民國十三年（1924年）考入上海郵政管理局。歷任上海郵務(wù)工會常務(wù)委員，上海市總工會執(zhí)行委員兼秘書長，全國郵務(wù)總工會及中國勞動協(xié)會理事，抗日戰(zhàn)爭爆發(fā)后，民國27年（1938年）在武漢籌組中國工人抗戰(zhàn)總會。后任中國勞動協(xié)會常務(wù)理事兼書記長，全國郵務(wù)總工會常務(wù)委員，民國三十六年（1947年）當(dāng)選為行憲國民大會代表。次年膺選第一次國民大會主席團(tuán)成員，全國總工會秘書年任“自由中國勞工同盟”常務(wù)理事兼秘書長，“行政院設(shè)計委員會”委員，“交通部設(shè)計委員會”委員。上海解放前夕，水祥云隨陸京士逃往臺灣，繼續(xù)進(jìn)行反共和分裂中國工人階級的活動。1952年任“全國總工會”常務(wù)理事兼秘書長。1973年任“郵務(wù)工會全國聯(lián)合會”理事長，后任“全國總工會”常務(wù)理事，“國民大會”代表�！肮鈴�(fù)大陸設(shè)計研究委員會”委員，“全國職業(yè)訓(xùn)練金監(jiān)理委員會”副主任委員。“閩臺地區(qū)勞工保險局監(jiān)理委員會”委員，工業(yè)安全衛(wèi)生協(xié)會常務(wù)理事。

民國十三年(公元1924年)考入上海郵局為郵務(wù)生。同年加入國民黨。

民國十六年(公元1927年)“四一二”反革命政變后，國民黨在郵局實(shí)行清黨，篡奪了上海郵務(wù)工會的領(lǐng)導(dǎo)權(quán)。先后加入陸京士在郵局組織的精神團(tuán)和杜月笙的恒社，依靠國民黨和幫會勢力來控制工會。民國二十年(公元1931年)，水祥云為上海郵務(wù)工會第九屆常務(wù)委員兼組織部長。

民國二十二年(公元1933年)，上海郵務(wù)工會選舉工會代表時，水祥云操縱選舉，組織打手毆打要求公開選票票數(shù)的郵工。

民國二十一年(公元1932年)，全國郵務(wù)總工會成立后，水祥云于民國二十五年(公元1936年)為候補(bǔ)執(zhí)行委員，民國三十年(公元1941年)為常務(wù)執(zhí)行委員、副秘書長、組織部長。民國三十六年(公元1947年)，全國郵務(wù)總工會改稱全國郵務(wù)工會聯(lián)合會，水祥云為常務(wù)理事、組織處長。水祥云以上海郵務(wù)工會為基礎(chǔ)，進(jìn)入上海市總工會、全國郵務(wù)總工會、中國勞動協(xié)會、中華民國全國總工會和國民黨中央社會部勞工運(yùn)動委員會任要職，成為國民黨陳立夫系統(tǒng)工會的核心人物。

民國三十五年(公元1946年)，重慶發(fā)生較場口事件時，水祥云開始表示支持朱學(xué)范。在國民黨當(dāng)局加緊迫害朱學(xué)范時，水祥云就倒向陸京士。民國三十四年(公元1945年)9月，朱學(xué)范派水祥云以中國勞動協(xié)會上海辦事處主任的名義進(jìn)行重建上海市總工會的工作。朱學(xué)范接受周恩來的意見，戰(zhàn)后的上海市總工會將成為與共產(chǎn)黨和進(jìn)步力量的聯(lián)合組織。水祥云違背了朱學(xué)范的意圖，卻執(zhí)行了陸京士的嚴(yán)密控制工會領(lǐng)導(dǎo)權(quán)，打擊進(jìn)步工會，壓制工人斗爭的方針。

民國三十四年(公元1945年)10月，水祥云為上海市總工會整理委員會委員兼秘書長。民國三十五年(公元1946年)6月，為上海工人福利委員會委員。同年9月，水祥云為上海市總工會第五屆理事長。

民國三十六年(公元1947年)2月9日，在破壞“愛用國貨，抵制美貨”的愛國運(yùn)動中，水祥云秉承國民黨市黨部主任方治和上海工人福利委員會主任陸京士的指示，參與策劃，調(diào)遣護(hù)工隊，于民國三十六年(公元1947年)2月9日制造了血腥暴行，當(dāng)場打死永安公司職員梁仁達(dá)。在“二九慘案”發(fā)生后，激起上海各界人民的憤怒。中共上海地下工委以上海工人協(xié)會名義發(fā)表《為愛用國貨慘案宣言——揭發(fā)特務(wù)暴行真相》。水祥云為了欺騙輿論，急忙以上海市總工會名義發(fā)表聲明，把護(hù)工隊沖進(jìn)會場說成是“被邀參加”，把行兇打人的中統(tǒng)特務(wù)分子和護(hù)工隊員說成是“真正善良工人”，把慘案的制造者和兇手說成是“被害者”，把被他們打死的梁仁達(dá)說成是“為反對大會而犧牲”等等，竭力歪曲事實(shí)，顛倒黑白。

民國三十六年全市工人興起爭取和平、民主、保障人權(quán)、解凍生活費(fèi)指數(shù)的斗爭浪潮。水祥云以紀(jì)念五一勞動節(jié)為名，召開工人大會，企圖掀起一個上海工人反共高潮。當(dāng)他發(fā)表演講時，立即被工人們的“立刻解凍生活費(fèi)指數(shù)”等呼喊聲所壓倒，他的陰謀遭到徹底失敗。

民國三十六年(公元1947年)，水祥云被國民黨補(bǔ)選為國大代表。民國三十七年(公元1948年)4月，國民黨成立“全國總工會”，水祥云為理事兼秘書長。8月，上海市總工會改選，水祥云為常務(wù)監(jiān)事，后為常務(wù)委員。

上海解放前夕，水祥云隨陸京士逃往臺灣，繼續(xù)進(jìn)行反共和分裂中國工人階級的活動。他著有《水氏由來與曾邱兩姓聯(lián)宗關(guān)系考》。