崇禎十一年（1638），清兵攻下山東各州縣，昌祚年12歲，被擄往北方。后隸屬于漢軍鑲白旗，官至宗人府啟心郎，順治元年（1644），隨清兵入關(guān)，十八年（1661）由工部侍郎任浙江巡撫。主要政績(jī)有平盜賊、減賦稅、免欠餉、撫難民、除兵役等12項(xiàng)，均載入史冊(cè)，被稱作名宦。在任期間，大旱不雨，災(zāi)情嚴(yán)重，他勸說(shuō)富戶獻(xiàn)糧，請(qǐng)求朝廷賑濟(jì)，自己也得捐出俸祿救濟(jì)災(zāi)民。由于他的積極操勞，得以全活的民眾達(dá)數(shù)10萬(wàn)人。3年后，遷江西總督，未到任。再遷兵部尚書，督燕、魯、豫3省。此時(shí)輔政大臣鰲拜肆意圈地，令昌祚及尚書蘇納海、巡撫王登聯(lián)理其事，昌祚毅然抗奏，力陳其不可。鰲拜以忤己意，大怒，將昌祚及其子與王登聯(lián)立絞�？滴跤H政，鰲拜伏罪，知昌祚冤，詔復(fù)原官，賜祭葬，子朱紱以蔭入監(jiān)，官大理寺卿。