個人簡介
曹志偉博士,畢業(yè)于新加坡國立大學(xué)計算科學(xué)系,計算生物學(xué)/生物信息專業(yè),F(xiàn)任上海生物信息技術(shù)研究中心研究員,功能基因研究組課題組長 。
研究方向
課題組主要著眼于主要著眼于功能基因、重要功能蛋白質(zhì)等,采用生物信息學(xué)、計算生物學(xué)以及分子模擬等方法對中藥作用機(jī)理、抗體抗原識別機(jī)制、蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)、功能預(yù)測、蛋白質(zhì)組學(xué)以及比較基因組學(xué)等方面進(jìn)行研究。已承擔(dān)多項973、863和自然科學(xué)基金資助的國家項目以及上海市項目,部分項目已順利結(jié)題。
部分研究成果發(fā)表于Nature reviews drug discovery, Pharmacological Reviews, PNAS, Molecular Cell Proteomics, Nucleic acids research, Clinical Pharmacology & Therapeutics,Briefings in Bioinformatics, Drug Discovery Today, Plos One, BMC bioinformatics等雜志上。
中藥信息學(xué)方面,率先把計算機(jī)輔助藥物設(shè)計方法引入中藥機(jī)理研究,先后建成了5個整合型中藥數(shù)據(jù)庫,利用計算生物學(xué)模擬配對,研制了一整套的“多成分、多靶點”的中藥機(jī)理預(yù)測模擬系統(tǒng)。平臺已為國內(nèi)外多家中藥研究機(jī)構(gòu)提供了高水平合作科研和服務(wù)。
免疫信息學(xué)方面,圍繞分子免疫的關(guān)鍵問題進(jìn)行,建立了相應(yīng)的抗體抗原計算平臺,并提供網(wǎng)上免費服務(wù)。主要利用分子模擬方法研究抗體抗原的相互作用規(guī)律. 曾經(jīng)發(fā)展應(yīng)用了一種新型的氫鍵勢能函數(shù)先后模擬了核酸和反義藥物的相互作用,蛋白質(zhì)的集合運動,以及蛋白突變與藥物抗性行為,為進(jìn)一步揭示蛋白的結(jié)構(gòu)和功能關(guān)系奠定了基礎(chǔ)。相關(guān)工作陸續(xù)發(fā)表在Drug discovery today、Nucleic Acid Research等。利用大規(guī)模統(tǒng)計方法挖掘了蛋白抗原與抗體作用界面的特異性規(guī)律。