幼入私塾，中學(xué)入日本皇家學(xué)習(xí)院就讀。二十一歲時與周竹君結(jié)婚�；楹笤儇�(fù)笈東瀛，入東京帝國大學(xué)理科植物學(xué)系。學(xué)成返國，居廈門（時林家因割臺內(nèi)渡居于鼓浪嶼），曾任慈勤女子中學(xué)校長，時年三十一。十年后辭職，舉家遷往上海。光復(fù)后返臺，四十一年四月任臺灣省文獻(xiàn)委員會委員；四十九年三月晉升第四任副主委，迄五十四年七月十六日退休。他熱心教育文化事業(yè)，五十一年八月創(chuàng)辦南山工業(yè)職業(yè)學(xué)校（今南山高中）于中和，任董事長；又在板橋創(chuàng)設(shè)大觀幼兒園，推廣社會教育。復(fù)專注于《臺灣風(fēng)物》雜志之發(fā)行。六十五年由乃叔林柏壽出資，籌組「林本源中華文化教育基金會」，任董事長，對有關(guān)臺灣研究之贊助不遺余力。七十八年，夫人周竹君女士去世。八十五年八月，臺灣風(fēng)物社假臺北聯(lián)誼會慶祝其百歲壽誕。不幸次月即因肺炎長逝。遺三子四女，均學(xué)有專長，各有成就。其早年著作有《植物學(xué)大觀》（譯，廈門慈勤女子高級中學(xué)出版）、《生物學(xué)概觀》（1930）、《細(xì)胞學(xué)總論》（譯，1941商務(wù)）；來臺后又著有《臺灣省通志稿．土地志》「生物篇」（與陳兼善合撰）共三冊，《臺灣省通志．土地志》「植物篇」（與張慶恩合撰）五冊，及有關(guān)臺灣之植物之論文多篇。