1940年7月，孫宗暄跟隨八路軍344旅進(jìn)軍淮上，開辟淮上抗日根據(jù)地，建立懷遠(yuǎn)縣抗日民主政府，孫任縣政府秘書，后又轉(zhuǎn)任軍事科科長、一區(qū)區(qū)長。孫宗暄任軍事科長時曾深入縣城日占區(qū)了解情報，八路軍689團根據(jù)孫的情報一舉端掉了城西日軍據(jù)點，俘日軍12人，繳機槍一挺。

皖南事變后，新四軍主力部隊撤離淮上，移轉(zhuǎn)至皖東北堅持抗戰(zhàn)，孫宗暄奉命留下掩護傷病員，照顧不便轉(zhuǎn)移的婦女干部和小孩。當(dāng)時每天都有一二十名掉隊人員找他聯(lián)絡(luò)，他及時將他們組織起來，轉(zhuǎn)移出去，他家成為地下聯(lián)絡(luò)站。李豐平、董啟翔等領(lǐng)導(dǎo)干部的孩子都是由他妥為安置并負(fù)擔(dān)其寄養(yǎng)費。孫宗暄完成黨交給的任務(wù)后，于1942年4月轉(zhuǎn)移到皖東北根據(jù)地。

1944年8月15日，孫宗暄隨新四軍四師在淮北半城誓師西征，收復(fù)津浦路西抗日根據(jù)地。宿懷縣成立后，孫宗暄被委派為淝河區(qū)區(qū)長。1945年8月15日，日本投降，國民黨掠奪勝利果實，通過土匪中隊長侯金濤、侯金橋弟兄向?qū)O說降，遭到孫宗暄的怒斥。8月底，侯匪偷襲區(qū)政府，孫宗暄頑強抵抗，不幸頭部中彈，壯烈犧牲，時年28歲。