1999年6月，調(diào)入中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院任教，繼續(xù)從事植物學(xué)和生態(tài)學(xué)的教學(xué)和研究工作。現(xiàn)為安徽省細(xì)胞生物學(xué)學(xué)會(huì)會(huì)員，中國(guó)生態(tài)學(xué)學(xué)會(huì)會(huì)員，擔(dān)任中國(guó)科大科學(xué)考察探險(xiǎn)協(xié)會(huì)顧問(wèn)，中國(guó)探險(xiǎn)協(xié)會(huì)第4屆理事，中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué)教學(xué)督導(dǎo)員，生命科學(xué)學(xué)院教務(wù)辦公室主任。

　　在植物學(xué)研究方面，長(zhǎng)期以來(lái)，主要研究華東地區(qū)的植物區(qū)系和植被，發(fā)表了5個(gè)被子植物新物種，均被英國(guó)皇家植物園的《邱園索引》（Index Kewensis）所收錄；參加了《安徽植物志》（共5卷）的編寫和編輯工作，并且是主要完成人之一。在生態(tài)學(xué)研究方面，近年來(lái)在國(guó)內(nèi)首先開(kāi)展了利用同步輻射X射線熒光檢測(cè)植物體重金屬含量的工作，以及研究我國(guó)城鄉(xiāng)物質(zhì)循環(huán)和水資源及水污染問(wèn)題。為了解決黃河斷流問(wèn)題，1999年1月26日在《光明日?qǐng)?bào)》上發(fā)表了《減少黃河中上游灌溉用水》一文，編輯部特地加了編者按語(yǔ)，中央人民廣播電臺(tái)播發(fā)了此文，《上海環(huán)境在線》網(wǎng)站轉(zhuǎn)載了全文，該文對(duì)于國(guó)家在后來(lái)治理黃河斷流時(shí)提供了重要參考價(jià)值。

　　目前，在國(guó)內(nèi)核心期刊上發(fā)表論文約50篇，在國(guó)外刊物上發(fā)表論文1篇，其中屬于SCI和EI收錄的6篇。根據(jù)教育部中國(guó)教育在線網(wǎng)站2003年公布的高等院校CSCD論文被引用頻次按著者排序，被并列第28位，引用論文數(shù)8篇。

　　主要代表性論文有：

　　[1] 沈顯生. 安徽大別山天堂寨山區(qū)植物區(qū)系的研究，植物學(xué)報(bào)，1986，28（6）：657-663.

　　[2] 沈顯生. 葡萄屬一新種，植物分類學(xué)報(bào)，1989，27（4）：304-305.

　　[3] 沈顯生. 中國(guó)苦草屬一新種，西北植物學(xué)報(bào)，2000，20（5）：889—891.

　　[4] 沈顯生，孫立廣，尹雪斌，等. 南極喬治王島6種苔蘚植物的X熒光分析，極地研究，2001，13（1）：50—56.

　　[5] 沈顯生，安徽苦草屬一新種，植物分類學(xué)報(bào)，2001，39（6）：571—574.

　　[6] Shen Xiansheng, Kang Shixiu, Sun Liguang, et al. SR-XRF Analysis of Polytrichum in the Fildes Peninsula, Antarctica, Chinese Jour. of Polar Science, 2002, 13（2）：111—116.

　　[7] 沈顯生 孫灝, 康士秀，等. 安徽鐘山鐵礦植物重元素X射線熒光研究及環(huán)境指示意義， 核技術(shù), 2002，25（10）：779—782.

　　[8] H. Qian, Z. M. Wu, X. S. Shen et al., Large-scale Phytogeographical Patterns in East Asia in Relation to Latitudinal and Climatic Gradients, Jour. of Biogeography, 2003,30:129—141.

　　[9] 沈顯生，大別山區(qū)谷底平原生態(tài)系統(tǒng)的特征及社會(huì)發(fā)展中的若干問(wèn)題，生態(tài)學(xué)雜志，2004，23（2）：158—160.

　　[10] 李樹(shù)美，沈顯生，張文銳，布氏輪藻生殖器官環(huán)境掃描電鏡的觀察，微體古生物學(xué)報(bào)，2004，21（3）：342—345.

　　已經(jīng)出版了《中國(guó)東部高等植物分科檢索與圖譜》和《植物學(xué)拉丁文》2本專著，其中的《植物學(xué)拉丁文》是由我國(guó)正式編著出版的第一本植物學(xué)拉丁文，填補(bǔ)了國(guó)內(nèi)研究生植物學(xué)拉丁文教材的空白；主編了《植物生物學(xué)實(shí)驗(yàn)》；參編了《安徽植物志》、《植物學(xué)》（國(guó)家100門精品教材）、《植物學(xué)野外實(shí)習(xí)指導(dǎo)》和《植物學(xué)實(shí)驗(yàn)實(shí)習(xí)》。

　　在《教育與現(xiàn)代化》和《生物學(xué)教學(xué)》等雜志上，共發(fā)表教學(xué)研究論文10余篇。主講的《植物學(xué)》課程已經(jīng)列為校級(jí)精品課程。

　　在教學(xué)和研究工作之余，擅長(zhǎng)植物工筆畫，并曾為《安徽植物志》和《中條山樹(shù)木志》繪制植物形態(tài)與解剖插圖800余幅。

　　主持的全校非生物學(xué)專業(yè)本科生《生命科學(xué)導(dǎo)論》課程建設(shè)校級(jí)教學(xué)研究項(xiàng)目，獲得了2005年安徽省教學(xué)優(yōu)秀獎(jiǎng)三等獎(jiǎng)；參加由武漢大學(xué)主持6所大學(xué)聯(lián)合組織實(shí)施的教育部教學(xué)改革項(xiàng)目——《非生物學(xué)專業(yè)生命科學(xué)導(dǎo)論的教學(xué)改革與實(shí)踐》，獲得了2005年湖北省教學(xué)優(yōu)秀獎(jiǎng)一等獎(jiǎng)。另外，曾獲得過(guò)陳香梅教學(xué)獎(jiǎng)、王寬誠(chéng)育才獎(jiǎng)和安徽省優(yōu)秀德育工作者等獎(jiǎng)勵(lì)。