柴敏長(zhǎng)期從事番茄抗病遺傳育種與種質(zhì)創(chuàng)新研究，主持承擔(dān)了北京市科委、農(nóng)業(yè)部“948”、科技部“863”及“863”重大專項(xiàng)子課題、國(guó)家人事部留學(xué)人員擇優(yōu)項(xiàng)目和國(guó)家科技支撐計(jì)劃子課題等10余項(xiàng)。

1.摸清了番茄多茸毛Wo基因的遺傳規(guī)律，對(duì)國(guó)內(nèi)番茄育種利用Wo多茸毛基因具有重要的指導(dǎo)作用。主要參加培育的“雙抗二號(hào)”品種，填補(bǔ)了國(guó)內(nèi)番茄抗葉霉病育種空白。對(duì)番茄葉霉病病原菌的分化監(jiān)測(cè)研究，為國(guó)內(nèi)番茄抗葉霉病育種提供了可靠的依據(jù)。

2.番茄種質(zhì)資源的挖掘與創(chuàng)新：全面拓寬番茄種質(zhì)資源，先后引進(jìn)評(píng)價(jià)了3百余份優(yōu)異種質(zhì)，其中包括全套葉霉病抗原，根結(jié)線蟲(chóng)、枯萎病和黃萎病等設(shè)施栽培連作障礙病害的抗原，晚疫病鑒別寄主和TYLCV抗原，長(zhǎng)貨架耐貯運(yùn)資源，耐熱和特色番茄種質(zhì)資源等，并已在不同層面開(kāi)展了遺傳改良及種質(zhì)創(chuàng)新研究。獲“948”項(xiàng)目的資助，在國(guó)內(nèi)率先開(kāi)展番茄抗蟲(chóng)核心種質(zhì)創(chuàng)新研究，通過(guò)田間抗蟲(chóng)性評(píng)價(jià)、遠(yuǎn)緣雜交及抗蟲(chóng)性遺傳研究，獲得對(duì)斑潛蠅呈免疫抗性且受單顯性主效基因控制的優(yōu)異種質(zhì)，為深入開(kāi)展抗蟲(chóng)基因分子標(biāo)記、基因定位及克隆奠定了良好基礎(chǔ)；在國(guó)內(nèi)率先育成具有粉色遺傳背景的長(zhǎng)貨架耐貯番茄自交系。

3.分子標(biāo)記輔助育種技術(shù)研究：“十五”以來(lái)，在“863”項(xiàng)目的支持下，獲得了番茄抗葉霉病Cf5、Cf9、Cf11和Cf19的CAPS標(biāo)記，建立了番茄抗根結(jié)線蟲(chóng)Mi基因的MAS技術(shù)，并利用分子標(biāo)記技術(shù)，展開(kāi)了主要番茄品種、遠(yuǎn)緣種間雜種及葉霉病菌主要生理小種DNA指紋鑒定研究，為抗病基因聚合及育種水平的提高提供了強(qiáng)有力的技術(shù)支撐。

4.育成品種類型齊全、滿足各種消費(fèi)需求的配套番茄新品種：經(jīng)過(guò)10余年的努力，已培育出粉色硬肉大果、紅色硬肉耐貯運(yùn)中型果和特色京丹三大系列20余個(gè)番茄新品種。國(guó)內(nèi)首批推出粉色抗線蟲(chóng)番茄品種，并率先在北京及全國(guó)根結(jié)線蟲(chóng)嚴(yán)重的省份和地區(qū)試種成功，突破了粉果番茄品種根結(jié)線蟲(chóng)防治的難題。特色番茄的選育居國(guó)內(nèi)外先進(jìn)水平，培育出世界上第一個(gè)100%純綠熟特色番茄品種京丹“綠寶石”、番茄樹(shù)專用品種“京丹6號(hào)”等，京丹系列特色番茄已成為國(guó)內(nèi)知名品牌，在都市型現(xiàn)代農(nóng)業(yè)中發(fā)揮著重要作用。部分特色番茄品種的種子已出口到國(guó)外。主持培育的番茄品種佳粉17號(hào)，2001年通過(guò)北京市品種審定，2004年通過(guò)全國(guó)區(qū)試并獲認(rèn)定；“佳紅5號(hào)”申報(bào)國(guó)家新品種保護(hù)（20050485）；特色番茄京丹“綠寶石”申報(bào)國(guó)家工商總局商標(biāo)注冊(cè)（4018248）；

5.獲北京市科技進(jìn)步二等獎(jiǎng)等4項(xiàng)市級(jí)以上成果獎(jiǎng)勵(lì)。

6.發(fā)表《番茄新品種及栽培技術(shù)》、《茄果類特色新品種及栽培技術(shù)》等2部著作，以第一或通訊作者，在學(xué)報(bào)、國(guó)家核心期刊等學(xué)術(shù)刊物上發(fā)表有價(jià)值的學(xué)術(shù)論文20余篇；多次在國(guó)內(nèi)、外相關(guān)領(lǐng)域?qū)W術(shù)會(huì)上作大會(huì)報(bào)告和特邀報(bào)告。