1930年后任紅十二軍第一縱隊縱隊長、第三十四師師長，紅四軍第十一師師長、軍長，紅一軍團第十師、第三師師長，閩贛軍區(qū)第二十一師師長，紅軍大學代理校長，紅八軍團軍團長兼第二十一師師長，第二十三師師長，紅一方面軍參謀長。并參加了長征。到達陜北后，任紅軍學校校長，紅軍大學校務部部長，中央教導師（慶陽步兵學校）師長，抗大第二分校教育長。1937年參加過秋收起義的部分官員在延安與毛澤東合影，其中有賴傳珠、張宗遜、孫開楚、賴毅、譚冠三、楊立三、陳伯鈞、龍開富、周昆、譚希林、羅榮桓、譚政、劉型、楊梅生、胡友才等人。照片上毛澤東題字為：“一九二七年秋收暴動成立工農(nóng)革命軍第一軍第一師，至今尚存之人約數(shù)十人，此為一部分�！奔t軍改編八路軍時，他被任命為第115師參謀長。并且是中央軍委23個委員之一。

　　在115師初過黃河的幾仗中，周昆也是戰(zhàn)功卓著。太原淪陷后，115師奉中央的命令開赴呂梁山建立晉西根據(jù)地�？删驮谶@時，誰知這位師參謀長周昆竟然會攜款而逃！ 當時師司令部工作人員把此消息報告師長林彪，本來就沉默寡言的林師長，更是面無表情，一言不發(fā)。他雖未象徐海東聽說張紹東出逃而為之吐血，但這件事對他來說畢竟是個很大的打擊，他常常一個人獨自去散步，思考這個周昆為什么會出逃呢？直到半個月后被閻錫山手下一個名叫王潞生的哨兵，看到身穿日軍大衣（平型關戰(zhàn)斗繳獲的戰(zhàn)利品）騎高頭大馬的將軍，以為是日本鬼子，便舉槍射擊，這家伙的槍法還真準，槍聲一響，林師長應聲落馬，從此，這位著名的戰(zhàn)將，只好離開前線去蘇聯(lián)治病。

　　周昆攜3萬元錢潛逃了，這樣高級別的官員離隊，在中共和八路軍中，尚屬首次。

　　那么離開隊伍之后，他究竟去了那里？史書已經(jīng)無有任何記載。分析認為：移民異地，隱姓埋名，憂郁而終。這就是他日后再無任何消息的原因所在。

　　周昆潛逃后，第115師參謀長一職長期空缺。1938年3月8日，八路軍總部任命王秉璋為參謀處長，司令部的工作由王秉璋負責，行使參謀長的權責。以周昆的資歷和能力，他不當逃兵的話，肯定是開國將帥里的大將。

　　對于周昆出走，目前有三種說法。

　　其一，1938年2月間，115師周昆參謀長到八路軍總部去開會，領取了6萬元軍費，這是國民黨政府發(fā)給115師的最后（最后二字不妥，國民黨政府撥給八路軍的軍費應該領至1940年底）一筆經(jīng)費六萬元。會后，周昆攜3萬元錢潛逃回了湖南老家平江，此后再未離開過。建國后，組織上對他做過調(diào)查，結果證實他沒有參加過任何反革命組織，也沒有任何其它反革命行為。從這一點出發(fā)判斷，他當年潛逃的動機是非政治性的。（王秉璋的回憶錄）

　　其二，此說傳來比較簡單，周昆在參加國民政府在武漢召開的參謀長聯(lián)席會議時，孔祥熙開給他一張3萬元支票，他是帶著這3萬元支票跑掉的。

　　其三，115師周昆參謀長到八路軍總部去開會，領取了10萬元軍費，周昆自己取了3萬元，將剩余的7萬元讓警衛(wèi)員帶回師部，這一說與上基本相同，只是數(shù)字的差異。

　　這3種說法究竟那一種更合理呢？應該是其一。理由是，第一，國民黨給八路軍的軍費是每月50萬元，這是周恩來與顧祝同在西安談判時定的，但由于延安的中央機關與陜甘寧邊區(qū)政府都不在此列，八路軍總部要將這50萬元軍費，分一部分來供養(yǎng)延安，所以115師不可能分的太多，因為115師出師的人數(shù)最多，而且是作戰(zhàn)的主力，但此時新設立了晉察冀軍區(qū)，且344旅此時與129師在一起，由八路軍總部直接指揮。一個月給115師6萬元的軍費應該是合理的。第二，當時師部沒有參謀處長，王秉璋任師作戰(zhàn)科長，周昆讓警衛(wèi)員將此款轉(zhuǎn)給王也是合理的。第三，為何否定孔祥熙給的支票一說？此前周確定在武漢參加過全國參謀長聯(lián)席會議，但孔祥熙不可能給他3萬元的支票，因為中央即使額外獎賞給115師3萬元（假設），也會通過八路軍總部轉(zhuǎn)達，而肯定不會直接給了115師的，這是一個制度。

　　那么周昆離開部隊到哪里去了？亦有四種說法。

　　其一，周昆攜3萬元錢潛逃回了湖南老家平江，找了一個村子住下來做買賣，此后再未離開過。建國后組織上對他進行過調(diào)查，結果證實他沒有參加過任何反革命組織，也沒有任何其它反革命行為。

　　其二，傳說周昆離開八路軍之后去了瑞士，并成為杰出的慈善家。中國改革開放后，大慈善家周昆將軍出于對國家的忠誠，曾經(jīng)化名回到大陸，當時他已經(jīng)是70多歲的老人。沒人認得他，他也不認得別人。周昆又積極的為人民做出了貢獻。

　　其三，周和一個資本家小姐攜款逃到了境外，結果在花光了公款后，被小姐拋棄，后回國，被人打死。

　　其四，文革中他曾受罪，被紅衛(wèi)兵天天揪斗，死在紅衛(wèi)兵的手里了。

　　其實這四種說法都是沒有任何依據(jù)的。

　　第一，他如果回到平江老家，象他這樣有名望的人，當?shù)夭粫�沒有人認識他，那么國民黨的中統(tǒng)、軍統(tǒng)也會找到他，并利用此大肆宣傳，再說他能活到建國后，土改、肅反、三反五反、反右、四清、文革……許多的政治運動，一定會被當?shù)厝送诔鰜砼�斗的，不會成為一個謎。

　　第二，作為一個軍人，拿了軍餉去做慈善家，也不很合理，再說如果有人知道他在中國改革開放后，曾經(jīng)化名回到大陸，積極為人民做貢獻，難道件事還能隱瞞了記者嗎？

　　第三，說他帶資本家小姐攜款逃到境外，花光公款后被小姐拋棄，后回國被人打死。這也會被曝光，一定不會沒有任何痕跡留給媒體。

　　其四之說就理會荒謬了。

　　那么他究竟去了那里？真的無人知曉了。是什么原因使他選擇人生路上這一步錯棋呢？第一種是見財起意；這種情況應該是不可能的，如果是見財起意，6萬元錢都在他的手上，他完全可以全部帶走，沒有必要讓警衛(wèi)員送回去一半，自己只拐一半，有人說取3萬留3萬是保全自己的生命。1個師1個月的軍費全部沒有了的話，八路軍能不四處追殺嗎？所以留3萬是保全之策，這是周的聰明之處。但凡要攜款逃之，定是要冒風險的，他不會確信留下那3萬元，八路軍就不去查找他的下落。第二種是貪生怕死；周昆在紅軍時期作戰(zhàn)非常勇敢，特別是在強渡湘江中其21師遭受了極大的損失，他都挺過來了。抗日戰(zhàn)爭時期的條件要比紅軍時期好的多，何況此時官至八路軍的師參謀長，一般情況是不上最前線的，戰(zhàn)死的可能已經(jīng)很小了。他怎么會有貪生怕死的念頭？

　　第三種是對革命失去信心；但仔細分析，也有許多疑點，因為他既沒有投靠了國民黨部隊，又沒有投靠日本方面。以往一些人多是去別的隊伍，是尋找靠山，而他卻沒有。

　　所以，周昆出走的原因應該是這樣的。就在出事前不久，周昆曾到武漢參加全國參謀長聯(lián)席會議，在會議的間隙，他看到國民黨友軍的參謀長們飲酒作樂，嫖妓宿娼，揮金如土，生活極其糜爛。當時，周昆的心里并不是也想去追求那種生活，他曾經(jīng)為了革命出生入死，一心想為共產(chǎn)主義的思想而奮斗，可在這樣明顯 的對比下，他感到心理上極不平衡。

　　散會后，他返回山西的抗日根據(jù)地，去洪洞縣馬牧村八路軍總部匯報會議情況。在總部他直言不諱地把自己的想法提了出來。當時，朱、彭、左等首長，立即指出他這種想法很危險�？墒�，周昆認為那些話并不能改變他的觀點，他感到前途渺茫了。

　　于是，他便在半路上，將剛剛領到的軍費，取出3萬元包好并寫了幾句話，交給警衛(wèi)員，讓他盡快交回師部，而自稱自己還有事，等辦完就會歸隊，就這樣他帶著3萬元現(xiàn)鈔，永遠地離開了八路軍。