薛索兒，薛安都從子。前廢帝景和中，為前軍將軍，直閣，從誅諸公，封武安縣男。太宗明皇帝（劉彧）即位，以為左將軍。薛安都將為逆亂，遣密信報(bào)之，又遣數(shù)百人至瓜步迎接。時(shí)右衛(wèi)將軍柳光世，亦與薛安都通謀。泰始二年（466年），二人俱自省。薛安都信催令速去，攜薛安都諸子及家累，席卷北奔。

青州刺史沈文秀、冀州刺史崔道固并反。沈文秀遣劉彌之、張靈慶、崔僧琁三軍，崔道固遣子崔景征、傅靈越領(lǐng)眾，并應(yīng)薛安都。劉彌之等南出下邳，傅靈越自泰山道向彭城。時(shí)濟(jì)陰太守申據(jù)睢陵城起義，薛索兒率傅靈越等攻之。薛安都使女婿裴祖隆守下邳城，劉彌之等至下邳，改計(jì)歸順，因進(jìn)軍攻裴祖隆，崔僧琁不同，率所領(lǐng)歸薛安都。薛索兒聞劉彌之有異志，舍睢陵馳赴下邳。劉彌之等未戰(zhàn)潰散，并為薛索兒所執(zhí)，見殺。

時(shí)太宗以申令孫為徐州刺史，代薛安都。申令孫進(jìn)據(jù)淮陽，密有反志，遣人告薛索兒曰：欲相從順，而家口在都。可進(jìn)軍見攻，若戰(zhàn)敗被執(zhí)，家人可得免禍。薛索兒乃遣傅靈越向淮陽，申令孫出城，為相拒之形，既而奔散，北投薛索兒。薛索兒攻申闡，久不下；使申令孫入睢陵說申闡令降。申闡既降，薛索兒執(zhí)申闡及申令孫，并殺之。

薛索兒將馬步萬馀人自睢陵渡淮河，進(jìn)逼青冀二州刺史張永營(yíng)地。軍糧不給，掠奔百姓谷食。宋明帝遣齊王蕭道成率前將軍張永、寧朔將軍垣恭祖、王寬、員外散騎侍郎張寘震、蕭順之、龍?bào)J將軍張季和、黃文玉等諸軍北討。其年五月，宋軍次平原，薛索兒等率馬步五千，列陣拒戰(zhàn)，擊破之。薛索兒又虜掠民谷，固守石梁，齊王蕭道成又率鎮(zhèn)北參軍趙曇之、呂湛之擊之。薛索兒軍無資實(shí)，所資野掠，既見攻逼，無以自守，于是奔散；又追破之于葛家白鵠。薛索兒走向樂平縣界，為申令孫之子申孝叔所斬。薛索兒之死也，薛安都使柳光世守下邳，至是亦率所領(lǐng)歸降。