1919年8月出生，畢業(yè)于協(xié)和職業(yè)學(xué)校。1944年參加革命斗爭，曾參加學(xué)生抗日救亡活動(dòng)和閩中沿海地區(qū)的抗日斗爭�？谷諔�(zhàn)爭勝利后，任中共平潭工委委員，參與領(lǐng)導(dǎo)平潭縣的革命游擊戰(zhàn)爭，1947年夏調(diào)到中共閩浙贛區(qū)黨委城工部閩中工委工作，1948年2月任中共福長平（福清、長樂、平潭）中心縣委城工部學(xué)委委員，不久調(diào)任中心縣委委員，主持福清縣城工部的工作，指揮城工部所屬武裝隊(duì)伍開展對(duì)敵斗爭。

1949年4月前往中共閩中地委匯報(bào)工作時(shí)，因“城工部事件”受到牽連審查，于4月10日在福清縣北區(qū)西寧山上蒙冤罹難。當(dāng)時(shí)，審查組負(fù)責(zé)人是其協(xié)和職業(yè)學(xué)校的同學(xué)，不相信他是特務(wù)，曾多次暗示他逃跑。楊清琪為了避免引起更大誤會(huì)造成更多悲劇，婉言謝絕了同學(xué)的好意，決心以犧牲自己保護(hù)更多同志。臨刑前，他選擇以活埋告別人生，從容地站在自己挖好的坑穴前，脫下身上僅有的一件單衣，又從褲袋里取出一支鋼筆交給執(zhí)刑人，留下遺言：“你們很困難，把我的衣服拿去吧！我死了不穿衣服不要緊，只要以后能弄清是非，把我當(dāng)烈士就行了！”說完，高唱著《國際歌》躺進(jìn)墓坑，安詳?shù)爻惺苤鴣y石雜土從身上填壓下來。在場(chǎng)的執(zhí)刑人員無不悲淚橫流，感慨萬千，莊重地在烈士的犧牲地壘出了墓地。

1956年黨中央在重新審理“城工部”事件后為被錯(cuò)殺的同志平反，福建省人民政府追認(rèn)楊清琪為革命烈士。