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  • 徐筱杰

    徐筱杰

    徐筱杰,浙江溫州人。1960年畢業(yè)于北京大學(xué)化學(xué)系,曾在美國(guó)紐約州立大學(xué)石溪分校,加州大學(xué)戴維斯分校,喬治城大學(xué)醫(yī)學(xué)中心從事研究工作。現(xiàn)任北京大學(xué)化學(xué)與分子工程學(xué)院教授,博士生導(dǎo)師,北京大學(xué)中藥現(xiàn)代研究中心主任,中國(guó)化學(xué)會(huì)計(jì)算化學(xué)委員會(huì)副主任。已發(fā)表論文200余篇,他人引用1000余次,出版多本專著,申請(qǐng)多項(xiàng)專利,曾獲國(guó)家自然科學(xué)基金二等獎(jiǎng)、三等獎(jiǎng)各一項(xiàng),國(guó)家教育部科技進(jìn)步一等獎(jiǎng)、二等獎(jiǎng)各一項(xiàng)。目前承擔(dān)973及國(guó)家自然科學(xué)基金重大項(xiàng)目。主要研究領(lǐng)域包括:藥物設(shè)計(jì)方法及應(yīng)用、中醫(yī)藥信息系統(tǒng)、超分子及介觀體系的計(jì)算機(jī)模擬和基于中藥資源的新藥研制。

    研究項(xiàng)目

    20世紀(jì)80年代初,徐筱杰教授開(kāi)始從事蛋白質(zhì)分子設(shè)計(jì)及計(jì)算機(jī) 輔助藥物分子設(shè)計(jì)研究,在分子對(duì)接,結(jié)合自由能計(jì)算,三維構(gòu)效關(guān)系,ADME預(yù)測(cè)等方面進(jìn)行了系統(tǒng)的研究,發(fā)展及改進(jìn)了一些計(jì)算方法。近年來(lái)主要從事中藥現(xiàn)代化研究,開(kāi)發(fā)了包括中藥方劑,中藥植物及中藥成分三維結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)的中藥信息化系統(tǒng),開(kāi)展了基于中藥信息系統(tǒng)的虛擬篩選,中藥成分在化學(xué)空間、配體-靶標(biāo)空間的分布,基于生物網(wǎng)絡(luò)的多靶向篩選,中藥活性成分的篩選、分離、鑒定一體化技術(shù)等方面的研究。

    教學(xué):主講研究生化學(xué)信息學(xué)課程

    科研成果

    1.藥物設(shè)計(jì)方法及應(yīng)用:

    著重發(fā)展分子對(duì)接,結(jié)合自由能及溶劑化能的計(jì)算,二維及三維構(gòu)效關(guān)系,ADME預(yù)測(cè)及有關(guān)并行計(jì)算等相關(guān)方法及技術(shù)。 中華化學(xué)競(jìng)賽網(wǎng)

    2.中醫(yī)藥信息系統(tǒng):

    徐筱杰

    構(gòu)建及完善包括中藥方劑,藥用植物及中藥有效成分的三維結(jié)構(gòu)的醫(yī)藥信息系統(tǒng)及相關(guān)應(yīng)用軟件。

    3.超分子及介觀體系的計(jì)算機(jī)模擬:

    利用分子動(dòng)力學(xué)及介觀動(dòng)力學(xué)研究蛋白質(zhì)、核酸等生物大分子及有機(jī)分子的聚集狀態(tài),高分子體系的聚集狀態(tài),介觀形貌及相分離。

    4.基于中藥資源的新藥研制:

    已建成包括藥物設(shè)計(jì),靶酶制備及活性測(cè)定,活性追蹤中藥有效成分的分離純化,利用分子烙印及藥物抗體方法直接從中藥體系中提取有效成分的工作平臺(tái)。目前正開(kāi)展抗丙肝及抗腫瘤藥物方面的研究。

    課題:目前承擔(dān)973及國(guó)家自然科學(xué)基金重大項(xiàng)目

    主要論著

    1. Hou TJ,Guo SL,Xu XJ; Predictions of binding of a diverse set of molecular dynamics and combination of molecular Dynamics and continun solvent models. J. Phys. Chem. B 106(21): 5527-5535,2002.

    2. Hou TJ, Zhang W,Xu XJ; Binding affinities for a series o-f selective inhibitors of gelatinase-A using molecular dynamics With a linear interaction energy approach.J. Phys. Chem. B 105(22):5304-5315,2001

    3. Hou TJ, Xu XJ; A new molecular simulation software package u2013 Peking University Drug Design System(PKUDDS) for Structure based Drug Design. J. Mol. Graph. Mod. 19(5): 455-465, 2001.

    4. Hou TJ, An Y, Ru BG, Bi RC, Xu XJ; Cysteine independent polymerization of metallothioneins in Solution and in Crystal. Protein Science, 9(12), 2302-2312, 2000.

    5. Xie JC, Zhu LL, Xu XJ; Affinitive Separation and On-line identification of antitumor components from Peganum Nigillastrum by coupling a chromatographic column of target analogue imprinted polymer with mass spectrometry. Anal. Chem. 74(10): 2352-2362, 2002.

    6. Qiao XB, Hou TJ, Zhang W, Guo SL, Xu XJ; A 3D Structure Database of Components from Chinese Traditional Medicinal Herbs. J. Chem. Info. Comp. Sci. , 42(3):481-495,2002.

    7. Xie JC, Zhu LL, Xu XJ; Direct Extraction of Specific Pharmacophoric Flavonuids from Gingko leaves using a molecularly imprinted polymer for quercetin. J. Chromatogr. A 934(1-2): 1-11, 2001.

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