十九年春，世祖巡幸上都，皇太子從，丞相 阿合馬留守。妖僧高和尚、千戶(hù)王著等謀殺之，夜聚數(shù)百人為儀衛(wèi)，稱(chēng)太子，入健德門(mén)，直趨東宮，傳令啟關(guān)甚遽。九思適直宿宮中，命主者不得擅啟關(guān)。賊知不可紿，循垣趨南門(mén)外，擊殺丞相阿合馬、左丞郝禎。時(shí)變起倉(cāng)卒，且昏夜，眾莫知所為，九思審其詐，叱宿衛(wèi)士并力擊賊，盡獲之。賊之入也，矯太子命，征兵樞密副使 張易，易不加審，遽以兵與之。易既坐誅，而刑官?gòu)?fù)論以知情，將傳首四方。九思啟太子曰：“張易應(yīng)變不審，而授賊以兵，死復(fù)何辭！若坐以與謀，則過(guò)矣，請(qǐng)免傳首。”皇太子言于帝，遂從之。九思討賊時(shí)，右衛(wèi)指揮使顏進(jìn)在行，中流矢卒，怨家誣為賊黨，將籍其孥，九思力辯之，得不坐。

阿合馬既敗， 和禮霍孫拜右丞相，中書(shū)庶務(wù)更新，省部用人，多所推薦。是年冬，立詹事院，以九思為丞，遂舉名儒上黨 宋道、保定 劉因、曹南 夾谷之奇、東平 李謙，分任東宮官屬。二十二年，皇太子薨，朝議欲罷詹事院，九思抗言曰：“皇孫宗社人心所屬，詹事所以輔成道德者也，奈何罷之！”眾以為允。三十年，進(jìn)拜中書(shū)左丞，兼詹事丞。明年，世祖崩，成宗嗣位，改詹事院為徽政，以九思為副使。十一月，進(jìn)資德大夫、中書(shū)右丞。會(huì)修世祖、裕宗《實(shí)錄》，命九思兼領(lǐng)史事。大德二年，拜榮祿大夫、中書(shū)平章政事。五年，加大司徒。六年，進(jìn)階光祿大夫，薨，年六十一。子金界奴，光祿大夫、河南省右丞。