìn)步獎(jiǎng)一等獎(jiǎng),排名第一。
6、2004年1月,韓斌博士榮獲上海市優(yōu)秀留學(xué)回國人才稱號(hào)。
7、2004年4月,韓斌博士被評為2001-2003年度上海市勞動(dòng)模范。
8、2004年10月,韓斌博士榮獲“中國科學(xué)院優(yōu)秀研究生指導(dǎo)教師”稱號(hào)。
9、2006年,被列入“上海市領(lǐng)軍人才培養(yǎng)計(jì)劃”。
10、2007年12月,獲得國家自然科學(xué)獎(jiǎng)二等獎(jiǎng)。
11、2018年1月8日,2017年度國家科學(xué)技術(shù)獎(jiǎng)勵(lì)大會(huì)在人民大會(huì)堂開幕,韓斌憑借參與的水稻高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)性狀形成的分子機(jī)理及品種設(shè)計(jì),獲得2017年度國家自然科學(xué)獎(jiǎng)一等獎(jiǎng)。
學(xué)術(shù)成果
韓斌研究員主要的研究方向是水稻基因組測序、比較基因組學(xué)研究和水稻功能基因組學(xué)研究。在過去的幾年里,他和他的實(shí)驗(yàn)室構(gòu)建了水稻四號(hào)染色體的物理圖譜,并在此基礎(chǔ)上完成了水稻四號(hào)染色體的精細(xì)測序和分析,同時(shí)開發(fā)了覆蓋水稻四號(hào)染色體的芯片并用它鑒定了四號(hào)染色體上基因的表達(dá)模式。以上的這些成果發(fā)表在《自然》、《基因組研究》和《植物細(xì)胞》等雜志上。在最近的幾年里,他和他的實(shí)驗(yàn)室開始利用新一代測序技術(shù)開發(fā)高通量的基因分型平臺(tái)和轉(zhuǎn)錄組分析平臺(tái),并在此基礎(chǔ)上研究水稻基因組的遺傳變異,進(jìn)行重要農(nóng)藝性狀相關(guān)基因的遺傳定位,系統(tǒng)分析和鑒定水稻基因的轉(zhuǎn)錄本及表達(dá)模式。以上的這些成果發(fā)表在《自然遺傳學(xué)》和《基因組研究》等雜志上。在韓斌研究員獲得過多項(xiàng)獎(jiǎng)項(xiàng)和榮譽(yù)中,最主要的是2007年國家自然科學(xué)二等獎(jiǎng)。
1. 水稻4號(hào)染色體精細(xì)物理圖的構(gòu)建及基因組精確測序
通過整合分子標(biāo)記、克隆末端序列、DNA指紋等數(shù)據(jù),運(yùn)用分子、染色體熒光原位雜交和比較基因組分析的方法,構(gòu)建了粳稻4號(hào)染色體高精確度和高覆蓋率(98.7%)的物理圖。鑒定了4號(hào)染色體的物理長度以及物理圖距和遺傳圖距的對應(yīng)關(guān)系;谌旧w精細(xì)物理圖,采用克隆連克隆法的基因組測序方法,完成水稻4號(hào)染色體的精確測序和分析。研究成果發(fā)表在2002年11月21日出版的Nature上。
之后繼續(xù)承擔(dān)了水稻全部12條染色體著絲粒序列和結(jié)構(gòu)的分析,以及秈、粳稻全基因組序列比較,直到2005年國際水稻基因組測序計(jì)劃完成。
2. 水稻4號(hào)染色體結(jié)構(gòu)及功能的深入研究
在精細(xì)物理圖構(gòu)建和精確測序的基礎(chǔ)上,突破了拼裝高度重復(fù)序列的技術(shù)難題,成功鑒定了覆蓋著絲粒區(qū)域的大片段克隆,完成了序列測定和組裝。發(fā)現(xiàn)水稻4號(hào)染色體著絲粒核心區(qū)是由近360個(gè)高度重復(fù)的特異序列組成,并將這些重復(fù)序列組裝成18個(gè)串聯(lián)式重復(fù)區(qū)段,還在該區(qū)域鑒定一些編碼基因。
在精確測序的基礎(chǔ)上,研制了水稻4號(hào)染色體的覆瓦式排列的特異芯片,并通過芯片雜交分析,開展了秈、粳稻基因比較表達(dá)譜分析和轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子的研究。鑒定了水稻4號(hào)染色體上一批新的表達(dá)基因,比較了秈粳基因功能和調(diào)控方面的差異。得出了水稻染色體上相鄰排列的基因有很高的協(xié)同表達(dá)調(diào)控特征等重要結(jié)論。還印證了之前對4號(hào)染色體基因分布規(guī)律的推測結(jié)果。
3. 比較基因組和功能基因組研究
通過對秈、粳稻基因組的比較分析,系統(tǒng)鑒定了秈粳之間序列多態(tài)性分布和頻率。隨著水稻基因組精確測序的完成,建立水稻轉(zhuǎn)基因?qū)嶒?yàn)室,建設(shè)了一定規(guī)模的溫室和試驗(yàn)田。高通量研究水稻基因功能,對一萬多條秈稻全長cDNA進(jìn)行了克隆,測序和分析。同時(shí),通過比較基因組學(xué)研究了轉(zhuǎn)座子突變可能對水稻基因功能分化產(chǎn)生的影響。結(jié)合基因家族的比較分析和表達(dá)組、轉(zhuǎn)基因、過表達(dá)等功能分析,發(fā)現(xiàn)了一系列在水稻抗熱,抗旱和抗鹽生理過程中起重要作用的基因。
4. 建立以第二代測序儀為基礎(chǔ)的高通量功能基因組研究平臺(tái)
最近,新一代DNA測序方法的誕生標(biāo)志著生命科學(xué)技術(shù)的又一次飛躍,為大規(guī)模發(fā)現(xiàn)和利用水稻遺傳資源開辟了有效的新途徑。這種新方法集低時(shí)耗、高性價(jià)比、高密度和高精度等眾多優(yōu)點(diǎn)于一身。采用這一方法完成了一組秈、粳稻重組自交系的基因型鑒定,與目前廣泛應(yīng)用的分子標(biāo)記相比,新方法在速度和精度上有了大大提高。其精度是之前傳統(tǒng)的方法手段無法實(shí)現(xiàn)的。
同時(shí)嘗試的高通量功能基因組研究的新技術(shù)還包括表達(dá)組和染色質(zhì)免疫沉淀測序。迅速、大量地鑒定覆蓋全基因組的單核苷酸多態(tài)性,全面深入掌握我國水稻資源的遺傳多樣性。