他的曾祖父薛梅苑，是清初名醫(yī)，乾隆年間，在他80多歲時馳赴易州，治愈了乾隆帝十“額附”的病。父親薛銀槎也是國手。出生在這樣一個歧黃世家的薛寶田，自然“能世其家，于歧黃諸書，無不得其奧秘”。道光年間，他以明經(jīng)身份“任上元縣教諭”，46歲時改任鹺尹（鹽場小吏），分發(fā)浙江候補(bǔ)。在浙江期間，由于上層人物知道他精于醫(yī)術(shù)，都請他治病，由此醫(yī)名大著。后來便派他主持“官醫(yī)局”。在官醫(yī)局，他不僅是“奉委主其事”的官，而且更是一名出色的醫(yī)生。他“切脈既真，臨診亦夥”，既精于醫(yī)理，又有豐富的臨訂經(jīng)驗，因而經(jīng)他診治的病人“奏效速于置郵”；求他醫(yī)治的人“踵相接”。由此名滿杭州，“大府寅寮咸器重之”。

1880年，慈禧太后生一場大病，“太醫(yī)罔效”，于是向各省頻發(fā)征召名醫(yī)的上諭。浙江巡撫譚鍾齡向朝廷保薦了薛寶田。7月底，他抵達(dá)北京，經(jīng)過內(nèi)務(wù)府大臣會同太醫(yī)院堂官察看面試，認(rèn)為他“醫(yī)學(xué)脈理，均極精通”，至8月初，替慈禧切脈治病。他所立藥方，先由內(nèi)務(wù)府、太醫(yī)院審閱，再用黃箋折子謄清，送慈禧過目。同時，內(nèi)務(wù)府將處方內(nèi)所開藥物，從《本草》中找出，一一報送，慈禧認(rèn)可后，始行配齊煎制。第二天，慈禧發(fā)下懿旨，稱贊“浙江巡撫譚所薦醫(yī)生看脈立方均尚妥”。他在清宮“當(dāng)值”44天，給慈禧切脈15次，立藥方20多貼。慈禧的病漸漸痊愈了。清宮《御醫(yī)載錄》記載了他受到的“禮遇之榮、宴賜之寵”，“系天下名醫(yī)少有之也”。但是薛寶田并沒有為榮譽(yù)所陶醉。他認(rèn)為“醫(yī)生切忌虛榮之心，浮夸之弊”，所以當(dāng)返漸途經(jīng)天津時，他以年老多病婉辭了直隸總督李鴻章對他的邀請。他的才藝是多方面的。在學(xué)者俞樾認(rèn)為他“論醫(yī)、論詩、論經(jīng)史疑義，悉中肯綮”。

俞樾為《北行日記》題序：光緒六年，慈禧皇太后以宵旰勤勞，有饒癯舜霉之疾，詔征天下通知醫(yī)術(shù)者，咸詣闕下。而浙江巡撫譚公，以君與淳安教諭仲君應(yīng)詔書。君乃偕仲君于七月己卯首涂，逮十月丙辰還浙江，首尾九十有八日。其中間于八月壬寅，恭詣長春宮起居。逮九月甲申，奉懿旨賜歸，首尾四十有三日。此四十三日中，辦色而入，日旰而歸，在他人處，此真所謂自朝至于日中昃，不遑暇食者矣。豈廣廈細(xì)旃之上，可以從容偃息，仰屋梁而著書哉？乃讀君《北行日記》一卷，又何其斐然而成章也！夫文章家排日紀(jì)行，始于東漢馬第伯《封禪儀記》，而所記止登岱一事。其后唐李習(xí)之《南征記》，宋歐陽永叔《于役志》，所歷較遠(yuǎn)，所記較詳，然不過山程水驛間，聊志游跡而已。君之此記，則宮廷之壯麗，恩禮之優(yōu)渥，與所交京師士大夫人物之瑰奇，無不備哉。而又論醫(yī)、論詩、論經(jīng)史疑義，悉中肯綮。至其附載諸詩，或紀(jì)游，或詠古，有他人支頤搖膝竟日不能得者，君以供奉之暇，矢口而成之。君之才，自不可及；而君之精醫(yī)，亦可見矣。不然，方惴惴焉，切脈處方懼不得當(dāng)，而能以余事作詩人哉？巡撫譚公以君應(yīng)詔，誠知人，而君異日必以名醫(yī)入國史方伎傳。此一篇，亦必為藝文志所著錄無疑矣。

他的主要著作有《癥治管窺》、《北行日記》、《醫(yī)學(xué)心悟》和《蓮因集》等。