陳嘉謨精研醫(yī)學(xué)，尤精本草，著有《醫(yī)學(xué)指南》和《本草蒙筌》2書。后者是陳嘉謨的重要著作，書名“蒙筌”，乃旨為童蒙而作。此書本是陳嘉謨用來(lái)教授弟子的本草講稿，共12卷，收載藥物742味，系統(tǒng)記述各類藥材的產(chǎn)地、采集、貯藏、真?zhèn)舞b別、加工炮制、配伍禁忌、七方十劑和服用方法等。并按草（上、中、下）、谷、菜、果、石、獸、禽、蟲、魚、人十部分類，其中447種藥材有附圖，具有消食功能的雞內(nèi)金、行氣止痛的青木香、止血散熱的血余炭等，均首見于此書。該書內(nèi)容不少是采用韻語(yǔ)對(duì)仗寫成，便于記誦。

《本草蒙筌》對(duì)后代中藥炮制的發(fā)展產(chǎn)生了較大影響，陳嘉謨對(duì)加入輔料炮制藥物所起的作用作了明確的論述，除了介紹古代及當(dāng)代經(jīng)驗(yàn)外，還常提出自己的獨(dú)創(chuàng)見解。一些寶貴經(jīng)驗(yàn)在李時(shí)珍的《本草綱目》、繆希雍的《炮炙大法》中均被全文輯入。中藥炮制是否得法，直接影響中藥的臨床療效，陳嘉謨第一次在理論上提出了炮制原則：“凡藥制造貴在適中，不及則功效難求，太過(guò)則氣味反失�！被鸷蚴侵兴幣谥祁I(lǐng)域中核心的基礎(chǔ)理論之一，他總結(jié)前人用火經(jīng)驗(yàn)，吸取當(dāng)?shù)嘏胝{(diào)用火方式，首倡“緊火”的運(yùn)用，緊火者，即持續(xù)猛烈之明火。 明代以前對(duì)中藥炮炙方法分類的資料比較缺乏。為了便于掌握運(yùn)用各種炮制方法，陳嘉謨把炮制方法作了概括性的歸納，提出了三類方法：“火制四：有煅、有炮、有炙、有炒之不同；水制三：或漬、或泡、或洗之弗等；水火共制造者，若蒸、若煮，而有二焉，余外制雖多端，總不離此二者�！边@就是中藥炮制方法分類的開始。

《本草蒙筌》對(duì)后代中醫(yī)中藥事業(yè)有很大影響，李時(shí)珍評(píng)價(jià)此書“名曰蒙筌，誠(chéng)稱其實(shí)”，陳嘉謨也因此書被稱之為古代著名藥物學(xué)家。