他在洪洞多有惠政，其間曾用石塊修筑渡槽，灌溉農(nóng)田100余頃。后入朝拜為監(jiān)察御史，出巡山東。當(dāng)時(shí)太監(jiān)魏忠賢專擅朝政，勢(shì)傾天下，巡撫、巡按爭(zhēng)相為魏忠賢興建生祠，獻(xiàn)媚取寵。馬鳴世不為所動(dòng)。有人勸他和眾隨俗，不要違反眾意去捋老虎的胡須，他始終不聽。魏忠賢得知此事后，遂假借詔命，將其革職。崇禎元年（1628），朝廷平反魏黨冤案，詔令其官?gòu)?fù)原職，不久升任順天府（治今北京市）丞、通政司通政。崇禎五年（1632）正月，面對(duì)農(nóng)民起義軍蓬勃發(fā)展、銳不可擋的形勢(shì)，馬鳴世上書說：“三秦為海內(nèi)上游，延安、慶陽(yáng)為關(guān)中屏翰，榆林為延、慶藩籬。無榆林必?zé)o延、慶，無延、慶必?zé)o關(guān)中矣�！彼�力主增兵措餉，堅(jiān)決鎮(zhèn)壓，并提醒朝廷不要簡(jiǎn)單地把“流賊”（指農(nóng)民軍）視為“饑民”，否則“燎原”之勢(shì)既成，就“沒可撲滅”了。后官至都察院副都御史及戶部侍郎。崇禎十六年（1643）十月，李自成農(nóng)民軍西入潼關(guān)，占領(lǐng)了全陜，當(dāng)時(shí)馬鳴世居家，因不肯歸順農(nóng)民軍而死。