清光緒年間季科秀才。清末詔安興辦官立丹詔高等小學(xué)堂，謝北垣被推選為學(xué)堂膏伙董事。后為了給詔邑修志存史，他舉薦并協(xié)助吳夢(mèng)沂纂修《詔安縣志》和《詔安乙丑屠城記》。閩省督軍李厚基賞識(shí)其學(xué)問(wèn)文章，拔擢為閩軍總司令秘書兼監(jiān)印官。任職期間廉潔自守，頗有政聲。后因傾向南方革命政府，被撤職回鄉(xiāng)。后受張貞委托，和林學(xué)淵、秦望山等組建國(guó)民黨詔安縣黨部，并籌建詔安中山公園。民國(guó)14年(1925年)國(guó)民黨左派余佩皋來(lái)詔開展國(guó)民革命工作，謝北垣積極協(xié)助、支持，并一度出任縣農(nóng)會(huì)秘書、縣教育改造委員會(huì)委員。后又被推舉進(jìn)入詔安公局主持局務(wù)，力倡疏浚東溪和修建通濟(jì)橋，為發(fā)展詔安公益和慈善事業(yè)奔走。