就在武繼軍躊躇滿志準(zhǔn)備大干一番之時(shí)，組織上看中了村里這個(gè)唯一具有高中文化、又有創(chuàng)業(yè)激情的年輕人，希望他棄船上岸當(dāng) 村主任。一番思慮后，武繼軍賣掉自己的船，1984年走馬上任村主任，兩年后擔(dān)任村黨支部書記。他的想法很簡單：是黨員，就要聽從黨召喚，為百姓排憂解難。1992年，武繼軍深入調(diào)研，發(fā)現(xiàn)武家嘴船運(yùn)只是圍繞黃砂打轉(zhuǎn)轉(zhuǎn)，一條路走到底，肯定會倒霉。他果斷開出兩劑“藥方”：調(diào)整船舶運(yùn)輸結(jié)構(gòu)和水運(yùn)組織結(jié)構(gòu)。市場上需要什么東西，他們就運(yùn)送什么東西。農(nóng)藥、化肥、糧食、原油、集裝箱等，只要船能裝運(yùn)的，他們都裝運(yùn)。一家一戶的分散型營運(yùn)格局向有組織、有計(jì)劃的集體性營運(yùn)格局轉(zhuǎn)變。他們瞄準(zhǔn) 上海大小洋山國際航運(yùn)深水港、南京 龍?zhí)渡钏�集裝箱運(yùn)輸樞紐港和 寧波深水港建設(shè)，先后開辟32條集裝箱內(nèi)支線。1993年，國家壓縮基本建設(shè)，黃砂價(jià)格一跌再跌，而武家嘴處變不驚，因?yàn)檫@里的造船水運(yùn)業(yè)已經(jīng)走上了集團(tuán)化運(yùn)作、專業(yè)化運(yùn)輸、集約化經(jīng)營的發(fā)展快車道。

在鞏固 長江集裝箱運(yùn)輸?shù)耐瑫r(shí)，武繼軍又把眼光投向更寬的領(lǐng)域——海洋運(yùn)輸，將“武氏艦隊(duì)”開出國門。2002年，武繼軍帶領(lǐng)剛剛成立的村黨總支一班人，分頭上船開展 思想政治工作，破除“ 小富即安”意識，激發(fā)船民繼續(xù)發(fā)揚(yáng)敢想敢干敢拼的精神，加大投入，走規(guī)模經(jīng)營之路。黨總支提出新發(fā)展戰(zhàn)略，決心實(shí)現(xiàn)三大轉(zhuǎn)變，即傳統(tǒng)水運(yùn)業(yè)向現(xiàn)代航運(yùn)物流業(yè)轉(zhuǎn)變，傳統(tǒng)造船業(yè)向現(xiàn)代制造業(yè)轉(zhuǎn)變，船老大向現(xiàn)代企業(yè)家轉(zhuǎn)變。這年，與長江航運(yùn)集團(tuán)合資組建的長武江海船務(wù)有限公司成立， 武家嘴村集體和船民占股40%，每年可為村集體增加收入350萬元以上。2003年，依托南鋼的大量外礦運(yùn)輸業(yè)務(wù)，武家嘴村、南鋼集團(tuán)共同組建股份制鑫武海運(yùn)集團(tuán)，當(dāng)年就為村集體創(chuàng)收300萬元。同年9月，一張蓋有“交通部內(nèi)河運(yùn)輸管理”和“沿海運(yùn)輸管理”兩個(gè)審批專用章的 水路運(yùn)輸許可證，徹底結(jié)束了武家嘴水運(yùn)的掛靠經(jīng)營時(shí)代。交通部授權(quán)一個(gè) 行政村經(jīng)營“國內(nèi)沿海及長江中下游普通貨船、長江干線集裝箱外貿(mào)內(nèi)支線班輪運(yùn)輸”，這在全國“絕無僅有”。

2010年獲“ 全國勞動模范”稱號。

第十屆、十一屆、十二屆全國人大代表。

2017年1月7日，當(dāng)選南京市高淳區(qū)人民代表大會常務(wù)委員會副主任 。