建武元年，為征虜將軍，領(lǐng)石頭戍事，封江夏郡王。仍出為持節(jié)、都督郢司二州軍事、西中郎將、郢州刺史。永泰元年，還為前將軍，領(lǐng)石頭戍事。未拜，東昏即位，進(jìn)號(hào)鎮(zhèn)軍將軍。永元元年，又進(jìn)車騎將軍，代晉安王蕭寶義為使持節(jié)、都督南徐兗二州軍事、南徐兗二州刺史，將軍如故。

寶玄娶尚書令徐孝嗣女為妃，孝嗣被誅離絕，少帝送少姬二人與之，寶玄恨望，密有異計(jì)。明年，崔慧景舉兵，還至廣陵，遣使奉寶玄為主。寶玄斬其使，因是發(fā)將吏防城。帝遣馬軍主戚平、外監(jiān)黃林夫助鎮(zhèn)京口。慧景將渡江，寶玄密與相應(yīng)，殺司馬孔矜、典簽呂承緒及平、林夫，開門納慧景。使長史沈佚之、諮議柳憕分部軍眾，乘八扛輿，手執(zhí)絳麾幡，隨慧景至京師，住東城，百姓多往投集。慧景敗，收得朝野投寶玄及慧景軍名，帝令燒之，曰：“江夏尚爾，豈復(fù)可罪余人�！睂毿�逃奔數(shù)日乃出。帝召入后堂，以步鄣裹之，令群小數(shù)十人鳴鼓角馳繞其外，遣人謂寶玄曰：“汝近圍我亦如此�！鄙偃漳藲⒅�。