出身醫(yī)學世家，年少好學，鉆研勤苦，師從河底名醫(yī)秦鵬，廣泛涉獵醫(yī)家要典，頗得其師真?zhèn)�。青年時懸壺濟世，針灸蒼生，尤精于創(chuàng)傷外科，聲譽聞名遐邇，四方咸稱其醫(yī)德。民國27年（1938）參加抗日工作，為解民生疾苦，曾幫助各區(qū)開藥鋪，并把自家藥鋪捐出。民國34年（1945），被選為晉冀魯豫邊區(qū)參議員。曾創(chuàng)建縣勝利醫(yī)院，是壺關(guān)縣人民醫(yī)院的創(chuàng)始人之一。1950年，秦祥云選為山西省各界人民會議代表，后被選為壺關(guān)縣人大常委會副主任。
秦祥云一生對革命事業(yè)忠貞不渝，解放縣城時，曾親臨前線隨軍服務，救死扶傷，頗得好評，抗美援朝時期響應國家號召，捐巨資購買飛機大炮，用以支援前線，保家衛(wèi)國。1953年曾參加赴朝慰問團慰問志愿軍將士。秦祥云為人謙恭有禮，和藹平易，加之醫(yī)道醫(yī)德俱佳，在境內(nèi)有口皆碑。