1．主持國家社科基金項目《政治轉(zhuǎn)型與本土意識：國民黨本土化的政治社會學(xué) 》。

2．主持中國博士后科學(xué)基金一等資助項目《國民黨本土化與“本土論述”研究》。

1．參與教育部哲學(xué)社科重大課題攻關(guān)項目《世界現(xiàn)代化不同模式比較研究》（錢乘旦、董正華教授主持）（已完成）。

2．參與國家社科基金重點項目《臺灣財團與兩岸關(guān)系》（殷存毅教授主持）。

3．參與孫冶方經(jīng)濟科學(xué)基金會重大研究項目“東亞社會轉(zhuǎn)型比較研究”（中國社科院政治學(xué)研究所）。

4．參與并執(zhí)筆完成國務(wù)院臺辦2007年委托調(diào)研課題《從比照外資到等同內(nèi)資》（巫永平教授主持）。

1．鄭振清著：《工會體系與國家發(fā)展——新加坡工業(yè)化的政治社會學(xué)》，北京：社會科學(xué)文獻出版社，2009。

2．合著（陳支平、詹石窗主編）《透視中國東南——文化經(jīng)濟的整合研究》（上、下兩卷），

廈門大學(xué)出版社，2004（該書榮獲第十四屆“中國圖書獎”）。

3．Andrew Lambert著，鄭振清、向靜譯：《風(fēng)帆時代海上戰(zhàn)爭》，上海人民出版社，2005。

4．Howard Wiarda著，董正華、昝濤、鄭振清譯：《非西方發(fā)展理論：全球趨勢與地方規(guī)范》，北京大學(xué)出版社，2006。

1．鄭振清：《選舉制度、社會分歧與臺灣政黨政治新形態(tài)的形成》，《臺灣研究》（中國社科院臺灣研究所主辦），2008年第3期。

2．巫永平、鄭振清：《政治轉(zhuǎn)型與政商關(guān)系：臺灣政商關(guān)系演變的政治經(jīng)濟學(xué)分析》，《經(jīng)濟社會體制比較》（中央編譯局主辦），2009年第2期。

3．鄭振清：《潛伏與反彈之后的范蘭欽——透視臺灣統(tǒng)獨爭議、省籍矛盾與選舉政治》，《文化縱橫》（孫冶方經(jīng)濟科學(xué)基金會主辦），2009年第2期。

4．鄭振清：《新興工業(yè)化中的混合型統(tǒng)合主義：考察新加坡工會運動與勞資政三方代表協(xié)商機制》，《中國非營利評論》（清華大學(xué)NGO研究所主辦），2009年，第4卷。

5．鄭振清：《“亞洲價值觀”、“自由發(fā)展觀”與東亞發(fā)展經(jīng)驗再探討》，載董正華主編《反思東亞現(xiàn)代化》（北京大學(xué)世界現(xiàn)代化不同模式比較叢書），江蘇人民出版社，2009。

6．鄭振清：《本土化、主體性與國民黨的轉(zhuǎn)型》，《清華臺灣研究》，2008年5月。

7．鄭振清：《“國家安全”與馬英九大陸政策決策模式調(diào)整》，《清華臺灣研究》，2008年6月。

8．劉震濤、鄭振清：《論兩岸關(guān)系和平發(fā)展的內(nèi)涵與框架》，《清華臺灣研究》，2008年11月。

9． Zheng Zhenqing, “Indigenized Forces and Identity in the Democratization”, paper presented at the 8th Annual Harvard East Asia Society Graduate Student Conference, Mass.: Harvard University East Asia Society , March, 2005.

10． Zheng Zhenqing, “Indigenization, Language Conflicts and the Emergence of Political Activism of the Presbyterian Church in Taiwan”, paper presented at the international conference on “Religion and Politics in Contemporary Asia” Conference, Singapore: Asia Research Institute, National University of Singapore, Jan. 2006.