秀仁屢赴禮部試，皆不第，遂絕意進(jìn)取，游山西、陜西、四川等地，作官府幕僚。后主講于渭南(今陜西渭南縣)、成都(今四川成都市)等地書院，曾任成都芙蓉書院院長(zhǎng)。同治元年(1862年)兵連禍結(jié)，秀仁的父親和弟弟都死于兵禍。他傾家蕩產(chǎn)，唯帶殘書稚妾，寄命一舟，千山萬(wàn)水回福州故里，閉門著述。

秀仁著作主要有小說(shuō)《花月痕》，其《自序》曰：“見時(shí)事多可危，手無(wú)尺寸，言不見異，而骯臟抑郁之氣無(wú)所抒發(fā)，因遁為稗官小說(shuō)，托于兒女之私，名其書曰《花月痕》”。

《花月痕》亦題《花月痕全書》、《花月因緣》、《花月痕全傳》。作者自署“眠鶴主人編次”。情節(jié)委婉，為中國(guó)小說(shuō)史上的一部名著。自光緒十四年(1888年)閩雙笏廬的原刻本之后，各地爭(zhēng)相翻刻。1982年人民文學(xué)出版社又重新整理出版。此外，魏秀仁還有《石經(jīng)考》、《咄咄錄》、《蹇蹇錄》、《陔南山館文集》、《碧花凝唾集》等30多部書稿，但多未刊行。

《花月痕》第三卷中，有一名句，被后人時(shí)常提起，“最是凝眸無(wú)限意，似曾相逢在前生”。該句也曾出現(xiàn)在著名網(wǎng)絡(luò)小說(shuō)《回到明朝當(dāng)王爺》之中。

同治十三年(1874年)，魏秀仁逝世，年55歲。