乾隆三年（1738年），他帶頭捐俸，購(gòu)陸深舊宅東隅之地建立啟蒙書(shū)院，培育幼童。乾隆十年、十一年，翁藻任江蘇按府又曾駐上海。閑暇時(shí)常喜愛(ài)召集滬地諸生，講釋經(jīng)書(shū)，丹黃文藝。他有志于研究學(xué)問(wèn)，教書(shū)育人，積極籌措創(chuàng)建書(shū)院，不久調(diào)江西，計(jì)劃暫時(shí)作罷。

乾隆十二年（1747年），翁藻又調(diào)任江蘇，第二年與知縣王健共議，將康熙年間籍入官產(chǎn)的原西人潘國(guó)光寓所（明潘恩世春堂舊址）修繕一新，改建為講堂齋舍，名申江書(shū)院，為當(dāng)時(shí)上海一重要講學(xué)之所。翁藻延請(qǐng)兵部右侍郎銜凌如煥掌教，任第一任院長(zhǎng)，并聘淡起行等執(zhí)教，使讀書(shū)子弟除以舉為主外，兼學(xué)實(shí)用的學(xué)術(shù)。學(xué)院為朝廷培養(yǎng)了一批有用之材，如文史學(xué)家陸錫熊，乾嘉江南七子中的趙文哲、黃文蓮等。