2006年12月21日，土庫曼斯坦總統(tǒng) 尼亞佐夫因心臟病突發(fā)逝世。土庫曼斯坦國家安全委員會當(dāng)天決定，在新總統(tǒng)選舉產(chǎn)生之前，現(xiàn)任副總理、衛(wèi)生部長 別爾德穆罕默多夫臨時代行土庫曼斯坦總統(tǒng)和武裝力量最高統(tǒng)帥職權(quán)。12月26日，土最高權(quán)力代表機構(gòu)——人民委員會召開特別會議，決定于2007年2月11日舉行總統(tǒng)大選。

2007年2月11日，土庫曼斯坦總統(tǒng)選舉正式拉開帷幕，共有6位候選人參加，阿塔吉科夫是其中之一。這是土歷史上首次有多位候選人進行角逐的總統(tǒng)選舉。2月14日，土庫曼斯坦中央選舉委員會主席穆拉特·卡雷耶夫宣布，代總統(tǒng)別爾德穆罕默多夫在11日舉行的總統(tǒng)大選中以89.23%的得票率勝出，當(dāng)選土庫曼斯坦總統(tǒng)。